Vés al contingut

ATF6: diferència entre les revisions

De la Viquipèdia, l'enciclopèdia lliure
Exploració interactiva de l'historial
← Edició anteriorEdició següent →
Contingut suprimit Contingut afegit
VisualWikitext
Afegeixo informació vies metabòliques
Ampliació de l’apartat d’estructura de l’ATF6. Afegir els superíndex de les referències bibliogràfiques.
Línia 1: Línia 1:
El '''factor de trancripció activador 6''', també conegut com a '''ATF6''' (de les seves sigles en anglès Activating Transcription Factor 6), és una proteïna codificada pel gen atf6, present únicament en mamífers. Forma part d'una família de [[Factor de transcripció|factors de transcripció]] que activen gens involucrats a la resposta contra proteïnes mal plegades ('''[[:en:Unfolded_protein_response|UPR]]''').
El '''factor de trancripció activador 6''', també conegut com a '''ATF6''' (de les seves sigles en anglès Activating Transcription Factor 6), és una proteïna codificada pel gen atf6, present únicament en mamífers<ref>{{Ref-web|títol=Entry
- *605537 - ACTIVATING TRANSCRIPTION FACTOR 6; ATF6


- OMIM|url=https://www.omim.org/entry/605537|consulta=2023-10-22|llengua=en-us}}</ref>. Forma part d'una família de [[Factor de transcripció|factors de transcripció]] que activen gens involucrats a la resposta contra proteïnes mal plegades ('''[[:en:Unfolded_protein_response|UPR]]''')<ref>{{Ref-web|títol=ATF6 activating transcription factor 6 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI|url=https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12782636/|consulta=2023-10-22}}</ref>.
⚫
== Estructura ==

L’ATF6, presenta dues possibles conformacions, en funció de l’estrès induït al reticle endoplasmàtic. En condicions normals, el factor de trancripció activador 6 és una glicoproteïna de membrana de tipus 2 que es troba incorporada a la membrana del RE amb l’extrem N-terminal al costat citosòlic i consta de 670 aminoàcids. Té un pes molecular de 90 kDa, per aquesta raó també s’anomena p90ATF6. Com totes les proteïnes integrals de membrana, l’ATF6 presenta múltiples dominis funcionals;
⚫
== Estructura i localització ==
L’ATF6, presenta dues possibles conformacions en funció de l’estrès induït al reticle endoplasmàtic. En condicions normals, el factor de trancripció activador 6 és una [[glicoproteïna]] de membrana de tipus 2 que es troba incorporada al RE gràcies a interaccions entre la seva cua luminal i la [[xaperona]] Bip/GRP78, d'aquesta manera, l’extrem N-terminal queda al costat citosòlic i el C-terminal al lumen<ref>{{Ref-publicació|article=A novel role of ER stress signal transducer ATF6 in regulating enterovirus A71 viral protein stability|url=https://doi.org/10.1186/s12929-018-0412-x|publicació=Journal of Biomedical Science|data=2018-01-31|issn=1423-0127|pmc=PMC5793394|pmid=29386036|pàgines=9|volum=25|exemplar=1|doi=10.1186/s12929-018-0412-x|nom=Jia-Rong|cognom=Jheng|nom2=Kean-Seng|cognom2=Lau|nom3=Yueh-Wen|cognom3=Lan|nom4=Jim-Tong|cognom4=Horng}}</ref>. Té un pes molecular de 90 [[kDa]], per aquesta raó també s’anomena p90ATF6<ref name=":0">{{Ref-publicació|article=Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress|url=https://europepmc.org/articles/PMC25679|publicació=Molecular biology of the cell|data=1999-11-01|issn=1939-4586|pmid=10564271|pàgines=3787–3799|volum=10|exemplar=11|doi=10.1091/mbc.10.11.3787|nom=K|cognom=Haze|nom2=H|cognom2=Yoshida|nom3=H|cognom3=Yanagi|nom4=T|cognom4=Yura|nom5=K|cognom5=Mori}}</ref>. Dins del 670 aminoàcids que la conformen, l’ATF6 presenta múltiples dominis funcionals; una cremallera de leucina que permet la seva unió al DNA, un domini d'activació transcripcional situat a l'extrem N-terminal, que consta de 370 aminoàcids i actua com a factor de trancripció per cremalleres de leucina bàsiques de la família bZip i per xaperones com la GRP78, seqüències de localització per l'[[Aparell de Golgi|aparell de golgi]], un domini transmembrana de 21 aminoàcids hidrofòbics i dues zones destinadess a ser tallades per [[Proteasa|proteases]] site-1 i site-2<ref name=":0" /><ref name=":1">{{Ref-publicació|article=The Luminal Domain of ATF6 Senses Endoplasmic Reticulum (ER) Stress and Causes Translocation of ATF6 from the ER to the Golgi|url=http://dx.doi.org/10.1074/jbc.m110636200|publicació=Journal of Biological Chemistry|data=2002-04|issn=0021-9258|pàgines=13045–13052|volum=277|exemplar=15|doi=10.1074/jbc.m110636200|nom=Xi|cognom=Chen|nom2=Jingshi|cognom2=Shen|nom3=Ron|cognom3=Prywes}}</ref><ref>{{Ref-publicació|article=ER stress signaling by regulated proteolysis of ATF6|url=https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1046202304002373|publicació=Methods|data=2005-04-01|issn=1046-2023|pàgines=382–389|volum=35|exemplar=4|doi=10.1016/j.ymeth.2004.10.011|nom=Jingshi|cognom=Shen|nom2=Ron|cognom2=Prywes}}</ref><ref>{{Ref-publicació|article=ER Stress Induces Cleavage of Membrane-Bound ATF6 by the Same Proteases that Process SREBPs|url=https://doi.org/10.1016/S1097-2765(00)00133-7|publicació=Molecular Cell|data=2000-12|issn=1097-2765|pàgines=1355–1364|volum=6|exemplar=6|doi=10.1016/s1097-2765(00)00133-7|nom=Jin|cognom=Ye|nom2=Robert B|cognom2=Rawson|nom3=Ryutaro|cognom3=Komuro|nom4=Xi|cognom4=Chen|nom5=Utpal P|cognom5=Davé}}</ref>

Quan les proteases site-1 i site-2 tallen la p90ATF6 ([[proteòlisi]]), l'extrem N-terminal esdevé una proteïna nuclear de 50 kDa, la p50ATF6, que està formada per uns 370 aminoàcids i conté el factor de transcripció tant per la família bZip, com per la xaperona GRP78 entre d'altres<ref name=":1" /><ref>{{Ref-publicació|article=Mammalian Transcription Factor ATF6 Is Synthesized as a Transmembrane Protein and Activated by Proteolysis in Response to Endoplasmic Reticulum Stress|url=https://www.molbiolcell.org/doi/10.1091/mbc.10.11.3787|publicació=Molecular Biology of the Cell|data=1999-11|issn=1059-1524|pmc=PMC25679|pmid=10564271|pàgines=3787–3799|volum=10|exemplar=11|doi=10.1091/mbc.10.11.3787|llengua=en|nom=Kyosuke|cognom=Haze|nom2=Hiderou|cognom2=Yoshida|nom3=Hideki|cognom3=Yanagi|nom4=Takashi|cognom4=Yura|nom5=Kazutoshi|cognom5=Mori}}</ref><ref>{{Ref-publicació|article=Unfolded protein response and cell death after depletion of brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein GBF1|url=https://pnas.org/doi/full/10.1073/pnas.0712224105|publicació=Proceedings of the National Academy of Sciences|data=2008-02-26|issn=0027-8424|pmc=PMC2268553|pmid=18287014|pàgines=2877–2882|volum=105|exemplar=8|doi=10.1073/pnas.0712224105|llengua=en|nom=Carmen|cognom=Citterio|nom2=Alessandro|cognom2=Vichi|nom3=Gustavo|cognom3=Pacheco-Rodriguez|nom4=Angel M.|cognom4=Aponte|nom5=Joel|cognom5=Moss}}</ref>.


== Funcions ==
== Funcions ==
Línia 17: Línia 24:


== Referències ==
== Referències ==
# Entry - *605537 - ACTIVATING TRANSCRIPTION FACTOR 6; ATF6 - OMIM [Internet]. Omim.org. [citado el 22 de octubre de 2023]. Disponible en: <nowiki>https://www.omim.org/entry/605537</nowiki>
# «Entrez Gene: ATF6 activating transcription factor 6».
# Okada T, Haze K, Nadanaka S, Yoshida H, Seidah NG, Hirano Y, et al. A Serine protease inhibitor prevents endoplasmic reticulum stress-induced cleavage but not transport of the membrane-bound transcription factor ATF6. J Biol Chem [Internet]. 2003 [citado el 22 de octubre de 2023];278(33):31024–32. Disponible en: <nowiki>https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12782636/</nowiki>
# Jheng J-R, Lau K-S, Lan Y-W, Horng J-T. A novel role of ER stress signal transducer ATF6 in regulating enterovirus A71 viral protein stability. J Biomed Sci [Internet]. 2018;25(1). Disponible en: <nowiki>http://dx.doi.org/10.1186/s12929-018-0412-x</nowiki>
# Haze K, Yoshida H, Yanagi H, Yura T, Mori K. Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress. Molecular Biology of the Cell. 1999 Nov;10(11):3787-3799. DOI: 10.1091/mbc.10.11.3787. PMID: 10564271; PMCID: PMC25679.
# Chen X, Shen J, Prywes R. The luminal domain of ATF6 senses endoplasmic reticulum (ER) stress and causes translocation of ATF6 from the ER to the Golgi. J Biol Chem [Internet]. 2002;277(15):13045–52. Disponible en: <nowiki>http://dx.doi.org/10.1074/jbc.m110636200</nowiki>
# Shen J, Prywes R. ER stress signaling by regulated proteolysis of ATF6. Methods [Internet]. 2005;35(4):382–9. Disponible en: <nowiki>http://dx.doi.org/10.1016/j.ymeth.2004.10.011</nowiki>
# Ye J, Rawson RB, Komuro R, Chen X, Davé UP, Prywes R, et al. ER stress induces cleavage of membrane-bound ATF6 by the same proteases that process SREBPs. Mol Cell [Internet]. 2000;6(6):1355–64. Disponible en: <nowiki>http://dx.doi.org/10.1016/s1097-2765(00)00133-7</nowiki>
# Haze K, Yoshida H, Yanagi H, Yura T, Mori K. Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress. Mol Biol Cell [Internet]. 1999;10(11):3787–99. Disponible en: <nowiki>http://dx.doi.org/10.1091/mbc.10.11.3787</nowiki>
# Citterio C, Vichi A, Pacheco-Rodriguez G, Aponte AM, Moss J, Vaughan M. Unfolded protein response and cell death after depletion of brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein GBF1. Proc Natl Acad Sci U S A [Internet]. 2008;105(8):2877–82. Disponible en: <nowiki>http://dx.doi.org/10.1073/pnas.0712224105</nowiki>
# Hillary RF, FitzGerald U. A lifetime of stress: ATF6 in development and homeostasis. J Biomed Sci. 2018 May 25;25(1):48. doi: 10.1186/s12929-018-0453-1. PMID: 29801500; PMCID: PMC5968583.
# Hillary RF, FitzGerald U. A lifetime of stress: ATF6 in development and homeostasis. J Biomed Sci. 2018 May 25;25(1):48. doi: 10.1186/s12929-018-0453-1. PMID: 29801500; PMCID: PMC5968583.
# https://repositorio.uchile.cl/bitstream/handle/2250/194649/Rol-del-eje-ATF6-en-la-frecuencia-y-maduraci%C3%B3n-de%20c%C3%A9lulas-dendr%C3%ADticas-en-tejidos.pdf?sequence=1
# https://repositorio.uchile.cl/bitstream/handle/2250/194649/Rol-del-eje-ATF6-en-la-frecuencia-y-maduraci%C3%B3n-de%20c%C3%A9lulas-dendr%C3%ADticas-en-tejidos.pdf?sequence=1

Revisió del 00:30, 23 oct 2023

El factor de trancripció activador 6, també conegut com a ATF6 (de les seves sigles en anglès Activating Transcription Factor 6), és una proteïna codificada pel gen atf6, present únicament en mamífers[1]. Forma part d'una família de factors de transcripció que activen gens involucrats a la resposta contra proteïnes mal plegades (UPR)[2].

Estructura i localització

L’ATF6, presenta dues possibles conformacions en funció de l’estrès induït al reticle endoplasmàtic. En condicions normals, el factor de trancripció activador 6 és una glicoproteïna de membrana de tipus 2 que es troba incorporada al RE gràcies a interaccions entre la seva cua luminal i la xaperona Bip/GRP78, d'aquesta manera, l’extrem N-terminal queda al costat citosòlic i el C-terminal al lumen[3]. Té un pes molecular de 90 kDa, per aquesta raó també s’anomena p90ATF6[4]. Dins del 670 aminoàcids que la conformen, l’ATF6 presenta múltiples dominis funcionals; una cremallera de leucina que permet la seva unió al DNA, un domini d'activació transcripcional situat a l'extrem N-terminal, que consta de 370 aminoàcids i actua com a factor de trancripció per cremalleres de leucina bàsiques de la família bZip i per xaperones com la GRP78, seqüències de localització per l'aparell de golgi, un domini transmembrana de 21 aminoàcids hidrofòbics i dues zones destinadess a ser tallades per proteases site-1 i site-2[4][5][6][7]

Quan les proteases site-1 i site-2 tallen la p90ATF6 (proteòlisi), l'extrem N-terminal esdevé una proteïna nuclear de 50 kDa, la p50ATF6, que està formada per uns 370 aminoàcids i conté el factor de transcripció tant per la família bZip, com per la xaperona GRP78 entre d'altres[5][8][9].

Funcions

L’ATF6 té com a funció principal la protecció de la cèl·lula mitjançant la síntesi de xaperones. Quan la cèl·lula es troba en situacions d’estrés al reticle endoplasmàtic (RE), degut a una acumulació de proteïnes mal plegades en el lumen d’aquest, l’ATF6 s’activa per tal de sintetitzar XBP1 que farà front a aquesta situació, tot aquest procés forma part de la UPR (Unfolded Protein Response).

A l'ATF6 també se li atribueixen funcions d'homeostasi dels teixits corporals, activant-se i actuant de manera protectora en patologies vasculars o isquèmiques fent que es redueixi la magnitud del teixit afectat.

Regulació de l'estrés (UPR)

Via Metabòlica

Participa en la resposta de proteïnes mal plegades (Unfolded Protein Response), que és la resposta adaptativa induïda per l'estrès del RE. Les tres vies de senyalització principals de l'UPR són: l'IRE1, el PERK i l'ATF6. Aquestes proteïnes transmembrana del RE transmeten senyals des del citosol cap al nucli per a restaurar la capacitat de plegament de proteïnes del RE a través de diverses rutes metabòliques.

En condicions bàsiques, l'ATF6 es troba a la membrana del RE i codifica un factor de transcripció bZIP en el seu domini citosòlic. En condicions d'estrès del RE, ATF6 es transloca a l'aparell de Golgi on és processat per les proteases S1P i S2P, alliberant el domini citoplasmàtic ATF6f. ATF6f regula la transcripció de gens UPR com ara XBP1, CHOP, xaperones i proteïnes involucrades en la secreció.

Referències

  1. Entry - *605537 - ACTIVATING TRANSCRIPTION FACTOR 6; ATF6 - OMIM [Internet]. Omim.org. [citado el 22 de octubre de 2023]. Disponible en: https://www.omim.org/entry/605537
  2. Okada T, Haze K, Nadanaka S, Yoshida H, Seidah NG, Hirano Y, et al. A Serine protease inhibitor prevents endoplasmic reticulum stress-induced cleavage but not transport of the membrane-bound transcription factor ATF6. J Biol Chem [Internet]. 2003 [citado el 22 de octubre de 2023];278(33):31024–32. Disponible en: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12782636/
  3. Jheng J-R, Lau K-S, Lan Y-W, Horng J-T. A novel role of ER stress signal transducer ATF6 in regulating enterovirus A71 viral protein stability. J Biomed Sci [Internet]. 2018;25(1). Disponible en: http://dx.doi.org/10.1186/s12929-018-0412-x
  4. Haze K, Yoshida H, Yanagi H, Yura T, Mori K. Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress. Molecular Biology of the Cell. 1999 Nov;10(11):3787-3799. DOI: 10.1091/mbc.10.11.3787. PMID: 10564271; PMCID: PMC25679.
  5. Chen X, Shen J, Prywes R. The luminal domain of ATF6 senses endoplasmic reticulum (ER) stress and causes translocation of ATF6 from the ER to the Golgi. J Biol Chem [Internet]. 2002;277(15):13045–52. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1074/jbc.m110636200
  6. Shen J, Prywes R. ER stress signaling by regulated proteolysis of ATF6. Methods [Internet]. 2005;35(4):382–9. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1016/j.ymeth.2004.10.011
  7. Ye J, Rawson RB, Komuro R, Chen X, Davé UP, Prywes R, et al. ER stress induces cleavage of membrane-bound ATF6 by the same proteases that process SREBPs. Mol Cell [Internet]. 2000;6(6):1355–64. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1016/s1097-2765(00)00133-7
  8. Haze K, Yoshida H, Yanagi H, Yura T, Mori K. Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress. Mol Biol Cell [Internet]. 1999;10(11):3787–99. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1091/mbc.10.11.3787
  9. Citterio C, Vichi A, Pacheco-Rodriguez G, Aponte AM, Moss J, Vaughan M. Unfolded protein response and cell death after depletion of brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein GBF1. Proc Natl Acad Sci U S A [Internet]. 2008;105(8):2877–82. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1073/pnas.0712224105
  10. Hillary RF, FitzGerald U. A lifetime of stress: ATF6 in development and homeostasis. J Biomed Sci. 2018 May 25;25(1):48. doi: 10.1186/s12929-018-0453-1. PMID: 29801500; PMCID: PMC5968583.
  11. https://repositorio.uchile.cl/bitstream/handle/2250/194649/Rol-del-eje-ATF6-en-la-frecuencia-y-maduraci%C3%B3n-de%20c%C3%A9lulas-dendr%C3%ADticas-en-tejidos.pdf?sequence=1
  12. https://idus.us.es/bitstream/handle/11441/64781/BARROSO%20PECERO%2C%20LAURA.pdf?sequence=1&isAllowed=y
  1. ↑ «[https://www.omim.org/entry/605537 Entry - *605537 - ACTIVATING TRANSCRIPTION FACTOR 6; ATF6 - OMIM]» (en anglès americà). [Consulta: 22 octubre 2023].
  2. ↑ «ATF6 activating transcription factor 6 [Homo sapiens (human) - Gene - NCBI]». [Consulta: 22 octubre 2023].
  3. ↑ Jheng, Jia-Rong; Lau, Kean-Seng; Lan, Yueh-Wen; Horng, Jim-Tong «A novel role of ER stress signal transducer ATF6 in regulating enterovirus A71 viral protein stability». Journal of Biomedical Science, 25, 1, 31-01-2018, pàg. 9. DOI: 10.1186/s12929-018-0412-x. ISSN: 1423-0127. PMC: PMC5793394. PMID: 29386036.
  4. ↑ 4,0 4,1 Haze, K; Yoshida, H; Yanagi, H; Yura, T; Mori, K «Mammalian transcription factor ATF6 is synthesized as a transmembrane protein and activated by proteolysis in response to endoplasmic reticulum stress». Molecular biology of the cell, 10, 11, 01-11-1999, pàg. 3787–3799. DOI: 10.1091/mbc.10.11.3787. ISSN: 1939-4586. PMID: 10564271.
  5. ↑ 5,0 5,1 Chen, Xi; Shen, Jingshi; Prywes, Ron «The Luminal Domain of ATF6 Senses Endoplasmic Reticulum (ER) Stress and Causes Translocation of ATF6 from the ER to the Golgi». Journal of Biological Chemistry, 277, 15, 2002-04, pàg. 13045–13052. DOI: 10.1074/jbc.m110636200. ISSN: 0021-9258.
  6. ↑ Shen, Jingshi; Prywes, Ron «ER stress signaling by regulated proteolysis of ATF6». Methods, 35, 4, 01-04-2005, pàg. 382–389. DOI: 10.1016/j.ymeth.2004.10.011. ISSN: 1046-2023.
  7. ↑ Ye, Jin; Rawson, Robert B; Komuro, Ryutaro; Chen, Xi; Davé, Utpal P «ER Stress Induces Cleavage of Membrane-Bound ATF6 by the Same Proteases that Process SREBPs». Molecular Cell, 6, 6, 2000-12, pàg. 1355–1364. DOI: 10.1016/s1097-2765(00)00133-7. ISSN: 1097-2765.
  8. ↑ Haze, Kyosuke; Yoshida, Hiderou; Yanagi, Hideki; Yura, Takashi; Mori, Kazutoshi «Mammalian Transcription Factor ATF6 Is Synthesized as a Transmembrane Protein and Activated by Proteolysis in Response to Endoplasmic Reticulum Stress» (en anglès). Molecular Biology of the Cell, 10, 11, 1999-11, pàg. 3787–3799. DOI: 10.1091/mbc.10.11.3787. ISSN: 1059-1524. PMC: PMC25679. PMID: 10564271.
  9. ↑ Citterio, Carmen; Vichi, Alessandro; Pacheco-Rodriguez, Gustavo; Aponte, Angel M.; Moss, Joel «Unfolded protein response and cell death after depletion of brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein GBF1» (en anglès). Proceedings of the National Academy of Sciences, 105, 8, 26-02-2008, pàg. 2877–2882. DOI: 10.1073/pnas.0712224105. ISSN: 0027-8424. PMC: PMC2268553. PMID: 18287014.
Obtingut de «https://ca.wikipedia.org/w/index.php?title=ATF6&oldid=32588478»