La capital del Japó és Tòquio, seu del govern i llar de l'Emperador. Generalment no està en disputa, però no està definit legalment. De fet, existeix una disputa sobre quan Tòquio va esdevenir la capital: alguns diuen que va ocórrer quan la prefectura de Tòquio va ser establerta el 1868, altres diuen quan el castell Edo va esdevenir el Castell de Tòquio en aquest mateix any, mentre que altres esmenten que va ser quan el Castell de Tòquio es va convertir al Castell Imperial (ara el Kokyo) el 1869. Històricament parlant, va existir un edicte imperial que transferia la capital a Heiankyo, i que no es va elaborar un que hagi transferit la capital de Kyoto a Tòquio. Així, existeixen opinions que la transferència a Heiankyo va ser vàlida i que Kyoto és encara la capital del Japó, mentre que alguns opinen que tant Kyoto com Tòquio són simultàniament capitals del Japó.
