El club va néixer l'1 de juliol de 1904 amb el nom de TuS Friedrich Bayer & Co 1904 Leverkusen. Tres anys més tard es creà una secció separada per al futbol. L'any 1923 es reanomenà com a FV 1904 Leverkusen, el 1928 se separà del club original formant el SportVereinigung 04 Leverkusen amb seccions d'handbol, atletisme o boxa, a més del futbol, però sense la part de gimnàstica. Així el SV Bayer 04 adoptà els colors vermell i negre, mentre que els gimnastes adoptaren el blau i el groc. El 1935 incorporà el mot Bayer al nom. Als anys 40 hi hagué diversos intents de fusionar les dues entitats però no reeixiren. L'any 1984, les dues parts del club que havien romàs separades durant força anys per fi uniren de nou les forces. Així s'adoptà el nom de TSV Bayer 04 Leverkusen. Aquest fet, a més, coincidí amb els millors anys del club a nivell esportiu on trobem una copa alemanya a més d'una copa de la UEFA. El 1999, la secció de futbol es va separar del club esportiu i ara és una entitat separada formalment anomenada Bayer 04 Leverkusen Fußball GmbH.[2]
.jpg)
Copa de la UEFA (1)
.png){kind=small}
