Col·lagen, tipus XI, alfa 1

De Viquipèdia
Dreceres ràpides: navegació, cerca
edit
Col·lagen, tipus XI, alfa 1
Identificadors
Símbols COL11A1; CO11A1; COLL6; STL2
ID externes OMIM120280 MGI88446 HomoloGene56389
Patró d'expressió d'ARN
PBB GE COL11A1 37892 at tn.png
PBB GE COL11A1 204320 at tn.png
Més dades de referència de l'expressió
Ortòlegs
Espècie Humans Ratolins
Entrez 1301 12814
Ensembl ENSG00000060718 ENSMUSG00000027966
UniProt P12107 Q3TST6
RefSeq NM_001854 (ARNm) NM_007729 (ARNm)
NP_001845 (proteïna) NP_031755 (proteïna)
Locus Chr 1:
103.11 - 103.35 Mb
Chr 3:
114.02 - 114.21 Mb
Cerca al PubMed [1] [2]

El col·lagen tipus XI, alfa 1 és una proteïna que en els humans és codificada pel gen COL11A1.[1][2]

Aquest gen codifica per una de les dues cadenes alfa del col·lagen de tipus XI, un col·lagen fibril·lar menor. El col·lagen de tipus XI és un heterotrímer però la tercera cadena alfa és una cadena alfa 1 tipus II post-traduccional. Les mutacions en aquest gen estan associades amb la síndrome de Stickler tipus II i la síndrome de Marshall. S'han identificat tres variants del transcrit codificant tres isoformes per a aquest gen.[2]

Referències[modifica | modifica el codi]

  1. Bernard M, Yoshioka H, Rodriguez E, Van der Rest M, Kimura T, Ninomiya Y, Olsen BR, Ramirez F. «Cloning and sequencing of pro-alpha 1 (XI) collagen cDNA demonstrates that type XI belongs to the fibrillar class of collagens and reveals that the expression of the gene is not restricted to cartilagenous tissue». J Biol Chem, vol. 263, 32, Dec 1988, pàg. 17159-66. PMID: 3182841.
  2. 2,0 2,1 «Entrez Gene: COL11A1 collagen, type XI, alpha 1».

Bibliografia relacionada[modifica | modifica el codi]

  • Yoshioka H, Ramirez F. «Pro-alpha 1(XI) collagen. Structure of the amino-terminal propeptide and expression of the gene in tumor cell lines.». J. Biol. Chem., vol. 265, 11, 1990, pàg. 6423–6. PMID: 1690726.
  • Hanson IM, Gorman P, Lui VC, et al.. «The human alpha 2(XI) collagen gene (COL11A2) maps to the centromeric border of the major histocompatibility complex on chromosome 6.». Genomics, vol. 5, 4, 1990, pàg. 925–31. PMID: 2591970.
  • Henry I, Bernheim A, Bernard M, et al.. «Mapping of a human fibrillar collagen gene, pro alpha 1 (XI) (COL11A1), to the p21 region of chromosome 1.». Genomics, vol. 3, 1, 1989, pàg. 87–90. PMID: 3220479.
  • Keene DR, Oxford JT, Morris NP. «Ultrastructural localization of collagen types II, IX, and XI in the growth plate of human rib and fetal bovine epiphyseal cartilage: type XI collagen is restricted to thin fibrils.». J. Histochem. Cytochem., vol. 43, 10, 1995, pàg. 967–79. PMID: 7560887.
  • Zhidkova NI, Justice SK, Mayne R. «Alternative mRNA processing occurs in the variable region of the pro-alpha 1(XI) and pro-alpha 2(XI) collagen chains.». J. Biol. Chem., vol. 270, 16, 1995, pàg. 9486–93. PMID: 7721876.
  • Yoshioka H, Greenwel P, Inoguchi K, et al.. «Structural and functional analysis of the promoter of the human alpha 1(XI) collagen gene.». J. Biol. Chem., vol. 270, 1, 1995, pàg. 418–24. PMID: 7814404.
  • Dharmavaram RM, Baldwin CT, Reginato AM, Jimenez SA. «Amplification of cDNAs for human cartilage-specific types II, IX and XI collagens from chondrocytes and Epstein-Barr virus-transformed lymphocytes.». Matrix, vol. 13, 2, 1993, pàg. 125–33. PMID: 8388073.
  • Richards AJ, Yates JR, Williams R, et al.. «A family with Stickler syndrome type 2 has a mutation in the COL11A1 gene resulting in the substitution of glycine 97 by valine in alpha 1 (XI) collagen.». Hum. Mol. Genet., vol. 5, 9, 1997, pàg. 1339–43. PMID: 8872475.
  • Shrivastava A, Radziejewski C, Campbell E, et al.. «An orphan receptor tyrosine kinase family whose members serve as nonintegrin collagen receptors.». Mol. Cell, vol. 1, 1, 1998, pàg. 25–34. PMID: 9659900.
  • Annunen S, Körkkö J, Czarny M, et al.. «Splicing mutations of 54-bp exons in the COL11A1 gene cause Marshall syndrome, but other mutations cause overlapping Marshall/Stickler phenotypes.». Am. J. Hum. Genet., vol. 65, 4, 2000, pàg. 974–83. PMID: 10486316.
  • Fischer H, Salahshor S, Stenling R, et al.. «COL11A1 in FAP polyps and in sporadic colorectal tumors.». BMC Cancer, vol. 1, 2002, pàg. 17. PMID: 11707154.
  • Jun AS, Liu SH, Koo EH, et al.. «Microarray analysis of gene expression in human donor corneas.». Arch. Ophthalmol., vol. 119, 11, 2001, pàg. 1629–34. PMID: 11709013.
  • Urabe K, Jingushi S, Ikenoue T, et al.. «Immature osteoblastic cells express the pro-alpha2(XI) collagen gene during bone formation in vitro and in vivo.». J. Orthop. Res., vol. 19, 6, 2002, pàg. 1013–20. DOI: 10.1016/S0736-0266(01)00043-2. PMID: 11780999.
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al.. «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 99, 26, 2003, pàg. 16899–903. DOI: 10.1073/pnas.242603899. PMID: 12477932.
  • Melkoniemi M, Koillinen H, Männikkö M, et al.. «Collagen XI sequence variations in nonsyndromic cleft palate, Robin sequence and micrognathia.». Eur. J. Hum. Genet., vol. 11, 3, 2003, pàg. 265–70. DOI: 10.1038/sj.ejhg.5200950. PMID: 12673280.
  • Matsuo N, Yu-Hua W, Sumiyoshi H, et al.. «The transcription factor CCAAT-binding factor CBF/NF-Y regulates the proximal promoter activity in the human alpha 1(XI) collagen gene (COL11A1).». J. Biol. Chem., vol. 278, 35, 2003, pàg. 32763–70. DOI: 10.1074/jbc.M305599200. PMID: 12805369.
  • Poulson AV, Hooymans JM, Richards AJ, et al.. «Clinical features of type 2 Stickler syndrome.». J. Med. Genet., vol. 41, 8, 2004, pàg. e107. DOI: 10.1136/jmg.2004.018382. PMID: 15286167.
  • Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al.. «Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes.». Genome Res., vol. 16, 1, 2006, pàg. 55–65. DOI: 10.1101/gr.4039406. PMID: 16344560.
  • Majava M, Hoornaert KP, Bartholdi D, et al.. «A report on 10 new patients with heterozygous mutations in the COL11A1 gene and a review of genotype-phenotype correlations in type XI collagenopathies.». Am. J. Med. Genet. A, vol. 143, 3, 2007, pàg. 258–64. DOI: 10.1002/ajmg.a.31586. PMID: 17236192.