Alphen aan den Rijn és un municipi de la província d'Holanda Meridional, al sud dels Països Baixos. El març de 2015 tenia 107.447 habitants repartits sobre una superfície de 132,49 km² (dels quals 5,91 km² corresponen a aigua). Limita al nord amb Kaag en Braassem i Nieuwkoop, a l'oest amb Rijnwoude i al sud amb Boskoop i Bodegraven.
L'1 de gener de 2014 s'hi va unir els antics municipis de Rijnwoude i Boskoop.