L'estació va començar a funcionar el novembre de 1857, quan fou inaugurat el tram fins a l'Alcúdia de Crespins de la línia que havia d'unir Xàtiva amb Almansa.[2] L'anterior edifici de l'estació fou enderrocat el 2011, ja que l'aluminosi que sofria l'estructura n'impedia la rehabilitació, i des de llavors les instal·lacions estan situades en barracons.[3][4]
Entre 2009 i 2019 el servici de trens de la línia C-2 acabava en l'estació de l'Alcúdia de Crespins degut a les obres de la línia d'alta velocitatValència-Alacant. Durant este període Renfe oferia servici d'autobús entre l'Alcúdia i la resta d'estacions de la línia fins a Moixent.[5]
El servici de trens entre Xàtiva i l'Alcúdia de Crespins fou suspés el maig de 2022 degut a obres en la infraestructura[6] i fou parcialment restablert el setembre del 2023, completat per autobús.[7]