El municipi de Samsø és un municipidanès que ocupa l'illa de Samsø, a l'estret de Kattegat entre la península de Jutlàndia i l'illa de Sjælland. La Reforma Municipal Danesa del 2007 va situar el municipi a la Regió de Midtjylland però no el va afectar quant a territori, que a més de l'illa de Samsø comprèn també algunes petites illes adjacents situades al Stavns Fjord, com Brokold, Eskeholm, Hjortholm, Mejlesholm, Yderste Holm, Svæm. Ægholm o Hundssholm, i les illes de Kyholm i Vejrø.
La ciutat més important i seu administrativa del municipi és Tranebjerg (829 habitants el 2009). Altres poblacions del municipi:
