La E3 Harelbeke 2012 és la 55a edició de la E3 Harelbeke. La cursa es disputà el 23 de març sobre una distància de 203 quilòmetres, sent la sisena prova de l'UCI World Tour 2012. Per primera vegada aquesta cursa formava part de l'UCI World Tour, havent estat fins aleshores una cursa que formava part de l'UCI Europa Tour, amb una categoria 1.HC. La cursa fou traslladada al divendres per tal d'afavorir la participació dels ciclistes que el diumenge següent havien de disputar la següent prova del World Tour, la Gant-Wevelgem.
En ser l'E3 Harelbeke una prova de l'UCI World Tour, els 18 UCI ProTeams són automàticament convidats i obligats a prendre-hi part. A banda, set equips són convidats a prendre-hi part[2] per formar un pilot de 25 equips. Aquests 25 equips són:[3]