Nextstrain

De Viquipèdia
Salta a la navegació Salta a la cerca
Infotaula d'organitzacióNextstrain
Dades
Tipuslloc web Modifica el valor a Wikidata
Camp de treballfilogènia, virologia i epidemiologia Modifica el valor a Wikidata

Lloc webnextstrain.org Modifica el valor a Wikidata

Nextstrain és una col·laboració entre investigadors de Seattle, EUA[1] i Basilea, Suïssa,[2] que proporciona una col·lecció d’eines de codi obert per visualitzar la genètica que hi ha darrere de la propagació de brots epidèmics.[3]

El seu objectiu és donar suport a les mesures de salut pública i la vigilància facilitant la comprensió de la propagació i l'evolució dels patògens. El codi desenvolupat per Nextstrain es posa a disposició del públic a través de, per exemple, github.com i les seves dades estan disponibles i es poden visualitzar de forma accessible a través de les pàgines del lloc web.[4]

Segons el seu lloc web, l'equip de Nextstrain manté una anàlisi genòmica actualitzada de cadascun dels patògens següents:[5]

El maig de 2020, Nextstrain i Trevor Bedford (professor associat, Fred Hutchinson Cancer Research Center)[6] van rebre un premi Webby Special Achievement Award per a l'eina web.[7]

Nextstrain i els seus resultats han estat àmpliament citats durant la pandèmia COVID-19.[8][cal citació]

Referències[modifica]

  1. How coronavirus mutations can track its spread—and disprove conspiracies Sarah Elizabeth Richards, 26 March 2020 www.nationalgeographic.com, accessed 25 December 2020
  2. Spread of a novel SARS-CoV-2 variant across Europe in summer 2020 29 October 2020 www.unibas.ch, accessed 25 December 2020
  3. nextstrain RNA, DNA, and COVID-19 Nosheen Reza 6 April 2020 earlycareervoice.professional.heart.org, accessed 25 December 2020
  4. Nextstrain: real-time tracking of pathogen evolution Bioinformatics, Volume 34, Issue 23, 01 December 2018, Pages 4121–4123, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty407 22 May 2018 academic.oup.com/bioinformatics, accessed 25 December 2020
  5. Nextstrain Real-time tracking of pathogen evolution section 'Explore pathogens' nextstrain.org, accessed 26 December 2020
  6. 40 Under 40 Healthcare fortune.com, accessed 29 December 2020
  7. Webby Special Achievement winners.webbyawards.com, accessed 29 December 2020
  8. The Science Behind London’s Christmas Coronavirus Lockdown John Drake 19 Dec 2020 www.forbes.com, accessed 25 December 2020