Clorofexos

Afegeix enllaços
De la Viquipèdia, l'enciclopèdia lliure
(S'ha redirigit des de: Clorofex)
Infotaula d'ésser viuClorofexos
Chlorobacteria Modifica el valor a Wikidata
Taxonomia
FílumChlorobacteria Modifica el valor a Wikidata
Nomenclatura
Sinònims
Chlorobacteria
Classes
Classe Dehalococcoidetes

Classe Anaerolineae Yamada et al. 2006

Classe Caldilineae Yamada et al. 2006

Classe Ktedonobacteria Cavaletti et al. 2007 emend. Yabe et al. 2010

Classe Thermomicrobia Garrity and Holt 2002 emend. Hugenholtz and Stackebrandt 2004

Classe Chloroflexi Garrity and Holt 2001 emend. Gupta et al. 2012

Els Chloroflexi o Chlorobacteria són un filum de bacteris que conté membres que són termòfils aeròbis, els quals fan servir oxigen i creixen bé a altes temperatures, fotòtrofs anoxigènics que fan servir la llum per la fotosíntesi i halorespiradors anaerobis els quals fan servir compostos orgànics halogenats com a font d'energia.

Història[modifica]

El 1987, Carl Woese va dividir els Eubacteria en 11 divisions basades en lARN ribosòmic 16S i agrupà els gèneres Chloroflexus, Herpetosiphon i Thermomicrobium dins els bacteris verds sense sofre i els seus relacionats ("Green non-sulfur bacteria and relatives"),[1][2] el qual va ser temporalment rebatejat com "Chloroflexi" en el volum 1 del Bergey's Manual of Systematic Bacteriology.[3] Malgrat tot des del 2001 s'han creat noves classes gràcies a les noves espècies descobertes. Tanmateix, avui el filum Chloroflexi es divideix en:[4]

  • Chloroflexi Gupta et al. 2012
  • Thermomicrobia Hugenholtz & Stackebrandt, 2004
  • "Dehalococcoidetes" Hugenholtz & Stackebrandt, 2004
  • Anaerolineae Yamada et al., 2006
  • Caldilineae Yamada et al., 2006
  • Ktedonobacteria Cavaletti et al., 2007 emend. Yabe et al., 2010

Filogènia[modifica]

La taxonomia acceptada actualment es basa en la List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [5] i el National Center for Biotechnology Information (NCBI)[6] i la filogènia es basa en 'The All-Species Living Tree' Project [7]




Kouleothrix aurantiaca ♠



Candidatus Chlorothrix halophila[8]



Dehalococcoidetes

Dehalogenimonas lykanthroporepellens


Dehalococcoides

D. ethenogenes ♠[9]



D. mccartyi ♣[10]





Caldilinea

C. aerophila[11]



C. tarbellica[12]



Anaerolineaceae

Thermanaerothrix daxensis ♠[13]


Anaerolinea

A. thermolimosa[14]



A. thermophila[11]






Bellilinea caldifistulae[15]



Levilinea saccharolytica[14]





Leptolinea tardivitalis[14]



Longilinea arvoryzae[15]








Ktedonobacteria
Thermogemmatispora

T. foliorum[16]



T. onikobensis[16]



Ktedonobacteriales

Ktedonobacter racemifer corrig.[17]



Thermosporothrix hazakensis[18]





Thermomicrobia

Thermobaculum terrenum ♠[19]



Sphaerobacter thermophilus[20]



Thermomicrobium roseum[21]



Chloroflexi
Herpetosiphon

H. aurantiacus[22]



H. geysericola[23][24]



Chloroflexales

Dehalobium chlorocoercia ♠[25]


Oscillochloris

O. chrysea ♪ Gorlenko and Pivovarova 1989



O. trichoides (ex Szafer) Gorlenko and Korotkov 1989 emend. Keppen et al. 2000



Chloroflexaceae

Chloronema giganteum ♪ Dubinina and Gorlenko 1975



Heliothrix oregonensis[26]



Roseiflexus castenholzii[27]


Chloroflexus

C. aggregans[28]



C. aurantiacus[29]









Notes:
♠ Soques trobades al National Center for Biotechnology Information (NCBI) però no llistades al List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LSPN).
♪ Procariotes que on els cultius no purament axènics s'han aïllat o no disponibles.

Etimologia[modifica]

El nom "Chloroflexi" és un nominatiu plural neollatí de "Chloroflexus", el qual és el nom del primer gènere descrit.

Referències[modifica]

  1. ↑ Holland L. «Woese,Carl in the forefront of bacterial evolution revolution». scientist, 4, 10, 22.
  2. ↑ Woese CR «Bacterial evolution.». Microbiol Rev, 51, 2, 1987, pàg. 221-71. PMC: 373105. PMID: 2439888.
  3. ↑ Don J. Brenner; Noel R. Krieg; James T. Staley George M. Garrity. Introductory Essays. 2A. 2nd. Nova York: Springer, 26 juliol 2005, p. 304. British Library no. GBA561951. ISBN 978-0-387-24143-2. 
  4. ↑ LPSN bacterio.net. {{format ref}} http://www.bacterio.net Data accés: 07.01.16
  5. ↑ J.P. Euzéby. «Chloroflexi». List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [1]. Arxivat de l'original el 2013-01-27. [Consulta: 20 març 2014].
  6. ↑ Sayers. «Chloroflexi». National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database [2]. [Consulta: 20 març 2014].
  7. ↑ 'The All-Species Living Tree' Project.«16S rRNA-based LTP release 115 (full tree)». Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database [3]. [Consulta: 20 març 2014].
  8. ↑ Klappenbach, Joel A.; Pierson, Beverly K. «Phylogenetic and physiological characterization of a filamentous anoxygenic photoautotrophic bacterium ?Candidatus Chlorothrix halophila? gen. nov., sp. nov., recovered from hypersaline microbial mats». Archives of Microbiology, 181, 1, 2004, pàg. 17–25. DOI: 10.1007/s00203-003-0615-7. ISSN: 0302-8933.
  9. ↑ Maymo-Gatell, X. «Isolation of a Bacterium That Reductively Dechlorinates Tetrachloroethene to Ethene». Science, 276, 5318, 1997, pàg. 1568–1571. DOI: 10.1126/science.276.5318.1568. ISSN: 00368075.
  10. ↑ Loffler, F. E.; Yan, J.; Ritalahti, K. M.; Adrian, L.; Edwards, E. A.; Konstantinidis, K. T.; Muller, J. A.; Fullerton, H.; Zinder, S. H. «Dehalococcoides mccartyi gen. nov., sp. nov., obligately organohalide-respiring anaerobic bacteria relevant to halogen cycling and bioremediation, belong to a novel bacterial class, Dehalococcoidia classis nov., order Dehalococcoidales ord. nov. and family Dehalococcoidaceae fam. nov., within the phylum Chloroflexi». INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 63, Pt 2, 2012, pàg. 625–635. DOI: 10.1099/ijs.0.034926-0. ISSN: 1466-5026.
  11. ↑ 11,0 11,1 Sekiguchi, Y. «Anaerolinea thermophila gen. nov., sp. nov. and Caldilinea aerophila gen. nov., sp. nov., novel filamentous thermophiles that represent a previously uncultured lineage of the domain Bacteria at the subphylum level». INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 53, 6, 2003, pàg. 1843–1851. DOI: 10.1099/ijs.0.02699-0. ISSN: 1466-5026.
  12. ↑ Grégoire P, Bohli M, Cayol JL, Joseph M, Guasco S, Dubourg K et al. «Caldilinea tarbellica sp. nov., a filamentous, thermophilic, anaerobic bacterium isolated from a deep hot aquifer in the Aquitaine Basin.». Int J Syst Evol Microbiol, 61, Pt 6, 2011, pàg. 1436-41. DOI: 10.1099/ijs.0.025676-0. PMID: 20584812.
  13. ↑ doi:10.1016/j.syapm.2011.02.004
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  14. ↑ 14,0 14,1 14,2 doi:10.1099/ijs.0.64169-0
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  15. ↑ 15,0 15,1 doi:10.1099/ijs.0.65098-0
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  16. ↑ 16,0 16,1 doi:10.1099/ijs.0.024877-0
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  17. ↑ doi:10.1128/AEM.00132-06
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  18. ↑ doi:10.1099/ijs.0.018069-0
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  19. ↑ doi:10.1007/s00203-004-0647-7
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  20. ↑ doi:10.1016/S0723-2020(89)80023-2
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  21. ↑ doi:10.1099/00207713-23-1-28
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  22. ↑ Holt JG, Lewin RA «Herpetosiphon aurantiacus gen. et sp. n., a new filamentous gliding organism.». J Bacteriol, 95, 6, 1968, pàg. 2407-8. PMC: PMC315177. PMID: 5669912.
  23. ↑ doi:10.1111/j.1749-6632.1936.tb56976.x
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  24. ↑ doi:10.1139/m70-087
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  25. ↑ doi:10.1128/AEM.68.2.807-812.2002
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  26. ↑ doi:10.1007/BF00447061
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  27. ↑ Hanada S, Takaichi S, Matsuura K, Nakamura K «Roseiflexus castenholzii gen. nov., sp. nov., a thermophilic, filamentous, photosynthetic bacterium that lacks chlorosomes.». Int J Syst Evol Microbiol, 52, Pt 1, 2002, pàg. 187-93. DOI: 10.1099/00207713-52-1-187. PMID: 11837302.
  28. ↑ doi:10.1099/00207713-45-4-676
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
  29. ↑ doi:10.1007/BF00446302
    Aquesta referència està incompleta. Cal copiar-la per completar-la.
Obtingut de «https://ca.wikipedia.org/w/index.php?title=Clorofexos&oldid=31884701»