És inqüestionable el seu origen àrab. Es tractava d'un mashar andalusí (mashar de Abu Yahya). La fundació de Macharaviaya data de 1572. L'església parroquial, no obstant això, va ser edificada el 1505 i posada sota l'advocació de Sant Jacint, que més tard seria reconstruïda amb el finançament de la família Gálvez.
La petja de la família Gálvez, la influència de la qual va donar origen que a Macharaviaya fos coneguda com la "petita Madrid", es va reflectir en la reconstrucció de l'església, l'impuls a l'agricultura i en la instal·lació de la Fàbrica de Naips, que posseïa el monopoli d'aquest producte per a la seva venda a Amèrica. Una altra família il·lustre de Macharaviaya, la família Cabrera, va donar destacats personatges, com el Tinent General Francisco de Cabrera y Ramírez (1763-1842), amb un meritori paper en la guerra de la Independència, on va combatre als francesos al costat del duc de Wellington i a Juan Martínel Empecinado.
En el segle XIX la fil·loxera va atacar les vinyes del municipi, provocant l'empobriment i amb això el progressiu despoblament de la vila. Durant el segle XIX va néixer a l'annex de Benaque, pertanyent al municipi de Macharaviaya, l'il·lustre poeta Salvador Rueda, on la seva casa-museu es conserva.