Variant Gamma del SARS-CoV-2

De la Viquipèdia, l'enciclopèdia lliure
Nombre total de seqüències P.1 per països a partir del 21 d'abril de 2021[1]
Llegenda:
  Més de 1.000 seqüències confirmades
  500–999 seqüències confirmades
  100-499 seqüències confirmades
  2–99 seqüències confirmades
  1 seqüència confirmada
  Cap o sense informació disponible

La variant Gamma, també coneguda com a llinatge P.1,[a] és una variant preocupant del SARS-CoV-2, el virus que provoca la COVID-19.[6] Aquesta variant de SARS-CoV-2 ha rebut el nom de llinatge P.1 i té 17 canvis d'aminoàcids, deu dels quals es troben en la seva proteïna S, inclosos aquests tres designats per ser particularment preocupants: N501Y, E484K i K417T.[5][7] Aquesta variant de SARS-CoV-2 va ser detectada per primera vegada per l'Institut Nacional de Malalties Infeccioses del Japó, el 6 de gener de 2021 en quatre persones que havien arribat a Tòquio després d'haver visitat l'Amazones, quatre dies abans.[5][8] Posteriorment es va declarar que circulava al Brasil.[5] Sota l'esquema de noms simplificat proposat per l'Organització Mundial de la Salut, P.1 ha estat etiquetat com a variant Gamma.[9]

La Gamma va causar una infecció generalitzada a principis del 2021 a la ciutat de Manaus, la capital d'Amazones, tot i que la ciutat ja havia experimentat una infecció generalitzada, el maig del 2020,[10] amb un estudi,[11] que indicà una elevada seroprevalència d'anticossos contra el SARS-CoV-2.[12] Un article de recerca publicat al Science Journal indica que les persones malaltes de la P.1 tenen més possibilitats de transmissibilitat i mort que les infectades amb el B.1.1.28.

El llinatge P.1 comprèn les dues subvariants diferents 28-AM-1 i 28-AM-2, que ambdues porten les mutacions K417T, E484K, N501Y, i ambdues es desenvolupen independentment les unes de les altres dins de la mateixa regió brasilera de l'Amazones.[13]

La Gamma és notablement diferent de l'altra variant Zeta brasilera (llinatge P.2). En particular, la Zeta només porta la mutació E484K i no té cap de les altres dues mutacions preocupants, N501Y i K417T.[13][7]

Notes[modifica]

  1. ↑ Altres noms inclouen:
    – 20J/501Y.V3
    – Variant preocupant 202101/02 (VOC-202101/02)[2]
    – Variant brasilera or Variant del Brasil[3][4][5]

Perfil genètic[modifica]

  • Mutacions d'aminoàcids de la variant gamma del SARS-CoV-2 representades en un mapa del seu genoma amb un enfocament en l'espícula.[14]
    Mutacions d'aminoàcids de la variant gamma del SARS-CoV-2 representades en un mapa del seu genoma amb un enfocament en l'espícula.[14]

Referències[modifica]

  1. ↑ «Lineage P.1».
  2. ↑ Public Health England. «Variants: distribution of cases data» (en anglès), 27-02-2021.
  3. ↑ «Covid-19: Brazil virus already in UK 'not variant of concern', scientist says», 15-01-2021.
  4. ↑ «COVID-19: Virologist says Brazilian coronavirus variant detected in UK is not the one 'of concern'», 15-01-2021.
  5. ↑ 5,0 5,1 5,2 5,3 ; Claro, Ingra Morales«Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings» (en anglès), 12-01-2021.
  6. ↑ «Third concerning coronavirus variant should be a 'wake up call' to the world, experts warn». The Telegraph, 12-01-2021.
  7. ↑ 7,0 7,1 Covid-19 Genomics UK Consortium. «COG-UK Report on SARS-CoV-2 Spike mutations of interest in the UK», 15-01-2021.
  8. ↑ «Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil». Japan Today [Japan], 11-01-2021.
  9. ↑ «Tracking SARS-CoV-2 variants» (en anglès).
  10. ↑ Matt Rivers. «Is a new coronavirus variant to blame for this Brazilian city's collapse?», 28-01-2021.
  11. ↑ Buss, Lewis F.; Prete, Carlos A.; Abrahim, Claudia M. M.; Mendrone, Alfredo; Salomon, Tassila; de Almeida-Neto, Cesar; França, Rafael F. O.; Belotti, Maria C.; Carvalho, Maria P. S. S. «Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic». Science. American Association for the Advancement of Science, 371, 6526, 08-12-2020, pàg. 288–292. DOI: 10.1126/science.abe9728. ISSN: 0036-8075. PMC: 7857406. PMID: 33293339.
  12. ↑ Sabino, Ester C.; Buss, Lewis F.; Carvalho, Maria P. S.; Prete, Carlos A.; Crispim, Myuki A. E.; Fraiji, Nelson A.; Pereira, Rafael H. M.; Parag, Kris V.; Peixoto, Pedro da Silva «Resurgence of COVID-19 in Manaus, Brazil, despite high seroprevalence» (en anglès). The Lancet, 397, 10273, 27-01-2021, pàg. 452–455. DOI: 10.1016/S0140-6736(21)00183-5. ISSN: 0140-6736. PMC: 7906746. PMID: 33515491.
  13. ↑ 13,0 13,1 Oliver T.R. Toovey, Kirsty N. Harvey, Paul W. Bird, and Julian Wei-Tze Wei-Tze Tang «Introduction of Brazilian SARS-CoV-2 484K.V2 related variants into the UK». Elsevier Public Health Emergency Collection, 82, 5, 03-02-2021, pàg. e23–e24. DOI: 10.1016/j.jinf.2021.01.025. PMC: 7857057. PMID: 33548358.
  14. ↑ Spike Variants: Gamma variant, aka P.1, B.1.1.28.1, 20J/501Y.V3 variant, and K417T/E484K/N501Y 24 June 2021, covdb.stanford.edu, accessed 1 July 2021
Obtingut de «https://ca.wikipedia.org/w/index.php?title=Variant_Gamma_del_SARS-CoV-2&oldid=30779496»