Apaf-1

De la Viquipèdia, l'enciclopèdia lliure
Infotaula de genApaf-1
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe Modifica el valor a Wikidata RCSB Modifica el valor a Wikidata
Llista de codis id de PDB1C15, 1CWW, 1CY5, 1Z6T, 2P1H, 2YGS, 3J2T, 3YGS, 4RHW i 3JBT Modifica el valor a Wikidata
Identificadors
Ontologia genètica
Funció Molecularheat shock protein binding (en) Tradueix
ADP binding (en) Tradueix
unió proteica
unió de proteïnes idèntica
Unió d'ATP
unió de nucleòtids
cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process (en) Tradueix Modifica el valor a Wikidata
Component Cel·lularcitoplasma
citosol
exosoma extracel·lular
nucli cel·lular
apoptosome (en) Tradueix
regió extracel·lular
secretory granule lumen (en) Tradueix
ficolin-1-rich granule lumen (en) Tradueix
citosol
complex macromolecular
apoptosome (en) Tradueix
exosoma extracel·lular Modifica el valor a Wikidata
Procés biològiccellular response to transforming growth factor beta stimulus (en) Tradueix
neuron apoptotic process (en) Tradueix
regulation of apoptotic process (en) Tradueix
diferenciació cel·lular
response to hypoxia (en) Tradueix
response to nutrient (en) Tradueix
response to G1 DNA damage checkpoint signaling (en) Tradueix
envelliment humà
positive regulation of apoptotic signaling pathway (en) Tradueix
glial cell apoptotic process (en) Tradueix
desenvolupament neuronal
desenvolupament d'organisme multicel·lular
cardiac muscle cell apoptotic process (en) Tradueix
intrinsic apoptotic signaling pathway (en) Tradueix
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress (en) Tradueix
neural tube closure (en) Tradueix
brain development (en) Tradueix
positive regulation of apoptotic process (en) Tradueix
apoptotic signaling pathway (en) Tradueix
forebrain development (en) Tradueix
regulation of apoptotic DNA fragmentation (en) Tradueix
protein homooligomerization (en) Tradueix
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process (en) Tradueix
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c (en) Tradueix
apoptosi
neutrophil degranulation (en) Tradueix
negative regulation of G0 to G1 transition (en) Tradueix
kidney development (en) Tradueix
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c (en) Tradueix
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c (en) Tradueix Modifica el valor a Wikidata
Patró de l'expressió de l'ARN
Ortòlegs Humà
Ortòlegs Ratolí
UniProtO14727 Modifica el valor a Wikidata
SeqRef (proteïna)NP_001151, NP_037361, NP_863651, NP_863658, NP_863659 i XP_016874739 Modifica el valor a Wikidata
Infotaula de proteïnaApoptotic peptidase activating factor 1
Substànciaproteïna Modifica el valor a Wikidata
Identificadors
SímbolCED4
HUGO576
Entrez317
OMIM602233
RefSeqNM_181861.1
O14727
PDB1C15, 1CWW, 1CY5, 1Z6T, 2P1H, 2YGS, 3J2T, 3YGS, 4RHW i 3JBT Modifica el valor a Wikidata

La proteïna Apaf-1 (Apoptosis protease-activating factor-1) és un regulador clau de la via apoptòtica mitocondrial, sent l'element central del complex multimèric anomenat apoptosoma, format també per la procaspasa-9 i el citocrom c.

Les activitats Apaf es van descriure per primera vegada en experiments in vitro per recuperar l'activitat caspasa a partir de fraccions citosòliques de cèl·lules HeLa. Apaf-1 va resultar ser una molècula adaptadora amb homologia amb la proteïna CED-4 de C. elegans, mentre que Apaf-2 i Apaf-3 van ser identificats com el citocrom ci la caspasa-9 respectivament (Zou et al. 1997).

La formació de l'apoptosoma[modifica]

La formació de l'estructura de l'apoptosoma es desencadena amb l'alliberament del mitocondri del citocrom c intervingut per la família Bcl-2. Un cop alliberat, el citocrom c s'uneix a Apaf-1 formant un primer complex. Aquesta unió ve definida per l'existència en l'extrem C-terminal d'Apaf-1 de diversos dominis WD40 d'unió proteïna-proteïna com els presents en la subunitat b de les proteïnes G heterotrimèriques. Apaf-1 presenta també un domini de reclutament de caspases (CARD) que, en condicions d'inactivitat, estaria "segrestat" per dos dels dominis WD40, però que s'allibera amb la unió del citocrom c. L'exposició dels dominis CARD permet a Apaf-1 reclutar la procaspasa-9 en presència de dATP que intervé l'oligomerització del complex. Un cop unida, la procaspasa-9 té un autoprocessament donant lloc a la seva forma activa de caspasa-9, una caspasa iniciadora capaç d'activar caspases efectores com la caspasa-3. Aquesta successió d'esdeveniments acaba desembocant en l'activació d'altres caspases i de factors de degradació d'ADN que s'encarregarien de fragmentar el material genètic.

Bibliografia[modifica]

  • Zou H, Henzel WJ, Liu X, Lutschg A, Wang X. Apaf-1, a human protein homologous to C. elegans CED-4, participates in cytochrome c-dependent activation of caspase-3. Cell 1997 Aug 8;90(3):405-13. PMID: 9267021.
  • Yoshida H, Kong YY, Yoshida R, Elia AJ, Hakem A, Hakem R, Penninger JM, Mak TW. Apaf1 is required for mitochondrial pathways of apoptosis and brain development. Cell. 1998 Sep 18;94(6):739-50. PMID: 9753321.
  • Danial NN, Korsmeyer SJ. Cell death: critical control points. Cell 2004 Jan 23;116 (2):205-19. PMID: 14744432.

Enllaços externs[modifica]