Hi ha una bossa de magma sota el llac que allibera diòxid de carboni (CO₂) a l'aigua. El llac Nyos és un dels tres únics llacs coneguts que estan saturats de diòxid de carboni d'aquesta manera; els altres són el llac Monoun, també al Camerun, i el llac Kivu de Ruanda. El 21 d'agost del 1986, possiblement a causa d'una esllavissada, el llac va alliberar sobtadament un gran núvol de CO₂ que asfixià 1.700 persones i 3.500 caps de ramat en poblats propers.[1]
Tot i que no era un fet sense precedents, va ser la primera asfíxia a gran escala causada per un esdeveniment natural que es coneix.[2] Per evitar que es repetís, el 2001 s'hi instal·là un tub desgassejador, però en calen més perquè el llac sigui segur.[3]