A l'estiu, Shaquille O'Neal fou traspassat a Miami Heat degut a l'enfrontament i les disputes que existien amb Kobe Bryant. Phil Jackson també deixà la banqueta dels Lakers, sent substituït per Rudy Tomjanovich; l'equip quedaria fora dels playoffs per cinquena vegada en la seva història.
Chicago Bulls es classificà per als playoffs, fet que no succeïa des de 1998. Després de començar la temporada amb un balanç negatiu de 0-9, canvià la ratxa. La seva plantilla, amb Ben Gordon, Eddy Curry, Kirk Hinrich i Luol Deng, era de les més joves de la història.
Washington Wizards aconseguí entrar en els playoffs per primer cop des que canvià el seu nom de Bullets pel de Wizards, a la temporada 1997-98.
Els equips en negreta van avançar fins a la següent ronda. Els números a l'esquerra de cada equip indiquen la posició de l'equip en la seva conferència, i els números a la dreta indiquen el nombre de partits que l'equip va guanyar en aquesta ronda. Els campions de divisió estan marcats per un asterisc. L'avantatge de pista local no pertany necessàriament a l'equip de posició més alta al seu grup, sinó a l'equip amb un millor rècord a la temporada regular; els equips que gaudeixen de l'avantatge de casa es mostren en cursiva.