Ha tingut una història violenta i ha estat danyat i reconstruït moltes vegades. Els frares van ser sovint perseguits i sotmesos a atacs per grups de lladres. Avui dia l'abadia no conserva el sostre en el pis superior, tot i que, a part d'això, està molt ben conservada. La característica més interessant és situada al claustre, que conté un gran teix.
Planta baixa de Muckross Abbey
En els segles XVII i XVIII, va esdevenir el lloc d'enterrament de destacats poetes del Comtat de Kerry: O'Donoghue, O'Rathaille i O'Suilleabhain.
