GeneCards
GeneCards és una base de dades de gens humans que proporciona informació genòmica, proteòmica, transcriptòmica, genètica i funcional sobre tots els gens humans coneguts i predits.[1][2][3][4] Està desenvolupat i mantingut peel Crown Human Genome Center del Weizmann Institute of Science, en col·laboració amb LifeMap Sciences.
La base de dades té com a objectiu proporcionar una visió completa de la informació actual disponible de biomèdica sobre el gen cercat, inclosos els seus àlies i identificadors, les proteïnes codificades, malalties i variacions associades, la seva funció, publicacions rellevants i més.[1][5][6] La base de dades GeneCards proporciona accés a recursos gratuïts de la Web sobre més de 350.000 gens humans coneguts i predits, integrats a partir de més de 150 recursos de dades, com ara HGNC, Ensembl i NCBI. La llista de gens bàsics es basa en NCBI, Ensembl i símbols de gens aprovats publicats per l'HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC o Comitè de Nomenclatura de Gens HUGO).[7][8] La informació es recull i se selecciona acuradament d'aquestes bases de dades pel seu motor d'integració.
Amb el temps, la base de dades GeneCards ha desenvolupat un conjunt d'eines (VarElect, GeneALaCart, etc.) que tenen capacitats més especialitzades aprofitant la base de dades. Des de 1998, la base de dades GeneCards ha estat àmpliament utilitzada per les comunitats de bioinformàtica, genòmica i medicina durant més de 24 anys.[7][8]
Referències
[modifica]- ↑ 1,0 1,1 «GeneCards: integrating information about genes, proteins and diseases». Trends in Genetics, vol. 13, 4, April 1997, pàg. 163. DOI: 10.1016/S0168-9525(97)01103-7. PMID: 9097728.
- ↑ «GeneCards: a novel functional genomics compendium with automated data mining and query reformulation support». Bioinformatics, vol. 14, 8, 1998, pàg. 656–64. DOI: 10.1093/bioinformatics/14.8.656. PMID: 9789091.
- ↑ «GeneCards 2002: towards a complete, object-oriented, human gene compendium». Bioinformatics, vol. 18, 11, November 2002, pàg. 1542–3. DOI: 10.1093/bioinformatics/18.11.1542. PMID: 12424129.
- ↑ «GIFtS: annotation landscape analysis with GeneCards». BMC Bioinformatics, vol. 10, 1, October 2009, pàg. 348. DOI: 10.1186/1471-2105-10-348. PMC: 2774327. PMID: 19852797.
- ↑ «GeneCards». GeneCards. Arxivat de l'original el 2013-10-14. [Consulta: 18 octubre 2013].
- ↑ «GeneCards». [Consulta: 19 octubre 2013].
- ↑ 7,0 7,1 «In-silico human genomics with GeneCards». Human Genomics, vol. 5, 6, October 2011, pàg. 709–17. DOI: 10.1186/1479-7364-5-6-709. PMC: 3525253. PMID: 22155609.
- ↑ 8,0 8,1 «GeneCards Version 3: the human gene integrator». Database, vol. 2010, August 2010, pàg. baq020. DOI: 10.1093/database/baq020. PMC: 2938269. PMID: 20689021.