Biologia computacional

La biologia computacional és una disciplina que es basa en l'ús d'eines informàtiques aplicades al camp de la biologia. En aquesta s'hi engloba l'anàlisi i seqüenciació del genoma, la modelització de biomolècules, els estudis d'evolució i creació d'arbres filogenètics, etc.

Alguns dels camps d'estudi relacionats amb la biologia computacional són:

• Bioinformàtica , és l'aplicació d'algoritmes i tècniques estadístiques a la informació biològica que típicament consisteix en grans seqüències d'ADN, ARN, o proteïnes. Exemples de tècniques específiques inclouen alineament de seqüències, que és usat per a la recerca de seqüències en bases de dades i per a la seva comparació amb seqüències homòlogues; recerca de gens, i predicció de la expressió gènica. El terme biologia computacional s'utilitza de vegades com a sinònim de Bioinformàtica .
• Biomodelatge computacional , És un camp de biocibernètica que cerca construir models computacionals de sistemes biològics
• Bioinformàtica estructural
• Genòmica computacional
• Modelatge molecular
• Sistemes biològics
• Predicció d'estructura de proteïnes
• Bioquímica i biofísica computacional

Centres i institucions proveïdors de recursos en Biologia Computacional

• National Center for Biotechnology Information (NCBI)
• European Bioinformatics Institute (EBI)
• European Molecular Biology Laboratory (EMBL)
• Wellcome Trust Sanger Institute (WTSI) or The Sanger
• Broad Institute
• Whitehead Institute
• The Institute for Genomic Research
• Center for Biomolecular Science and Engineering
• Netherlands Bioinformatics Centre
• COSBI - The Centre for Computational and Systems Biology

Societats i organitzacions rellevants

• International Society for Computational Biology
• Bioinformatics.org

Revistes especialitzades

• (BMC) Algorithms for Molecular Biology
• Bioinformatics (formerly Computer Applications in the Biosciences)
• BMC Bioinformatics
• BMC Systems Biology
• Genome Biology
• Genomics
• Journal of Computational Biology
• Nucleic Acids Research
• PLoS Computational Biology
• PLoS ONE
• Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology

Conferències d'interès

• Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
• European Conference on Computational Biology (ECCB)
• Pacific Symposium on Biocomputing (PSB)
• International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB)

Bases de dades rellevants en Bioinformàtica i Biologia Computacional

• Ensembl
• UCSC Genome Browser
• Interpro
• Pfam
• OMIM
• Superfamily
• CATH
• SCOP
• Protein Data Bank
• DECIPHE

Enllaços externs

• The Open Bioinformatics Foundation or O|B|F, fundació per a la promoció del codi obert en el camp de la bionformàtica. (anglès)
• The Bioinformatics Organization, Inc., associació per a la difusió i accés obert en el camp de la bioinformàtica. (anglès)
• First q-bio Conference on Cellular Information Processing - Conferències a Santa Fe (NM) (8-11 d'agost de 2007), centrades en el modelatge de sistemes i experimentació quantitativa de regulació gènica i transducció de senyals.
• http://www.embnet.org/La primera xarxa bioinformàtica fa 20 anys el 2008.
• Wellcome Trust Heart Physiome Project - Enllaços.
• Computational Biology - Publicació d'accés lliure amb revisió per parells.
• Biology News
• Biology and Evolution - Una barreja emocionant de computació, biologia evolutiva i altres coses importants

Màster de Bioinformàtica

• Nou Màster estratègic de Bioinformàtica de la UAB Màster de Bioinformàtica per a la Genòmica i el Disseny de Fàrmacs / MSc Bioinformatics for Genomics and Drug Design