És un patogen humà que pot causar diverses infeccions i processos invasius greus. Fou el major causant de pneumònia a finals del segle XIX. És un patogen que pràcticament només afecta l'home, i és el responsable d'un gran nombre d'infeccions com pneumònia, sinusitis, peritonitis, otitis mitjana, meningitis, osteomielitis, endocarditis i pericarditis. Sobretot afecta gent gran, nens i persones immunodeprimides. S. pneumoniae és el bacteri responsable de la majoria de meningitis en adults i nens. Mentre que la pneumònia causada pel pneumococ és més comú en infants i gent gran. El pneumococ viu a la nasofaringe humana i la colonització es pot produir durant els primers dies de vida.