Dicer

De la Viquipèdia, l'enciclopèdia lliure
DICER1
Estructures disponibles
PDBCerca ortòloga: PDBe RCSB
Identificadors
ÀliesDICER1, DCR1, Dicer, Dicer1e, HERNA, MNG1, RMSE2, K12H4.8-LIKE, dicer 1, ribonuclease III, GLOW
IDs externesOMIM: 606241 MGI: 2177178 HomoloGene: 13251 GeneCards: DICER1
Ortòlegs
EspèciesHumàRatolí
Entrez
Ensembl
UniProt
SeqRef (ARNm)

NM_001195573
NM_001271282
NM_001291628
NM_030621
NM_177438

NM_148948

SeqRef (proteïna)

NP_001182502
NP_001258211
NP_001278557
NP_085124
NP_803187

NP_683750

Localització (UCSC)n/aChr 12: 104.65 – 104.72 Mb
Cerca a PubMed[2][3]
Wikidata
Veure/Editar HumàVeure/Editar Ratolí

Dicer és una ribonucleasa membre de la família de les ARNasa III. És una gran proteïna (>200 kD) monomèrica present en el citoplasma cel·lular. Dicer catalitza el primer pas del mecanisme de RNAi: converteix ARN doble banda (ARNdb o dsRNA) i premicroARN (pre-miARN) en fragments d'ARN d'interferència petits anomenats ARNip (siRNAs i miRNAs) de 20-25 nucleòtids, amb dues bases lliures als extrems 3' hidroxil i un extrem 5' fosfat.

Esquema d'un SiRNA

El nom Dicer fou donat per Emily Bernstein, qui fou la primera a demostrar l'activitat catalítica d'ARNdb de l'enzima.

Les enzimes Dicer contenen:

  • un domini ATPasa/ARN helicasa a l'extrem N-terminal
  • un domini DUF283 de funció desconeguda
  • un domini PAZ, responsable del reconeixement dels nucleòtids lliures a l'extrem 3'
  • dos dominis catalítics ARNasa III (RIIIa i RIIIb) que constitueixen el centre actiu
  • un domini dsRBD (en anglès: double strand RNA binding domain) a l'extrem C-terminal

Cadascun dels dominis ARNasa talla una cadena d'ARN de manera polaritzada: el domini RIIIb talla la cadena ascendent del dsRNA, que conté el 5' fosfat, mentre que el domini RIIIa talla la cadena descendent, que conté l'extrem 3' OH. El domini RIIIa mesura la distància al lloc de tall del dsRNA, potser amb l'ajuda del domini PAZ. Per aquest motiu, el dsRNA es talla a una distància aproximada de 20 parells de bases contades des de l'extrem de la molècula: l'hèlix entre el domini PAZ i el domini RIIIa mesura 65 àngstroms, que corresponen a dues voltes d'hèlix de dsRNA.

  1. 1,0 1,1 1,2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000041415 - Ensembl, May 2017
  2. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.