PERK
 |
Aquest article o secció s'està elaborant i està inacabat. Un viquipedista hi està treballant i és possible que trobeu defectes de contingut o de forma. Comenteu abans els canvis majors per coordinar-los. Aquest avís és temporal: es pot treure o substituir per {{incomplet}} després d'uns dies d'inactivitat. |
 | |
| Substància | Proteïna cinasa sensible a l'estrès del reticle endoplasmàtic |
|---|---|
| Massa molecular | 125,216 Da |
| Nombre EC | 2.7.11.1 |
| Locus | Cr. 2 p11.2 |
| Identificadors | |
| Símbol | PERK EIF2AK3, PEK, WRS, Factor d'iniciació de traducció eucariota alfa-2 3-cinasa, PRKR-like endoplasmic reticulum kinase, pancreatic eIF-2alpha kinase, PKR-like ER kinase |
| HUGO | 3255 |
| Entrez | 9451 |
| OMIM | 604032 |
| RefSeq | NP_004827.4 |
| UniProt | Q9NZJ5 |
| PDB | RCSB PDB |
Eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 3 (EIF2AK3) és una proteïna que també es pot anomenar com a protein kinase R (PKR)-like endoplasmic reticulum kinase (PERK). És un enzim codificat pel gen EIF2AK3 humà situat al cromosoma 2 (2p11.2). Aquest enzim es troba a la membrana del reticle endoplasmàtic i participa de manera molt important en el mecanisme de resposta a proteïnes desplegades (UTR).[1]
Pertany a la família de proteïnes cinases de serina/treonina (subfamília GCN2) i tot i que està present en molts teixits cel·lulars, però és especialment actiu en teixits secretors. Cal destacar que la seva activitat, que consisteix a fosforilar la subunitat alfa del factor d'iniciació de la traducció eucariota (EIF2α), és induïda per l'estrès del reticle endoplasmàtic.
El gen EI2FAK3 té 17 exons i codifica per aquesta proteïna transmembrana de 1116 aminoàcids i un pes molecular de 125,216 Da. El domini luminal és el que detecta pertorbacions en el plegament de les proteïnes del reticle endoplasmàtic, probablement gràcies a la seva interacció amb HSPA5/BIP.[2]
Interacció[modifica]
PERK, en cèl·lules en repòs, forma dímers amb HSPA5/BIP, però en cèl·lules en estrès oligomeritza, és a dir, una alteració en el plegament de la proteïna en el reticle endoplasmàtic (RE) causa que HSPA5/BIP es dissociïn reversiblement de PERK. Això causa que el domini N-terminal de PERK situat al lumen del RE oligomeritzi, provocant la transautofosforilació del domini quinasa C-terminal situat al citoplasma en diversos residus (inclós Thr-982 que es troba al bucle d'activació de la quinasa). Per tant, l'estrès del RE promou l'activació del domini quinasa de PERK.[3]
A més a més, també interactua amb DNAJC3 i MFN2 per similitud, amb TMEM33, PDIA6 i amb LACC1.
Funcions[modifica]
Resposta a l'estrès del reticle[modifica]
PERK és una proteïna quinasa la qual juga un paper fonamental davant de la resposta d'estrès del reticle endoplasmàtic (UPR)[4], hi intervé juntament amb ATF6 i IRE1. Quan hi ha estrès del reticle s’inicia la resposta UPR que té com a objectius disminuir la síntesi de proteïnes, augmentar la quantitat de reticle endoplasmàtic i augmentar la capacitat de degradació de proteïnes malplegades, d'aquesta manera ajuda al reticle en situació d'estrès evitant la sobrecàrrega.
PERK, en condicions normals, es troba inactiva, tapada per BiP una xaperona que es troba al lumen del RE. En absència de BiP, PERK té tendència a dimeritzar i, quan ho fa, s’activa l’activitat quinasa citosòlica que reconeix EIF2alfa. EIF2alfa és un dels punts de control per la síntesi de proteïnes en cèl·lules eucariotes, quan hi ha una disminució en el consum d’aminoàcids (acumulació de proteïnes), EIF2alfa es fosforila i forma un complex que impedeix la unió del Met-tRNA a la subunitat 40S del ribosoma de manera que s’inhibeix la traducció i impedeix la síntesi de proteïnes. Per tant, sota una situació d'estrés de reticle, PERK fosforil·la EIF2alfa de manera que s’inhibeix la síntesi proteica de manera global i s’aconsegueix que entri menor quantitat de proteïna al reticle. A més, la fosforilació de EIF2alfa dona lloc a l’augment de traducció d’alguns mRNA, com ATF4, que activarà transcripció de XB1, entre d'altres xaperones-UPR. Una activació sostinguda de ATF4 acaba induint la transcripció del gen CHOP que activa altres gens com GADD34. A la llarga, si aquests gens estan molt activats, s’indueix l’apoptosi.
Per tant, PERK actua quan hi ha estrès del reticle sobre vies traduccionals, en la fosforilació de EIF2alfa, i en vies transcripcionals, promovent la transcripció de gens determinats.
Processament de la insulina[modifica]
Diversos estudis recents utilitzant cèl·lules in vitro i in vivo, han demostrat que nivells baixos de PERK en les cèl·lules beta pancreàtiques les fa més sensibles a l’apoptosi induïda pel reticle. Això és degut a que les cèl·lules beta pancreàtiques estan constantment produïnt proteïnes fet que fa que hagin de tenir més quantitat de PERK al reticle al ser més susceptibles a partir estrés.
PERK intervé en el processament de la insulina controlant les concentracions de xaperones del reticle endoplasmàtic incloent BiP i ERp72.[5] S’ha vist que una davallada en els nivells de PERK comporta la pujada dels nivells de mRNA de xaperones del reticle com BiP i ERp72. Si aquestes xaperones es troben sobreexpressades es produeix l’agregació de proinsulina al reticle i l'apoptosi de les cèl·lules beta pancreàtiques comportant alteracions en el metabolisme de la insulina.
Promou la immunosupressió[modifica]
PERK actua en la resposta inflamatòria promovent la immunosupressió a través d'una reprogramació metabòlica dels macròfags que afavoreix el fenotip M2, és a dir, el fenotip immunosupressor.
La resposta UPR està comunament associada al manteniment de la proteostasi però troballes recents mostren que l'activació d'aquesta via està associada al desenvolupament i funció de les cèl·lules immunitàries.[6]
La pèrdua de la senyalització de PERK impedeix la respiració mitocondrial i la oxidació lipídica crítica en macròfags M2, per tant la presència de PERK afavoreix aquest fenotip significant que l'estrès de reticle augmenta l'expressió de fenotips immunosupressors en cèl·lules immunitàries. A més, no només es promou aquest fenotip immunosupressor sinó que també provoca una reactivació de l'activitat anti-tumoral.[7]
Tot i això, PERK no és l'únic factor que contribueix a l'activació dels macròfags M2 sinó que actua conjuntament amb l'activació de la biosíntesi de Serina mediada pel gen PSAT1. Per tant, podem dir que la modificació epigenètica que afavoreix el fenotip immunosupressor d'aquests macròfags ve mediada per una via que anomenem PERK-ATF4-PSAT1.
Biosíntesi de Serina[modifica]
PERK és capaç d'induir la biosíntesi de la serina a través d'ATF4. Això és degut a que la serina és capaç d'aportar unitats d'un sol carboni utilitzades durant la biosíntesi de novo de nucleòtids, la expansió de cèl·lules T i les cèl·lules tumorals. A més, la disponibilitat de serina és essencial per mantenir la funció i homeòstasi mitocondrial ja que els lípids que deriven d'aquest aminoàcid son molt importants per mantenir el metabolisme dels mitocondris i la seva privació comporta la desfragmentació i altera el metabolisme dels àcids grassos.
Per tant, com l'activació de PERK comporta una reactivació de l'ambient tumoral i les cèl·lules necessitaran proliferar, hi haurà un augment en aquests processos on haurà d'intervenir la serina i, per aquest motiu, es veurà augmentada la seva biosíntesi.
Malalties associades[modifica]
Degut a la participació de PERK en diferents vies metabòliques la seva deficiència o sobreexpressió pot comportar canvis en la regulació d'aquestes vies i, per tant, comportar l'aparició de malalties.
Disminució dels nivells de PERK[modifica]
Totes aquelles mutacions que comporten una pèrdua de funció de PERK provoquen l’aparició de diabetis neonatal permanent degut a una agregació severa de proinsulina al reticle endoplasmàtic provocada per la sobreexpressió de xaperones.
Mutacions al gen (EIF2AK3)[modifica]
Principalment la mutació al gen que codifica pel factor PERK causa el síndrome de Wolcott-Rallison. Aquesta malaltia està caracteritzada per diabetis mellitus neonatal permanent amb displàsia epifisària múltiple i altres manifestacions clíniques, inclosos episodis recurrents de insuficiència hepàtica aguda.[8]
A més podem veure afectacions al fetge a nivell molecular.
Inhibidors de PERK[modifica]
PERK és un component essencial de la UPR, com ja s’ha comentat anteriorment, ajuda a l’homeòstasi de la cèl·lula davant l'estrès del RE per acumulació de proteïnes mal plegades. Tot i això, la sobreactivació prolongada d’aquesta via s’associa amb malalties neurodegeneratives i algun tipus de càncer ja que promou la supervivència de les cèl·lules canceroses i, per tant, la proliferació tumoral.
Per aquesta raó s’han estudiat varis inhibidors de PERK; els quals inhibeixen l’expressió d'aquesta proteïna quinasa. Els diversos inhibidors són:
- GSK2606414: és el primer inhibidor selectiu descobert de l’enzim PERK. És una molècula dirigida a la zona d’unió d’ATP de la proteïna cinasa en la seva fórmula inactiva DFG evitant la seva fosforilació. És de biodisponibilitat oral i penetració a la barrera hematoencefàlica. En un estudi realitzant amb ratolins va resultar que el tractament realitzat amb GSK2606414 era neuroprotector en aquests ratolins contra el dany causat per prions, i va impedir el desenvolupament de dèficits cognitius i altres manifestacions clíniques de la malaltia priònica.
- ISRIB (inhibidor integrat de la resposta a l’estrès): és un fàrmac experimental que reverteix els efectes de la fosforilació de eIF2α i, conseqüentment, inhibeix la formació de grànuls d'estrès. És un fàrmac que travessa la barrera hematoencefàlica fàcilment. A més, proves realitzades al 2017 indiquen que el fàrmac experimental millora la capacitat dels ratolins amb lesions cerebrals per aprendre i formar records en proves de memòria.
- GSK2656157: és un altre fàrmac inhibidor de PERK seleccionat recentment pel seu desenvolupament preclínic.
Referències[modifica]
Jumper, J et al. Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold. Nature (2021).
Varadi, M et al. AlphaFold Protein Structure Database: massively expanding the structural coverage of protein-sequence space with high-accuracy models. Nucleic Acids Research (2021).
Bettigole SE, Glimcher LH. Endoplasmic reticulum stress in immunity. Annu Rev Immunol. 2015
- ↑ «PERK (human)». [Consulta: 30 abril 2024].
- ↑ «UniProt». [Consulta: 30 abril 2024].
- ↑ «AlphaFold Protein Structure Database». [Consulta: 30 abril 2024].
- ↑ Heather P, Harding «Perk Is Essential for Translational Regulation and Cell Survival during the Unfolded Protein Response». Molecular Cell, Volume 5, Issue 5, 2000, pàg. Pages 897-904.
- ↑ Sowers, Carrie R.; Wang, Rong; Bourne, Rebecca A.; McGrath, Barbara C.; Hu, Jingjie «The protein kinase PERK/EIF2AK3 regulates proinsulin processing not via protein synthesis but by controlling endoplasmic reticulum chaperones». The Journal of Biological Chemistry, 293, 14, 06-04-2018, pàg. 5134–5149. DOI: 10.1074/jbc.M117.813790. ISSN: 1083-351X. PMC: 5892574. PMID: 29444822.
- ↑ Raines, Lydia N.; Zhao, Haoxin; Wang, Yuzhu; Chen, Heng-Yi; Gallart-Ayala, Hector «PERK is a critical metabolic hub for immunosuppressive function in macrophages». Nature Immunology, 23, 3, 2022-03, pàg. 431–445. DOI: 10.1038/s41590-022-01145-x. ISSN: 1529-2916. PMC: 9112288. PMID: 35228694.
- ↑ Pratap, Uday P.; Vadlamudi, Ratna K. «PERK promotes immunosuppressive M2 macrophage phenotype by metabolic reprogramming and epigenetic modifications through the PERK-ATF4-PSAT1 axis» (en anglès). Immunometabolism, 4, 3, 2022-07, pàg. e00007. DOI: 10.1097/IN9.0000000000000007. ISSN: 2633-0407.
- ↑ Julier, Cécile; Nicolino, Marc «Wolcott-Rallison syndrome». Orphanet Journal of Rare Diseases, 5, 04-11-2010, pàg. 29. DOI: 10.1186/1750-1172-5-29. ISSN: 1750-1172. PMC: 2991281. PMID: 21050479.