Cas6: diferència entre les revisions
m Afegida Categoria:Proteïnes usant HotCat |
Afegida introducció a l'apartat història. |
||
| Línia 1: | Línia 1: | ||
(Aquest article es troba en construcció i serà finalitzat abans del dia 24 d'octubre. Cap dels elements escrits és difinitiu i tot estarà sotmès a possibles canvis fins la data mencionada prèviament. Gràcies per la seva paciència.) |
(Aquest article es troba en construcció i serà finalitzat abans del dia 24 d'octubre. Cap dels elements escrits és difinitiu i tot estarà sotmès a possibles canvis fins la data mencionada prèviament. Gràcies per la seva paciència.) |
||
Cas6 (de l’anglès |
Cas6 (de l’anglès '''C'''RISPR '''as'''sociated protein '''6''') és una [[Ribonucleasa|endoribonucleasa]] associada al sistema [[CRISPR]] (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats, traduït al català com Repeticions Curtes Palindròmiques Agrupades i Regularment Espaiades). |
||
== Història == |
== Història == |
||
La proteïna Cas6 va ser primerament identificada el 2005 basant-se en anàlisis genòmiques de diferents microorganismes procariotes, tant arqueus com bacteris, amb el sistema CRISPR. Donada la seva distribució en múltiples microorganismes de diferents taxonomies amb poca o nula relació entre sí, es va afegir junt amb la proteina Cas5 a la llista de gens nucli del sistema Cas (''cas core genes'')<ref>{{Ref-publicació|cognom=Haft|nom=Daniel H.|cognom2=Selengut|nom2=Jeremy|cognom3=Mongodin|nom3=Emmanuel F.|cognom4=Nelson| nom4=Karen E.|article=A Guild of 45 CRISPR-Associated (Cas) Protein Families and Multiple CRISPR/Cas Subtypes Exist in Prokaryotic Genomes|publicació=PLoS Computational Biology|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1282333/|volum=1(6)|data=2005-11|doi=10.1371/journal.pcbi.0010060|pmid=16292354}}</ref>. Aquesta llista havia estat elaborada el 2002 i hi contenia els gens per a les proteines Cas1-4<ref>{{Ref-publicació|cognom=Jansen|nom=R.|cognom2=Embden|nom2=J. D.|cognom3=Gaastra|nom3=W.|cognom4=Schouls| nom4=L. M.|article=Identification of genes that are associated with DNA repeats in prokaryotes|publicació=Molecular Microbiology|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11952905|volum=43|exemplar=6|data=2002-3|pàgines=1565-75|doi=10.1046/j.1365-2958.2002.02839.x |pmid=11952905}}</ref>. |
|||
== Estructura == |
== Estructura == |
||
Revisió del 11:56, 14 oct 2018
(Aquest article es troba en construcció i serà finalitzat abans del dia 24 d'octubre. Cap dels elements escrits és difinitiu i tot estarà sotmès a possibles canvis fins la data mencionada prèviament. Gràcies per la seva paciència.)
Cas6 (de l’anglès CRISPR associated protein 6) és una endoribonucleasa associada al sistema CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats, traduït al català com Repeticions Curtes Palindròmiques Agrupades i Regularment Espaiades).
Història
La proteïna Cas6 va ser primerament identificada el 2005 basant-se en anàlisis genòmiques de diferents microorganismes procariotes, tant arqueus com bacteris, amb el sistema CRISPR. Donada la seva distribució en múltiples microorganismes de diferents taxonomies amb poca o nula relació entre sí, es va afegir junt amb la proteina Cas5 a la llista de gens nucli del sistema Cas (cas core genes)[1]. Aquesta llista havia estat elaborada el 2002 i hi contenia els gens per a les proteines Cas1-4[2].
Estructura
Aplicacions
Sistema CRISPR-Cas
Per tal de protegir-se davant de possibles infeccions víriques o d’altres paràsits moleculars, els organismes han desenvolupat mecanismes de defensa basats en la utilització de guies d’ARN[3][4]. En el cas dels eucariotes, el principal s’anomena ARN d’interferència (RNAi) i s’encarrega d’activar i desactivar gens, fet que li permet anul·lar fragments de material genètic provinents de virus o transposons[5] i, a més, controlar el desenvolupament biològic i l’expressió gènica en general (...).
Per l’altre costat, els arquea i nombrosos bacteris presenten un sistema de defensa similar a l’eucariota[6]. Conegut com sistema CRISPR-Cas o ARN d’interferència procariota (pRNAi), aquest es troba format per dues parts diferenciades: el CRISPR, que correspon a un seguit de seqüències d’ADN provinents de virus que prèviament han infectat l’organisme, i el Cas, que fa referència a una família de proteïnes associades al sistema CRISPR.
Vegeu també
Referències
- ↑ Haft, Daniel H.; Selengut, Jeremy; Mongodin, Emmanuel F.; Nelson, Karen E. «A Guild of 45 CRISPR-Associated (Cas) Protein Families and Multiple CRISPR/Cas Subtypes Exist in Prokaryotic Genomes». PLoS Computational Biology, 1(6), 2005-11. DOI: 10.1371/journal.pcbi.0010060. PMID: 16292354.
- ↑ Jansen, R.; Embden, J. D.; Gaastra, W.; Schouls, L. M. «Identification of genes that are associated with DNA repeats in prokaryotes». Molecular Microbiology, 43, 6, 2002-3, pàg. 1565-75. DOI: 10.1046/j.1365-2958.2002.02839.x. PMID: 11952905.
- ↑ Farazi, Thalia A.; Juranek, Stefan A.; Tuschl, Thomas «The growing catalog of small RNAs and their association with distinct Argonaute/Piwi family members». Development (Cambridge, England), 135, 7, 2008-4, pàg. 1201–1214. DOI: 10.1242/dev.005629. ISSN: 0950-1991. PMID: 18287206.
- ↑ Girard, Angélique; Hannon, Gregory J. «Conserved themes in small-RNA-mediated transposon control». Trends in Cell Biology, 18, 3, 2008-3, pàg. 136–148. DOI: 10.1016/j.tcb.2008.01.004. ISSN: 1879-3088. PMC: PMC2995447. PMID: 18282709.
- ↑ Ding, Shou-Wei; Voinnet, Olivier «Antiviral immunity directed by small RNAs». Cell, 130, 3, 10-08-2007, pàg. 413–426. DOI: 10.1016/j.cell.2007.07.039. ISSN: 0092-8674. PMC: PMC2703654. PMID: 17693253.
- ↑ Sorek, Rotem; Kunin, Victor; Hugenholtz, Philip «CRISPR--a widespread system that provides acquired resistance against phages in bacteria and archaea». Nature Reviews. Microbiology, 6, 3, 2008-3, pàg. 181–186. DOI: 10.1038/nrmicro1793. ISSN: 1740-1534. PMID: 18157154.