La vila fou fundada el 1252 i ja gaudí de privilegis d'ençà el segle xv. El nom actual de la vila, Senec, s'empra d'ençà la primera meitat del segle XX i deriva dels noms històrics Zemch i Szempc. D'altra banda, la denominació alemanya històrica és Wartberg, prou utilitzada al passat.
La vila fou annexionada per Hongria després del primer arbitratge de Viena el 2 de novembre de 1938, any en què la ciutat tenia 5.559 habitants. Després de l'alliberament, la ciutat es reintegrà a la reconstituïda Txecoslovàquia.