RNF12

De Viquipèdia
Salta a la navegació Salta a la cerca
edit
Proteïna de dits de zinc RING que interacciona amb el domini LIM
(Ring finger protein, LIM domain interacting)
Identificadors
Símbols RLIM ; NY-REN-43; RNF12
Identif. externs OMIM300379 MGI1342291 HomoloGene7920 GeneCards: RLIM Gene
Ortòlegs
Espècies Humans Ratolins
Entrez 51132 19820
Ensembl ENSG00000131263 ENSMUSG00000056537
UniProt Q9NVW2 Q9WTV7
RefSeq (ARNm) NM_016120 NM_011276
RefSeq (proteïna) NP_057204 NP_035406
Localitz. (UCSC) Chr X:
73.81 – 73.83 Mb
Chr X:
103.96 – 103.98 Mb
Cerca al PubMed [1] [2]

La lligasa RLIM de proteïna-ubiqüitina E3 (en anglès: E3 ubiquitin-protein ligase RLIM) és un enzim que en humans està codificat pel gen RLIM.[1][2]

La proteïna codificada per aquest gen és un dit de zinc RING-H2. Segons han observat els científics, es tracta d'una lligasa d'ubiqüitina que té com a diana el domini d'unió LIM 1 (LDB1/CLIM), i provoca una degradació proteasòmica de LDB1. Tant RLIM com LDB1 són co-repressors de LHX1/LIM-1, un factor de transcripció homeodomini. S'han descrit variants transcripcionals per splicing alternatiu que codifiquen per la mateixa proteïna.[2]

Rnf12 juga un paper important al procés de la inactivació del cromosoma X, i està regulat negativament per factors de pluripotència en cèl·lules mare embrionàries. [3]

Interaccions[modifica]

S'ha demostrat la interacció de RNF12 amb receptor d'estrogen alfa.[4]

Referències[modifica]

  1. Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jager D, Jager E, Knuth A, Chen YT, Old LJ «Antigens recognized by autologous antibody in patients with renal-cell carcinoma». Int J Cancer, 83, 4, Novembre 1999, pàg. 456–464. DOI: 10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5. PMID: 10508479.
  2. 2,0 2,1 «Entrez Gene: RNF12 ring finger protein 12».
  3. Navarro, P.; Moffat, M.; Mullin, N.P.; Chambers, I. «The X-inactivation trans-activator Rnf12 is negatively regulated by pluripotency factors in embryonic stem cells». Hum Genet, 130, 2, 2011, pàg. 255-64. DOI: 10.1007/s00439-011-0998-5 [Consulta: 2 agost 2013].
  4. Johnsen, Steven A; Güngör Cenap, Prenzel Tanja, Riethdorf Sabine, Riethdorf Lutz, Taniguchi-Ishigaki Naoko, Rau Thomas, Tursun Baris, Furlow J David, Sauter Guido, Scheffner Martin, Pantel Klaus, Gannon Frank, Bach Ingolf «Regulation of estrogen-dependent transcription by the LIM cofactors CLIM and RLIM in breast cancer». Cancer Res. [United States], 69, 1, Gener 2009, pàg. 128–136. DOI: 10.1158/0008-5472.CAN-08-1630. PMC: 2713826. PMID: 19117995.

Bibliografia[modifica]

  • Rual JF; Hirozane-Kishikawa, Tomoko; Dricot, Amélie; Li, Ning; Berriz, Gabriel F.; Gibbons, Francis D.; Dreze, Matija; Venkatesan K; Hao T; 3 «Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network». Nature, 437, 7062, 2005, pàg. 1173–1178. DOI: 10.1038/nature04209. PMID: 16189514.
  • Ota T; Otsuki, Tetsuji; Sugiyama, Tomoyasu; Irie, Ryotaro; Wakamatsu, Ai; Hayashi, Koji; Sato, Hiroyuki; Suzuki Y; Nishikawa T; 3 «Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs». Nat. Genet., 36, 1, 2004, pàg. 40–45. DOI: 10.1038/ng1285. PMID: 14702039.
  • Hiratani I; Ohmori, SY; Taira, M; Yamamoto N; Mochizuki T; 3 «Selective degradation of excess Ldb1 by Rnf12/RLIM confers proper Ldb1 expression levels and Xlim-1/Ldb1 stoichiometry in Xenopus organizer functions». Development, 130, 17, 2003, pàg. 4161–4175. DOI: 10.1242/dev.00621. PMID: 12874135.
  • Strausberg RL; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, GD; Feingold EA; Grouse LH; 3 «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 99, 26, 2003, pàg. 16899–16903. DOI: 10.1073/pnas.242603899. PMC: 139241. PMID: 12477932.
  • Ostendorff HP; Schlüter, Anne; Bossenz, Michael; Scheffner, Martin; Bach, Ingolf; Peirano RI; Peters MA; 3 «Ubiquitination-dependent cofactor exchange on LIM homeodomain transcription factors». Nature, 416, 6876, 2002, pàg. 99–103. DOI: 10.1038/416099a. PMID: 11882901.
  • Ostendorff HP; Copeland, NG; Gilbert, DJ; Jenkins, NA; Lichter, P; Bach, I; Bossenz M; Mincheva A; 3 «Functional characterization of the gene encoding RLIM, the correpressor of LIM homeodomain factors». Genomics, 69, 1, 2001, pàg. 120–130. DOI: 10.1006/geno.2000.6311. PMID: 11013082.
  • Bach I; Rodriguez-Esteban, Concepción; Carrière, Catherine; Bhushan, Anil; Krones, Anna; Rose, David W.; Glass, Christopher K.; Rodriguez-Esteban C; Carrière C; 3 «RLIM inhibits functional activity of LIM homeodomain transcription factors via recruitment of the histone deacetylase complex». Nat. Genet., 22, 4, 1999, pàg. 394–399. DOI: 10.1038/11970. PMID: 10431247.