Gene Ontology

De Viquipèdia
(S'ha redirigit des de: Ontologia genètica)
Salta a: navegació, cerca

El Gene Ontology és una projecte de l'àmbit de la bioinformàtica que té com a objectiu la descripció estructurada de gens i llurs productes gènics mitjançant un conjunt de diferents ontologies biològiques curades manualment.

Actualment consta de tres ontologies, o espais de noms, diferenciades que poden representar-se com a grafs acíclics dirigits.

Exemple de terme GO[modifica | modifica el codi]

id: GO:0000016
name: lactase activity
namespace: molecular_function
def: "Catalysis of the reaction: lactose + H₂O = D-glucose + D-galactose." [EC:3.2.1.108]
synonym: "lactase-phlorizin hydrolase activity" BROAD [EC:3.2.1.108]
synonym: "lactose galactohydrolase activity" EXACT [EC:3.2.1.108]
xref: EC:3.2.1.108
xref: MetaCyc:LACTASE-RXN
xref: Reactome:REACT_100439 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Gallus gallus"
xref: Reactome:REACT_104113 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Rattus norvegicus"
xref: Reactome:REACT_105850 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Bos taurus"
xref: Reactome:REACT_109208 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Taeniopygia guttata"
xref: Reactome:REACT_109391 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Sus scrofa"
xref: Reactome:REACT_109447 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Danio rerio"
xref: Reactome:REACT_112431 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Caenorhabditis elegans"
xref: Reactome:REACT_114967 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Drosophila melanogaster"
xref: Reactome:REACT_30821 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Mus musculus"
xref: Reactome:REACT_78084 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Canis familiaris"
xref: Reactome:REACT_78754 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Xenopus tropicalis"
xref: Reactome:REACT_9455 "lactose + H2O => D-glucose + D-galactose, Homo sapiens"
xref: RHEA:10079
is_a: GO:0004553 ! hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds

Font:[1]

Referències[modifica | modifica el codi]

  1. The GO Consortium. «gene_ontology.1_2.obo» (OBO 1.2 flat file), 15-03-2015. [Consulta: 15 març 2015].

Enllaços externs[modifica | modifica el codi]