Variants del SARS-CoV-2: diferència entre les revisions

De la Viquipèdia, l'enciclopèdia lliure
Contingut suprimit Contingut afegit
Robot estandarditza i catalanitza referències, catalanitza dates i fa altres canvis menors
Línia 7: Línia 7:


{| class="wikitable sortable"
{| class="wikitable sortable"
! colspan="3" |Primera detecció
! colspan="4" |Identificació<ref name="who-update-latest"/>
! colspan="6" |Genètica i identificació
! colspan="3" |Emergència
! colspan="8" |Canvis relatius a les variants que circulaven prèviament en el moment i el lloc d'emergència
! colspan="3" |Evidència de canvis clínics<wbr/>{{efn-ua|"—" denota que no es va poder trobar cap font fiable que cités.}}
|-
|-
! Ubicació
! Data
! Distribució
!Etiqueta de l'[[Organització Mundial de la Salut|OMS]]
!Etiqueta de l'[[Organització Mundial de la Salut|OMS]]
! Llinatge [[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGOLIN]]<ref name="pango-lineages"/>
![[Llinatge (biologia)|Llinatge]] [[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGO]]
!Variant [[Public Health England|PHE]] <wbr />{{efn-ua|El format del nom es va actualitzar el març de 2021, canviant l'any de 4 a 2 dígits i el mes de 2 dígits a 3 lletres, per exemple, VOC-'''2021'''''01''-02 to VOC-'''21'''''JAN''-02.<ref name="phe-voc" />}}
! [[Nextstrain|Clade Nextstrain]]<wbr/><ref name="nextstrain">{{ref-web|url=https://nextstrain.org/ |títol=Nextstrain |website=nextstrain.org |editor=[[Nextstrain]]}}</ref><ref name="cdc-variants"/>
![[Clade]] [[Nextstrain]]
! Variant
!Primer [[Brot epidèmic|brot]]
[[Public Health England|PHE]]<wbr />{{efn-ua|El format de denominació es va actualitzar el març de 2021, canviant l'any de 4 a 2 dígits i el mes de 2 dígits a una abreviatura de 3 lletres. Per exemple, VOC-'''2021'''''01''-02 convertit a VOC-'''21'''''JAN''-02.<ref name="phe-voc" />}}
![[Diagnòstic de laboratori d'infeccions víriques|Mostra]] més antiga<wbr/><ref name="who-update-latest"/>
! Altres noms
!Variant designada de preocupació
! Mutacions notables
!Mutacions notables
![[Nombre reproductiu bàsic|Transmissibilitat]]
![[Nombre reproductiu bàsic|Transmissibilitat]]
![[Atenció hospitalària|Hospitalització]]
![[Virulència]]
![[Taxa de mortalitat|Mortalitat]]
![[Immunogenicitat|Antigenicitat]]
!Precisió de la [[Prova diagnòstica de la COVID-19|prova]]
![[Escapament antigènic|Immunitat contra la reinfecció]]<wbr/>{{efn-ua|name=neutralization-efficacy|Tret que s'indiqui el contrari, es refereix a l'activitat dels [[anticossos neutralitzants]], que és un [[correlats d'immunitat/correlats de protecció|correlat d'immunitat]]. La majoria d'estudis encara no han determinat l'impacte real de la neutralització reduïda sobre l'eficàcia.}}
![[Eficàcia d'una vacuna|Eficàcia de les vacunes]]<wbr/>{{efn-ua|name=neutralization-efficacy}}
!Eficàcia dels [[anticossos monoclonals]]<wbr/><ref name="cdc-variants"/>{{efn-ua|name=neutralization-efficacy}}
|-
|-
|{{sort|1|[[Variant Alfa del SARS-CoV-2|Alfa]]}}
|{{nowrap|{{Flag|Regne Unit}}}}
|B.1.1.7
|Feb 2020<wbr/><ref name="pango-lineages" />
|VOC‑20DEC‑01<wbr />
|{{risk|level=high|align=ml|Global}}
|20I (V1)
|Alfa
|[[Lineage B.1.1.7|B.1.1.7]]
|[[Regne Unit]]
|{{dts|20|9|2020}}<wbr/><ref>{{cite web |vauthors=Rambaut A, Loman N, Pybus O, Barclay W, Barrett J, Carabelli A, Connor T, Peacock T, Robertson DL, Volz E |display-authors=6 |date=2020-12-18 |title=Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations |url=https://virological.org/t/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations/563 |access-date=2021-06-14 |website=Virological}}</ref>
|20I/501Y.V1
|{{dts|18|12|2020}}<wbr/><ref>{{cite techreport |type=Briefing |title=Investigation of novel SARS-COV-2 variant, technical briefing 1 |institution=Public Health England |date=2020-12-21 |url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959438/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf |format=PDF |access-date=2021-06-06}}</ref>
|VOC-20DEC-01<wbr/>{{efn-ua|B.1.1.7 amb E484K es designa per separat VOC-21FEB-02}}
|69–70del, N501Y, P681H<wbr /><ref name=":33">{{cite web|date=2021-01-28|title=Emerging SARS-CoV-2 Variants|url=https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/more/science-and-research/scientific-brief-emerging-variants.html|access-date=2021-01-04|website=CDC.gov|publisher=Centers for Disease Control and Prevention|type=Science brief}} {{PD-notice}}</ref>{{sfnp|Chand ''et al.''|2020|p=6|loc=Potential impact of spike variant N501Y}}
|—
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|{{Estimate|+82|43|130|unit=%|type=cri|mini=auto}}<wbr/>{{efn-ua|name=alpha-transmissibility|1 de març - 24 de desembre de 2020, Anglaterra.<ref name="pmid33658326">{{cite journal| author=Davies NG, Abbott S, Barnard RC, Jarvis CI, Kucharski AJ, Munday JD | display-authors=etal| title=Estimated transmissibility and impact of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in England. | journal=Science | year= 2021 | volume= 372 | issue= 6538 | pages= eabg3055| pmid=33658326 | doi=10.1126/science.abg3055 | pmc=8128288 }}</ref>}}}}
|N501Y, 69–70del, P681H<wbr/><ref name=":3" />{{sfnp|Chand ''et al.''|2020|p=6|loc=Potential impact of spike variant N501Y}}
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|{{Estimate|+52|47|57|unit=%|mini=auto}}<wbr/>{{efn-ua|name=alpha-severity|23 de novembre de 2020 - 31 de gener de 2021, Anglaterra.<ref>{{cite journal |vauthors=Nyberg T, Twohig KA, Harris RJ, Seaman SR, Flannagan J, Allen H, Charlett A, Angelis D, Dabrera G, Presanis AM |display-authors=6 |date=2021-06-15 |title=Risk of hospital admission for patients with SARS-CoV-2 variant B.1.1.7: cohort analysis |url=https://www.bmj.com/content/373/bmj.n1412 |journal=BMJ |volume=373 |pages=n1412 |doi=10.1136/bmj.n1412 |issn=1756-1833 |pmid=34130987|s2cid=235187479 }}</ref>}}}}
|{{risk|level=high|align=ml|{{Estimate|74|unit=%|prefix=sym|mini=auto}} més alt<wbr/><ref name="volz">{{cite techreport |last1=Volz |first1=Erik |last2=Mishra |first2=Swapnil |last3=Chand |first3=Meera |last4=Barrett |first4=Jeffrey |last5=Johnson |first5=Robert |last6=Geidelberg |first6=Lily |last7=Hinsley |first7=Wes |last8=Laydon |first8=Daniel |last9=Dabrera |first9=Gavin |last10=O’Toole |first10=Áine |last11=Amato |first11=Roberto |last12=Ragonnet-Cronin |first12=Manon |last13=Harrison |first13=Ian |last14=Jackson |first14=Ben |last15=Ariani |first15=Cristina |last16=Boyd |first16=Olivia |last17=Loman |first17=Nicholas |last18=McCrone |first18=John |last19=Gonçalves |first19=Sónia |last20=Jorgensen |first20=David |last21=Myers |first21=Richard |last22=Hill |first22=Verity |last23=Jackson |first23=David |last24=Gaythorpe |first24=Katy |last25=Groves |first25=Natalie |last26=Sillitoe |first26=John |last27=Kwiatkowski |first27=Dominic |last28=Flaxman |first28=Seth |last29=Ratmann |first29=Oliver |last30=Bhatt |first30=Samir |last31=Hopkins |first31=Susan |last32=Gandy |first32=Axel |last33=Rambaut |first33=Andrew |last34=Ferguson |first34=Neil |display-authors=6 |date=2021-01-04 |title=Transmission of SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7 in England: Insights from linking epidemiological and genetic data |url=http://medrxiv.org/lookup/doi/10.1101/2020.12.30.20249034 |via=[[medRxiv]] |type=[[Preprint]] |doi=10.1101/2020.12.30.20249034 |hdl=10044/1/85239 |hdl-access=free |access-date=2021-03-22}}</ref>}}
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|{{Estimate|+59|44|74|unit=%|mini=auto}}<wbr/>{{efn-ua|name=alpha-severity}}}}
|{{risk|level=high|align=ml|{{Estimate|64|32|104|unit=%|prefix=sym|mini=auto}} més letal<wbr/><ref>{{ref-publicació|cognom1=Challen |nom1=Robert |cognom2=Brooks-Pollock |nom2=Ellen |cognom3=Read |nom3=Jonathan |cognom4=Dyson |nom4=Louise |cognom5=Tsaneva-Atanasova |nom5=Krasimira |cognom6=Danon |nom6=Leon |data=2021-03-10 |títol=Risk of mortality in patients infected with SARS-CoV-2 variant of concern 202012/1: matched cohort study |url=https://www.bmj.com/content/372/bmj.n579 |publicació=[[The BMJ]] |volum=372 |id=n579 |doi=10.1136/bmj.n579 |issn=1756-1833 |pmc=7941603 |pmid=33687922 |access-date=2021-03-22}}</ref>}}
|{{risk|level=low|align=ml|Sense evidència de canvi<wbr/><ref name="ECDC1" />}}
|{{risk|level=low|align=ml|Sense canvis<wbr/><ref name="aci-variants"/>}}
|{{risk|level=low|align=ml|Mínima reducció <wbr/><ref name="cdc-variants"/>}}
|{{risk|level=low|align=ml|Mínima reducció <wbr/><ref name="cdc-variants"/>}}
|{{risk|level=low|align=ml|Sense canvis}}
|-
|-
|{{sort|2|[[Variant Beta del SARS-CoV-2|Beta]]}}
|{{Flag|Nigèria}}
|B.1.351
|Ago 2020<wbr/><ref name="pango-b-1-1-207">{{ref-web|url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.1.207.html |títol=Lineage B.1.1.207 |website=cov-lineages.org |editor=[[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|Pango]] team |access-date=2021-03-11}} Graphic shows B.1.1.207 detected in Peru, Germany, Singapore, Hong Kong, Vietnam, Costa Rica, South Korea, Canada, Australia, Japan, France, Italy, Ecuador, Mexico, UK and the USA.</ref>
|VOC‑20DEC‑02
|{{risk|level=medium|align=ml|Internacional}}
|20H (V2)
|
|[[Sud-Àfrica]]
|B.1.1.207
|{{dts|-|5|2020}}
|—
|{{dts|14|1|2021}}<wbr/><ref>{{cite techreport |type=Note |title=NERVTAG paper: brief note on SARS-CoV-2 variants |institution=Public Health England |date=2021-01-13 |last1=Horby |first1=Peter |last2=Barclay |first2=Wendy |last3=Huntley |first3=Catherine |url=https://www.gov.uk/government/publications/nervtag-brief-note-on-sars-cov-2-variants-13-january-2021 |access-date=2021-06-06}}</ref>
|—
|K417N, E484K, N501Y<wbr /><ref name=":33"/>
|—
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|{{Estimate|+52|46|58|unit=%|mini=auto}}<wbr/>{{efn-ua|1 d'agost - 31 de desembre de 2020, Regne Unit.<ref>{{cite journal |vauthors=Zhao S, Lou J, Cao L, Zheng H, Chong MK, Chen Z, Chan RN, Zee BC, Chan PK, Wang MH |display-authors=6 |date=2021-01-28 |title=Quantifying the transmission advantage associated with N501Y substitution of SARS-CoV-2 in the UK: an early data-driven analysis |url=https://doi.org/10.1093/jtm/taab011 |journal=Journal of Travel Medicine |volume=28 |issue=2 |doi=10.1093/jtm/taab011 |issn=1195-1982 |pmc=7928809 |pmid=33506254}}</ref> Another study found {{Estimate|+50|20|113|unit=%|type=cri|mini=auto}} in May – November 2020 in South Africa.<ref name="ECDC1"/>}}}}
|P681H<wbr/><ref name=":3" />
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|{{risk|level=low|align=ml|Sense evidència de canvi}}<wbr/><ref name="biotecnika">{{ref-notícia|cognom=S |nom=Sruthi |data=2021-02-10 |títol=Notable Variants And Mutation Of SARS-CoV-2 |url=https://www.biotecnika.org/2021/02/variants-mutations-of-sars-cov-2-a-complete-list/ |obra=BioTecNika |access-date=2021-03-22}}</ref>
|{{risk|level=medium|align=ml|Possiblement augmentada<wbr/><ref name="aci-variants"/><ref name="who-update-8june">{{cite techreport |type=Situation report |title=Weekly epidemiological update on COVID-19 - 8 June 2021 |institution=World Health Organization |date=2021-06-08 |url=https://www.who.int/publications/m/item/weekly-epidemiological-update-on-covid-19---8-june-2021 |access-date=2021-06-14}}</ref>}}
|{{risk|level=low|align=ml|Sense evidència de canvi}}<wbr/><ref name="biotecnika"/>
|{{risk|level=unknown|align=ml|''Sota imvestigació''}}
|{{risk|level=low|align=ml|Sense canvis<wbr/><ref name="aci-variants"/>}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Reduïda, la resposta dels limfòcits T de D614G és eficaç<wbr/><ref name="cdc-variants"/><ref name="who-update-8june"/>}}
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|Eficàcia reduïda per a moltes<wbr/>{{efn-ua|Excepte Moderna i Johnson & Johnson.<ref name="aci-variants"/><ref name="who-update-8june"/>}}}}
|{{risk|level=low|align=ml|Retinguda per alguns}}
|-
|-
|{{sort|3|[[Variant Gamma del SARS-CoV-2|Gamma]]}}
|{{Flag|Estats Units}}
|P.1
|Jun 2020<wbr/><ref name="Pango B.1.429 (A)">{{ref-web|url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.429.html |títol=Lineage B.1.429 |website=cov-lineages.org |editor=[[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|Pango]] team |access-date=2021-03-19}} Graphic shows B.1.429 detected in the USA, Mexico, Canada, the UK, France, Denmark, Australia, Taiwan, Japan, South Korea, Australia, New Zealand, Guadeloupe, and Aruba.</ref>
|VOC‑21JAN‑02
|{{risk|level=medium|align=ml|Internacional}}
|20J (V3)
|Epsilon
|[[Brasil]]
|B.1.429, B.1.427<wbr/><ref name="aci-variants"/>
|{{dts|-|11|2020}}
|20C/S:452R
|{{dts|15|1|2021}}<wbr/><ref>{{cite news |title=Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK |location=Friday 15 January |url=https://www.gov.uk/government/news/confirmed-cases-of-covid-19-variants-identified-in-uk |agency=Public Health England |publisher=GOV.UK |date=2021-01-15}}</ref><ref>{{cite techreport |last1=Horby |first1=Peter |last2=Barclay |first2=Wendy |last3=Gupta |first3=Ravi |last4=Huntley |first4=Catherine |type=Note |title=NERVTAG paper: note on variant P.1 |institution=Public Health England |date=2021-01-27 |url=https://www.gov.uk/government/publications/nervtag-note-on-variant-p1-27-january-2021 |access-date=2021-06-06}}</ref>
|K417T, E484K, N501Y<wbr /><ref name=":33"/>
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|{{Estimate|+161|145|176|unit=%|mini=auto}}<wbr/>{{efn-ua|1 de novembre de 2020 - 31 de gener de 2021, Manaus.<ref>{{cite document | vauthors = Coutinho RM, Marquitti FM, Ferreira LS, Borges ME, da Silva RL, Canton O, Portella TP, Lyra SP, Franco C, Plucinski MM, Lessa FC |display-authors=6 |date=2021-03-23 |title=Model-based estimation of transmissibility and reinfection of SARS-CoV-2 P.1 variant |url=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.03.03.21252706v3 |work=[[medRxiv]] |type=[[Preprint]] |doi=10.1101/2021.03.03.21252706 |page=9 |s2cid=232119656 |quote=The new variant was found to be about 2.6 times more transmissible (95% Confidence Interval (CI): 2.4–2.8) than previous circulating variant(s). ... Table 1: Summary of the fitted parameters and respective confidence intervals considering the entire period, November 1, 2020-January 31, 2021 maintaining the same pathogenicity of the previous variant. Parameter: Relative transmission rate for the new variant. Estimate: 2.61. 2.5%: 2.45. 97.5%: 2.76. |access-date=2021-04-29}}</ref> Un altre estudi a Manaus ha estimat que pot ser el llinatge P.1 {{Estimate|100|70|140|50|unit=%|type=cri|mini=auto}}{{efn-ua|name=low-confidence}} més transmissible.<ref name="cadde-p1"/>}}}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Possiblement augmentada<wbr/><ref name="who-update-8june"/>}}
|{{risk|level=high|align=ml|{{Estimate|+50|20|90|50|unit=%|type=cri|mini=auto}}<wbr/>{{efn-ua|name=low-confidence|La [[interval de confiança|confiança]] o la [[Interval de credibilitat|credibilitat]] notificats tenen una baixa probabilitat, de manera que el valor estimat només es pot entendre com a possible, no segur ni probable.}}{{efn-ua|Març 2020 - febrer 2021, Manaus.<ref name="cadde-p1" /> Els resultats preliminars d’un estudi a la regió sud del Brasil van trobar que el llinatge P.1 augmenta molt més la mortalitat per a joves sans. En els grups sense condicions preexistents, es va trobar que la variant augmentava la mortalitat {{Estimate|490|220|985|unit=%|mini=auto}} per als homes del grup d'edat de 20 a 39 anys, {{Estimate|465|190|1003|unit=%|mini=auto}} per a dones del grup d’edat de 20 a 39 anys i {{Estimate|670|401|1083|unit=%|mini=auto}} per a dones del grup d'edat de 40 a 59 anys.<ref>{{cite document |vauthors=Freitas AR, Lemos DR, Beckedorff OA, Cavalcanti LP, Siqueira AM, Mello RC, Barros EN |display-authors=6 |date=2021-04-19 |title=The increase in the risk of severity and fatality rate of covid-19 in southern Brazil after the emergence of the Variant of Concern (VOC) SARS-CoV-2 P.1 was greater among young adults without pre-existing risk conditions |url=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.04.13.21255281v1 |type=[[Preprint]] |work=[[medRxiv]] |doi=10.1101/2021.04.13.21255281 |s2cid=233295278 |quote=Female 20 to 39 years old, with no pre-existing risk conditions, were at risk of death 5.65 times higher in February (95% CI, 2.9-11.03; p <0.0001) and in the age group of 40 and 59 years old, this risk was 7.7 times higher (95% CI, 5.01-11.83; p <0.0001) comparing with November–December. ... The heterogeneity observed between the age groups was greater when we analyzed the subgroup of the population without preexisting risk conditions where we found that the CFR in the female sex in the second wave was 1.95 times (95% CI, 1.38-2.76) the CFR of the first wave in the population over 85 years old and was 7.7 times (95% CI, 5.01-11.83; p < 0.0001) in the population between 40 and 59 years old. In the male population without previous diseases, the CFR in the second wave was 2.18 (95% CI, 1.62-2.93) times the CFR of the first wave in the population over 85 years old and 5.9 (95% CI, 3.2-10.85; p < 0, 0001) higher in the range between 20 and 39 years old.}}</ref>{{efn-ua|name=different-conditions}}}}}}
|{{risk|level=low|align=ml|Sense canvis<wbr/><ref name="aci-variants"/>}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Reduïda<wbr/><ref name="cdc-variants"/>}}
|{{risk|level=low|align=ml|Retinguda per moltes<wbr/>{{efn-ua|Excepte Pfizer–BioNTech.<ref name="aci-variants"/>}}}}
|{{risk|level=low|align=ml|Retinguda per alguns}}
|-
|{{sort|1.1|[[Variant Alfa del SARS-CoV-2|Alfa]]}}
|B.1.1.7 with [[SARS-CoV-2 Alpha variant#E484K mutation|E484K]]<wbr/><ref name="PHE2102">{{Cite web|last=Public Health England|date=16 February 2021|title=Variants: distribution of cases data|url=https://www.gov.uk/government/publications/covid-19-variants-genomically-confirmed-case-numbers/variants-distribution-of-cases-data|url-status=live|access-date=2021-02-17|website=GOV.UK}}</ref>
|VOC‑21FEB‑02
|20I (V1)
|[[Regne Unit]]
|{{dts|26|1|2021}}<wbr/><ref>{{cite techreport |type=Briefing |title=Investigation of novel SARS-CoV-2 variant 202012/01, technical briefing 5 |id=GW-1905 |institution=Public Health England |date=2021-02-02 |url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/959426/Variant_of_Concern_VOC_202012_01_Technical_Briefing_5.pdf |format=PDF |access-date=2021-06-14}}</ref>
|{{dts|5|2|2021}}<wbr/><ref name="GW-1934">{{cite techreport |type=Briefing |title=Investigation of SARS-CoV-2 variants of concern in England, technical briefing 6 |id=GW-1934 |institution=Public Health England |date=2021-02-13 |url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/961299/Variants_of_Concern_VOC_Technical_Briefing_6_England-1.pdf |format=PDF |access-date=2021-06-06}}</ref>
|69–70del, E484K, N501Y, P681H<ref name=":33"/>{{sfnp|Chand ''et al.''|2020|p=6|loc=Potential impact of spike variant N501Y}}
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|{{Estimate|+82|43|130|unit=%|type=cri|mini=auto}}<wbr/>{{efn-ua|name=same-alpha|Se suposa que és el mateix que Alpha.<ref name="ecdc-variants"/>}}{{efn-ua|name=alpha-transmissibility}}}}
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|{{Estimate|+52|47|57|unit=%|mini=auto}}<wbr/>{{efn-ua|name=same-alpha}}{{efn-ua|name=alpha-severity}}}}
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|{{Estimate|+59|44|74|unit=%|mini=auto}}<wbr/>{{efn-ua|name=same-alpha}}{{efn-ua|name=alpha-severity}}}}
|{{risk|level=low|align=ml|Sense canvis<wbr/>{{efn-ua|name=same-alpha}}}}
|{{risk|level=high|align=ml|Considerablement reduïda<wbr/><ref name="b117e484k"/>}}
|{{risk|level=high|align=ml|Considerablement reduïda<wbr/><ref name="b117e484k">{{cite journal|vauthors= Collier DA, De Marco A, Gupta RK, et al|title=Sensitivity of SARS-CoV-2 B.1.1.7 to mRNA vaccine-elicited antibodies.|doi=10.1038/s41586-021-03412-7|date=2021-05-06|journal=[[Nature (journal)|Nature]] |volume=593 |issue=7857|pages=136–141 |pmid=33706364|type=Published |quote=We therefore generated pseudoviruses that carried the B.1.1.7 spike mutations with or without the additional E484K substitution and tested these against sera obtained after the first and second dose of the BNT162b2 mRNA vaccine as well as against convalescent sera. After the second vaccine dose, we observed a considerable loss of neutralizing activity for the pseudovirus with the B.1.1.7 spike mutations and E484K (Fig. 3d, e). The mean fold change for the E484K-containing B.1.1.7 spike variant was 6.7 compared with 1.9 for the B.1.1.7 variant, relative to the wild-type spike protein (Fig. 3a–c and Extended Data Fig. 5). Similarly, when we tested a panel of convalescent sera with a range of neutralization titres (Fig. 1f, g and Extended Data Fig. 5), we observed additional loss of activity against the mutant B.1.1.7 spike with E484K, with fold change of 11.4 relative to the wild-type spike protein (Fig. 3f, g and Extended Data Fig. 5).|doi-access=free}}</ref>}}
|{{risk|level=low|align=ml|Retinguda per alguns<wbr/><ref name="b117e484k"/>}}
|-
|{{sort|5|Èpsilon}}
|B.1.429, B.1.427
|—
|—
|21C
|CAL.20C<wbr/><ref name="B.1.429 other names">{{ref-notícia|data=2021-02-11 |títol=Southern California COVID-19 Strain Rapidly Expands Global Reach |url=https://www.cedars-sinai.org/newsroom/southern-california-covid-19-strain-rapidly-expands-global-reach/ |obra=[[Cedars-Sinai Medical Center|Cedars-Sinai]] Newsroom |lloc=[[Los Angeles]] |access-date=2021-03-17}}</ref>
|[[Estats Units]]
|I4205V, D1183Y, S13I, W152C, L452R
|{{dts|-|3|2020}}
|{{risk|level=medium|align=ml|{{Estimate|20|unit=%|prefix=sym|mini=auto}} més alt<wbr/><ref name="cdc-variants"/>}}
|{{dts|17|3|2021}}<wbr/><ref>{{cite news |last=Azad |first=Arman |title=Coronavirus strains first detected in California are officially 'variants of concern,' CDC says |url=https://edition.cnn.com/2021/03/17/health/california-variants-of-concern-cdc/index.html |work=CNN |date=2021-03-17 |access-date=2021-06-06}}</ref>
|{{risk|align=ml|''Sota investigació''}}
|L452R<wbr /><ref name=":33" />
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|Reducció moderada a greu de la neutralització<ref name="CaliNews">{{ref-notícia| vauthors = Wadman M |data=2021-02-23 |títol=California coronavirus strain may be more infectious - and lethal |url=https://www.sciencemag.org/news/2021/02/coronavirus-strain-first-identified-california-may-be-more-infectious-and-cause-more |doi=10.1126/science.abh2101 |obra=[[Science (journal)|Science]] News |access-date=2021-03-17}}</ref>}}
|{{risk|level=medium|align=ml|{{Estimate|+20|19|24|unit=%|mini=auto}}<wbr/>{{efn-ua|Setembre 2020 - Gener 2021, California.<ref name="cdc-variants"/><ref>{{cite journal | vauthors = Deng X, Garcia-Knight MA, Khalid MM, Servellita V, Wang C, Morris MK, Sotomayor-González A, Glasner DR, Reyes KR, Gliwa AS, Reddy NP, Sanchez San Martin C, Federman S, Cheng J, Balcerek J, Taylor J, Streithorst JA, Miller S, Kumar GR, Sreekumar B, Chen PY, Schulze-Gahmen U, Taha TY, Hayashi J, Simoneau CR, McMahon S, Lidsky PV, Xiao Y, Hemarajata P, Green NM, Espinosa A, Kath C, Haw M, Bell J, Hacker JK, Hanson C, Wadford DA, Anaya C, Ferguson D, Lareau LF, Frankino PA, Shivram H, Wyman SK, Ott M, Andino R, Chiu CY | display-authors = 6 | title = Transmission, infectivity, and antibody neutralization of an emerging SARS-CoV-2 variant in California carrying a L452R spike protein mutation | via = [[medRxiv]]| date = 9 March 2021 | pmid = 33758899 | pmc = 7987058 | doi = 10.1101/2021.03.07.21252647 | type = [[Preprint]] | url = https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.03.07.21252647v1.full-text }}</ref> Overtaken by Alpha.<ref name="NYTimes 17May"/>}}}}
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Moderadament reduïda<wbr/>{{efn-ua|name=sciencemag-20c|1 de setembre de 2020 i 29 de gener, California.<ref name="CaliNews">{{cite news | vauthors = Wadman M |date=2021-02-23 |title=California coronavirus strain may be more infectious – and lethal |url=https://www.sciencemag.org/news/2021/02/coronavirus-strain-first-identified-california-may-be-more-infectious-and-cause-more |doi=10.1126/science.abh2101 |work=[[Science (journal)|Science]] News |access-date=2021-03-17}}</ref>}}}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Moderadament reduïda<wbr/>{{efn-ua|name=sciencemag-20c}}}}
|{{risk|level=high|align=ml|Reduïda per a alguns, implicacions desconegudes}}
|-
|-
|{{sort|4|[[Variant Delta del SARS-CoV-2|Delta]]}}
|{{Flag|Dinamarca}}
|B.1.617.2
|Set 2020<wbr/><ref>{{ref-notícia|data=2020-11-06 |títol=SARS-CoV-2 mink-associated variant strain - Denmark |url=https://www.who.int/csr/don/06-november-2020-mink-associated-sars-cov2-denmark/en/ |obra=[[World Health Organization|WHO]] Disease Outbreak News |access-date=2021-03-19}}</ref>
|VOC‑21APR‑02<wbr/>
|{{risk|level=eliminated|align=ml|Probablement extingit<wbr/><ref name=sum19nov>{{ref-notícia|data=2020-11-19 |títol=De fleste restriktioner lempes i Nordjylland |trans-title=Most restrictions eased in North Jutland |url=https://sum.dk/nyheder/2020/november/de-fleste-restriktioner-lempes-i-nordjylland |llengua=Danish |editorial=[[Ministry of Health (Denmark)]] |citació=Sekventeringen af de positive prøver viser samtidig, at der ikke er påvist yderligere tilfælde af minkvariant med cluster 5 siden den 15. september, hvorfor Statens Serums Institut vurderer, at denne variant med stor sandsynlighed er døet ud. |trans-quote=At the same time, the sequencing of the positive samples shows that no further cases of mink variant with cluster 5 have been detected since 15 September, which is why the Statens Serums Institut assesses that this variant has most likely died out. |access-date=2021-01-16}}</ref>}}
|21A
| colspan="4" {{No attempt|No registrat}}
|[[Índia]]
|[[Cluster 5]], ΔFVI-spike<wbr/><ref name="SSI short report" />
|{{dts|-|10|2020}}
|Y453F, {{nowrap|69–70deltaHV<wbr/><ref name="SSI short report" />}}
|{{dts|6|5|2021}}<wbr/><ref>{{cite techreport |type=Briefing |title=SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England, technical briefing 10 |id=GOV-8226 |institution=Public Health England |date=2021-05-07 |url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/984274/Variants_of_Concern_VOC_Technical_Briefing_10_England.pdf |format=PDF |access-date=2021-06-06}}</ref>
|{{risk|level=unknown|align=ml|—}}
|L452R, T478K, P681R<wbr/><ref name=20A_617/>
|{{risk|level=unknown|align=ml|—}}
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|{{Estimate|+64|26|113|unit=%|mini=auto}} <small>en relació a Alfa</small><wbr/>{{efn-ua|18 de març - 17 de maig de 2021, Anglaterra.<ref>{{cite techreport |type=Briefing |title=SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England, technical briefing 15 |institution=Public Health England |date=2021-06-11 |url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/993879/Variants_of_Concern_VOC_Technical_Briefing_15.pdf |format=PDF |access-date=2021-06-15}}</ref> Un altre estudi preliminar al Japó va trobar que la variant Delta només és un 23% més transmissible que la variant Alfa.<ref>{{cite document |vauthors=Ito K, Piantham C, Nishiura H |date=2021-06-15 |title=Predicted domination of variant Delta of SARS-CoV-2 before Tokyo Olympic games, Japan |url=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.06.12.21258835v1 |type=[[Preprint]] |work=[[medRxiv]]|doi=10.1101/2021.06.12.21258835|s2cid=235437370 }}</ref>{{efn-ua|name=different-conditions|Les diferències poden ser degudes a diferents polítiques i intervencions adoptades en cada àrea estudiada en diferents moments o a la capacitat del sistema de salut local.}}}}}}
|{{risk|level=high|align=ml|Disminució moderada de la sensibilitat als anticossos neutralitzants<wbr/><ref name="WHO">{{ref-web|url=https://www.who.int/csr/don/06-november-2020-mink-associated-sars-cov2-denmark/en/ |títol=SARS-CoV-2 mink-associated variant strain – Denmark |editor=[[World Health Organization]] |access-date= 16 gener 2021 |data= 6 novembre 2020}}</ref>}}
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|{{Estimate|+85|39|147|unit=%|mini=auto}} <small>en relació a Alfa</small><wbr/>{{efn-ua|1 d'abril - 6 de juny de 2021, Escòcia.<ref>{{cite journal |vauthors=Sheikh A, McMenamin J, Taylor B, Robertson C |date=2021-06-14 |title=SARS-CoV-2 Delta VOC in Scotland: demographics, risk of hospital admission, and vaccine effectiveness |url=https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(21)01358-1/abstract |journal=The Lancet |doi=10.1016/S0140-6736(21)01358-1 |issn=0140-6736 |pmid=34139198}}</ref>}}}}
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|{{risk|level=low|align=ml|No hi ha proves de canvis<wbr/><ref name="who-update-8june"/>}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Reduïda<wbr/><ref name="B.1.617 neutralization">{{cite journal |vauthors=Yadav PD, Sapkal GN, Abraham P, Ella R, Deshpande G, Patil DY, Nyayanit DA, Gupta N, Sahay RR, Shete AM, Panda S, Bhargava B, Mohan VK |display-authors=6 |title=Neutralization of variant under investigation B.1.617 with sera of BBV152 vaccinees. |journal=Clinical Infectious Diseases |publisher=Oxford University Press |date=2021-05-07 |issue=ciab411 |doi=10.1093/cid/ciab411 |pmid=33961693 |url=https://academic.oup.com/cid/advance-article-abstract/doi/10.1093/cid/ciab411/6271524 |url-access=subscription |biorxiv=10.1101/2021.04.23.441101}}</ref><ref name="delta-neutralization"/>}}
|{{risk|level=low|align=ml|Mínima reducció d’eficàcia<wbr/><ref name="who-update-8june"/><ref>{{cite techreport |type=Assessment |title=Risk assessment for SARS-CoV-2 variant Delta |id=GOV-8664 |institution=Public Health England |date=2021-06-18 |url=https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/994761/18_June_2021_Risk_assessment_for_SARS-CoV-2_variant_DELTA.pdf |format=PDF |access-date=2021-06-22}}</ref>{{efn-ua|Neutralizació moderadament reduïda amb Covaxin.<wbr/><ref name="B.1.617 neutralization"/>}}}}
|{{risk|level=low|align=ml|Retinguda per alguns<wbr/><ref name="delta-neutralization">{{cite bioRxiv |vauthors=Planas D, Veyer D, Baidaliuk A, Staropoli I, Guivel-Benhassine F, Rajah MM, Planchais C, Porrot F, Robillard N, Puech J, Prot M |display-authors=6 |date=2021-05-27 |title=Reduced sensitivity of infectious SARS-CoV-2 variant B.1.617.2 to monoclonal antibodies and sera from convalescent and vaccinated individuals |biorxiv=10.1101/2021.05.26.445838}}</ref>}}
|-
|-
|{{sort|10|[[Variant Kappa del SARS-CoV-2|Kappa]]}}
|{{Flag|Sud-àfrica}}
|B.1.617.1
|Oct 2020<wbr/><ref name=":3" />
|VUI‑21APR‑01
|{{risk|level=medium|align=ml|Internacional}}
|21B
|Beta
|[[B.1.351]]
|[[Índia]]
|{{dts|-|10|2020}}
|20H/501Y.V2
|VOC-20DEC-02
|501Y.V2<wbr/><ref name="ECDC1">{{cite techreport |type=Risk assessment |title=Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA - first update |url=https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-risk-assessment-spread-new-variants-concern-eueea-first-update |institution=[[European Centre for Disease Prevention and Control]] |date=2021-02-02}}</ref>
|N501Y, K417N, E484K<wbr/><ref name=":3" />
|{{risk|level=high|align=ml|{{Estimate|50|20|113|unit=%|type=cri|prefix=sym|mini=auto}} més alt<wbr/><ref name="ECDC1"/>}}
|{{risk|level=low|align=ml|Sense evidència de canvi}}<wbr/><ref name="biotecnika"/>
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|Reducció significativa de la neutralització per anticossos<wbr/><ref>{{ref-publicació|vauthors=Planas D, Bruel T, Grzelak L, etal |data=2021-04-14 |títol=Sensitivity of infectious SARS-CoV-2 B.1.1.7 and B.1.351 variants to neutralizing antibodies |publicació=Nature Medicine |doi=10.1038/s41591-021-01318-5 |doi-access=free}}</ref><ref>{{ref-web|url=https://www.scmp.com/news/hong-kong/health-environment/article/3130355/coronavirus-sinovac-vaccine-gives-70-cent-less |títol=Coronavirus: Sinovac vaccine gives 70 per cent less protection against South African variant, but Hongkongers urged to still get jab |website=www.scmp.com |data= 20 abril 2021 |access-date= 20 abril 2021}}</ref>}}
|-
|{{Flag|Índia}}
|Oct 2020<wbr/><ref>{{ref-web|títol=PANGO lineages|url=https://cov-lineages.org/lineages/lineage_B.1.617.html|access-date=2021-04-17|website=cov-lineages.org}}</ref>
|{{risk|level=high|align=ml|Global}}
|Delta
|[[Lineage B.1.617|B.1.617]]
|—
|—
|L452R, E484Q, P681R<wbr/><ref>{{Cite news|last1=Nuki|first1=Paul|last2=Newey|first2=Sarah|date=2021-04-16|title=Arrival of India's 'double mutation' adds to variant woes, but threat posed remains unclear|language=en-GB|work=The Telegraph|url=https://www.telegraph.co.uk/global-health/science-and-disease/arrival-indias-double-mutation-adds-variant-woes-threat-posed/|access-date=2021-04-17|issn=0307-1235}}</ref>
|VUI-21APR-01<ref name="IndiaPHE" />
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|—
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|E484Q, L452R, P681R<ref>{{ref-notícia|cognom=Nuki|nom=Paul|cognom2=Newey|nom2=Sarah|data=2021-04-16|títol=Arrival of India’s ‘double mutation’ adds to variant woes, but threat posed remains unclear|llengua=en-GB|obra=The Telegraph|url=https://www.telegraph.co.uk/global-health/science-and-disease/arrival-indias-double-mutation-adds-variant-woes-threat-posed/|access-date=2021-04-17|issn=0307-1235}}</ref>
|{{risk|align=ml|''Sota investigació''}}
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|{{risk|align=ml|''Sota investigació''}}
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Lleugerament reduïda<wbr/><ref name="B.1.617 neutralization"/>}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Lleugera reducció de la neutralització efectiva<ref>{{ref-publicació| vauthors = Yadav PD, Sapkal GN, Abraham P, Ella R, Deshpande G, Patil DY, Nyayanit DA, Gupta N, Sahay RR, Shete AM, Panda S, Bhargava B, Mohan VK | display-authors = 6 |títol= Neutralization of variant under investigation B.1.617 with sera of BBV152 vaccinees |publicació= medRxiv |data= abril 2021 | doi = 10.1101/2021.04.23.441101 | type = [[Preprint]] }}</ref>}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Lleugerament reduïda<wbr/><ref name="B.1.617 neutralization"/>}}
|-
|{{risk|level=medium|align=ml|Possiblement reduïda}}
|{{Flag|Japó}}<br />{{Flag|Brasil}}
|Des 2020<wbr/><ref name="ImmuneEscape" />
|{{risk|level=medium|align=ml|Internacional}}
|Gamma
|[[Lineage P.1|P.1]]
|20J/501Y.V3
|VOC-21JAN-02
|B.1.1.28.1<wbr/><ref>{{ref-web|url=https://cov-lineages.org/global_report_P.1.html |títol=P.1 |website=cov-lineages.org |editor=[[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|Pango]] team |access-date=2021-03-22}}</ref><ref name="aci-variants"/>
|N501Y, E484K, K417T<wbr/><ref name=":3" />
|{{risk|level=veryhigh|align=ml|{{Estimate|152|127|178|unit=%|prefix=sym|mini=auto}} més alt<wbr/><ref>{{ref-publicació|cognom1=Coutinho |nom1=Renato |cognom2=Marquitti |nom2=Flavia |cognom3=Ferreira |nom3=Leonardo |cognom4=Borges |nom4=Marcelo |cognom5=Silva |nom5=Rafael |cognom6=Canton |nom6=Otavio |cognom7=Portella |nom7=Tatiana |cognom8=Lyra |nom8=Silas |cognom9=Franco |nom9=Caroline |last10=Silva |first10=Antonio |last11=Kraenkel |first11=Roberto |display-authors=6 |data=2021-03-09 |títol=Model-based estimation of transmissibility and reinfection of SARS-CoV-2 P.1 variant |url=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.03.03.21252706v2 |via=[[medRxiv]] |type=[[Preprint]] |doi=10.1101/2021.03.03.21252706 |access-date=2021-03-22}}</ref>{{efn-ua|Un altre estudi preliminar<ref name="cadde-p1"/> ha estimat que P.1 pot ser un 140-220% més transmissible, amb un [[interval de credibilitat]] amb una baixa probabilitat del 50%.}}<wbr/>{{Better source needed|date= març 2021|reason=Preprint and not peer reviewed (WP:MEDRS)}}}}
|{{risk|level=medium|align=ml|{{Estimate|45|10|80|50|unit=%|type=cri|prefix=sym|mini=auto}} més letal<wbr/><ref name="cadde-p1" />}}{{efn-ua|L'[[interval de credibilitat]] reportat té una baixa probabilitat de només el 50%, de manera que la letalitat estimada només es pot entendre com a possible, no segura ni probable.}}
|{{risk|level=high|align=ml|Reducció global de la neutralització efectiva<wbr/><ref name="ECDC1" />}}
|-
|-
|{{sort|7|Eta}}
|{{Flag|Regne Unit}}<br />{{Flag|Nigèria}}
|Des 2020<wbr/><ref name="UK" />
|{{risk|level=medium|align=ml|Internacional}}
|Eta
|B.1.525
|B.1.525
|VUI‑21FEB‑03
|20C<wbr/>{{efn-ua|Inclou B.1.525 i B.1.526.<ref name="cdc-variants" />}}
|21D
|VUI-21FEB-03<wbr/>{{efn-ua|Antigament UK1188.}}
|[[Nigèria]]
|{{dts|11|12|2020}}<wbr /><ref>{{cite web |url=https://cov-lineages.org/global_report_B.1.525.html |title=B.1.525 international lineage report |website=cov-lineages.org |publisher=[[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|Pango]] team |access-date=2021-06-04}}</ref><ref name="qc-earliest">{{cite web |type=Software issue |title=Date mismatch between international report and lineage description - cov-lineages/pangolin |url=https://github.com/cov-lineages/pangolin/issues/243 |website=GitHub |date=2021-06-13 |access-date=2021-06-14}}</ref>
|—
|—
|E484K, F888L<wbr /><ref name="Pango B.1.525" />|E484K, F888L<wbr /><ref name="Pango B.1.5253">{{cite web|title=B.1.525|url=https://cov-lineages.org/global_report_B.1.525.html|access-date=2021-03-22|website=cov-lineages.org|publisher=[[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|Pango]] team}}</ref>
|E484K, F888L<wbr/><ref name="Pango B.1.525" />
|{{risk|align=ml|''Sota investigació''}}
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|{{risk|align=ml|''Sota investigació''}}
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Possiblement es redueix la neutralització<wbr/><ref name="cdc-variants"/>}}
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|{{risk|level=unknown|align=ml|''En investigació''}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Possiblement reduïda<wbr/><ref name="cdc-variants"/>}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Possiblement reduïda<wbr/><ref name="cdc-variants"/>}}
|{{risk|level=medium|align=ml|Possiblement reduïda}}
|}
|}

{{notelist-ua}}
{{notelist-ua}}



Revisió del 23:24, 22 juny 2021

El coronavirus 2 de la síndrome respiratòria aguda greu (SARS-CoV-2), el virus que causa la malaltia respiratòria causada per SARS-CoV-2 (COVID-19), té diverses variants notables que es creu o s'ha cregut que tenen una importància especial a causa del seu potencial per augmentar la transmissibilitat, augmentar la virulència i reduir l'eficàcia de les vacunes.[1][2]

Es creu que la seqüència WIV04/2019, pertanyent al clade S de GISAID / llinatge A PANGOLIN / clade 19B de Nextstrain, és la seqüència original que infectà els humans, coneguda com a "seqüència zero", i es coneix àmpliament com a tal i s'utilitza com a seqüència de referència.[3]

Sumari

Hi ha molts llinatges de SARS-CoV-2.[4] La taula següent presenta informació i el nivell de risc per a variants amb un risc elevat o possiblement elevat actualment[5][6][7][8] o en el passat. S'assumeixen uns intervals de confiança o de credibilitat del 95%, tret que s'indiqui el contrari.

Identificació[9] Emergència Canvis relatius a les variants que circulaven prèviament en el moment i el lloc d'emergència
Etiqueta de l'OMS Llinatge PANGO Variant PHE [A] Clade Nextstrain Primer brot Mostra més antiga[9] Variant designada de preocupació Mutacions notables Transmissibilitat Hospitalització Mortalitat Precisió de la prova Immunitat contra la reinfecció[B] Eficàcia de les vacunes[B] Eficàcia dels anticossos monoclonals[5][B]
Alfa B.1.1.7 VOC‑20DEC‑01 20I (V1) Regne Unit Error in Template:Date table sorting: dies ha de ser un nombre enter entre 1 i 31[10] Error in Template:Date table sorting: dies ha de ser un nombre enter entre 1 i 31[11] 69–70del, N501Y, P681H[12][13] +82% (43130%)[C] +52% (4757%)[D] +59% (4474%)[D] Sense canvis[8] Mínima reducció [5] Mínima reducció [5] Sense canvis
Beta B.1.351 VOC‑20DEC‑02 20H (V2) Sud-Àfrica Error in Template:Date table sorting: '-' no és un any vàlid Error in Template:Date table sorting: dies ha de ser un nombre enter entre 1 i 31[16] K417N, E484K, N501Y[12] +52% (4658%)[E] En investigació Possiblement augmentada[8][19] Sense canvis[8] Reduïda, la resposta dels limfòcits T de D614G és eficaç[5][19] Eficàcia reduïda per a moltes[F] Retinguda per alguns
Gamma P.1 VOC‑21JAN‑02 20J (V3) Brasil Error in Template:Date table sorting: '-' no és un any vàlid Error in Template:Date table sorting: dies ha de ser un nombre enter entre 1 i 31[20][21] K417T, E484K, N501Y[12] +161% (145176%)[H] Possiblement augmentada[19] +50% (50% ICr, 2090%)[G][J] Sense canvis[8] Reduïda[5] Retinguda per moltes[K] Retinguda per alguns
Alfa B.1.1.7 with E484K[25] VOC‑21FEB‑02 20I (V1) Regne Unit Error in Template:Date table sorting: dies ha de ser un nombre enter entre 1 i 31[26] Error in Template:Date table sorting: dies ha de ser un nombre enter entre 1 i 31[27] 69–70del, E484K, N501Y, P681H[12][13] +82% (43130%)[L][C] +52% (4757%)[L][D] +59% (4474%)[L][D] Sense canvis[L] Considerablement reduïda[29] Considerablement reduïda[29] Retinguda per alguns[29]
Èpsilon B.1.429, B.1.427 21C Estats Units Error in Template:Date table sorting: '-' no és un any vàlid Error in Template:Date table sorting: dies ha de ser un nombre enter entre 1 i 31[30] L452R[12] +20% (1924%)[M] En investigació En investigació En investigació Moderadament reduïda[N] Moderadament reduïda[N] Reduïda per a alguns, implicacions desconegudes
Delta B.1.617.2 VOC‑21APR‑02 21A Índia Error in Template:Date table sorting: '-' no és un any vàlid Error in Template:Date table sorting: dies ha de ser un nombre enter entre 1 i 31[34] L452R, T478K, P681R[35] +64% (26113%) en relació a Alfa[O] +85% (39147%) en relació a Alfa[P] En investigació No hi ha proves de canvis[19] Reduïda[39][40] Mínima reducció d’eficàcia[19][41][Q] Retinguda per alguns[40]
Kappa B.1.617.1 VUI‑21APR‑01 21B Índia Error in Template:Date table sorting: '-' no és un any vàlid L452R, E484Q, P681R[42] En investigació En investigació En investigació En investigació Lleugerament reduïda[39] Lleugerament reduïda[39] Possiblement reduïda
Eta B.1.525 VUI‑21FEB‑03 21D Nigèria Error in Template:Date table sorting: dies ha de ser un nombre enter entre 1 i 31[43][44] E484K, F888L[46] En investigació En investigació En investigació En investigació Possiblement reduïda[5] Possiblement reduïda[5] Possiblement reduïda
  1. El format del nom es va actualitzar el març de 2021, canviant l'any de 4 a 2 dígits i el mes de 2 dígits a 3 lletres, per exemple, VOC-202101-02 to VOC-21JAN-02.[6]
  2. 2,0 2,1 2,2 Tret que s'indiqui el contrari, es refereix a l'activitat dels anticossos neutralitzants, que és un correlat d'immunitat. La majoria d'estudis encara no han determinat l'impacte real de la neutralització reduïda sobre l'eficàcia.
  3. 3,0 3,1 1 de març - 24 de desembre de 2020, Anglaterra.[14]
  4. 4,0 4,1 4,2 4,3 23 de novembre de 2020 - 31 de gener de 2021, Anglaterra.[15]
  5. 1 d'agost - 31 de desembre de 2020, Regne Unit.[17] Another study found +50% (20113%) in May – November 2020 in South Africa.[18]
  6. Excepte Moderna i Johnson & Johnson.[8][19]
  7. 7,0 7,1 La confiança o la credibilitat notificats tenen una baixa probabilitat, de manera que el valor estimat només es pot entendre com a possible, no segur ni probable.
  8. 1 de novembre de 2020 - 31 de gener de 2021, Manaus.[22] Un altre estudi a Manaus ha estimat que pot ser el llinatge P.1 100% (50% ICr, 70140%)[G] més transmissible.[23]
  9. 9,0 9,1 Les diferències poden ser degudes a diferents polítiques i intervencions adoptades en cada àrea estudiada en diferents moments o a la capacitat del sistema de salut local.
  10. Març 2020 - febrer 2021, Manaus.[23] Els resultats preliminars d’un estudi a la regió sud del Brasil van trobar que el llinatge P.1 augmenta molt més la mortalitat per a joves sans. En els grups sense condicions preexistents, es va trobar que la variant augmentava la mortalitat 490% (220985%) per als homes del grup d'edat de 20 a 39 anys, 465% (1901.003%) per a dones del grup d’edat de 20 a 39 anys i 670% (4011.083%) per a dones del grup d'edat de 40 a 59 anys.[24][I]
  11. Excepte Pfizer–BioNTech.[8]
  12. 12,0 12,1 12,2 12,3 Se suposa que és el mateix que Alpha.[28]
  13. Setembre 2020 - Gener 2021, California.[5][31] Overtaken by Alpha.[32]
  14. 14,0 14,1 1 de setembre de 2020 i 29 de gener, California.[33]
  15. 18 de març - 17 de maig de 2021, Anglaterra.[36] Un altre estudi preliminar al Japó va trobar que la variant Delta només és un 23% més transmissible que la variant Alfa.[37][I]
  16. 1 d'abril - 6 de juny de 2021, Escòcia.[38]
  17. Neutralizació moderadament reduïda amb Covaxin.[39]

Nomenclatura

Taula de nomenclatures corresponents SARS-CoV-2[47]
Llinatges PANGO (cf. (Nomenclatura proposada, Nature)) Notes als llinatges PANGO (cf. (Alm et al.)) Clades (Nextstrain), 2021[48] Clades (GISAID) Variants destacades
A.1–A.6 19B S conté la "seqüència zero"[3]
B.3–B.7, B.9, B.10, B.13–B.16 19A L
O[a]
B.2 V
B.1 B.1.5–B.1.72 20A G Llinatge B.1 en el sistema de nomenclatura de llinatges PANGO
B.1.9, B.1.13, B.1.22, B.1.26, B.1.37 GH
B.1.3–B.1.66 20C Inclou CAL.20C[49]
20G Predominant generalment als EUA, Gener/21[49]
20H Inclou 501.V2 àlies (20C/501Y.V2 o) 20H/501Y.V2 o B.1.351 lineage
B.1.1 20B GR Inclou B.1.1.207
20D Inclou P.1 i P.2[50]
20F
20I Inclou VOC-202012/01 àlies 20B/501Y.V1 llinatge B.1.1.7, i B.1.1.207
B.1.177 20E (EU1)[48] GV[a] Derivat de 20A[48]

No s'ha establert cap nomenclatura coherent per al SARS-CoV-2.[52] Col·loquialment, inclosos els governs i les organitzacions de notícies, sovint es fa referència a les variants pel país on es van identificar per primera vegada.[53][54][55] Finalment, l 'Organització Mundial de la Salut (OMS) va anunciar el 31 de maig de 2021 una notació amb lletres gregues per a evitar qualsevol referència geogràfica i així evitar-ne l'ús polític.[56][57]

Tot i que hi ha molts milers de variants de SARS-CoV-2,[58] els tipus de virus es poden incloure en agrupacions més grans, com ara llinatges o clades. S'han proposat tres nomenclatures principals:[52]

Criteris de notabilitat

Els virus generalment adquireixen mutacions amb el pas del temps, donant lloc a noves variants. Quan sembla que una nova variant creix en una població, es pot etiquetar com a "variant emergent".

Algunes de les possibles conseqüències de les variants emergents són les següents:[64][65]

  • Augment de la transmissibilitat
  • Augment de la morbiditat
  • Augment de la mortalitat
  • Capacitat per eludir la detecció mitjançant proves diagnòstiques
  • Disminució de la susceptibilitat als fàrmacs antivirals (si i quan aquests medicaments estan disponibles)
  • Disminució de la susceptibilitat als anticossos neutralitzants, ja sigui terapèutics (per exemple, plasma convalescent o anticossos monoclonals) o en experiments de laboratori
  • Capacitat per eludir la immunitat natural (per exemple, causar reinfeccions)
  • Capacitat per infectar individus vacunats
  • Augment del risc de patir afeccions particulars com la síndrome inflamatòria multisistema o la COVID persistent.
  • Increment de l'afinitat per grups clínics o demogràfics concrets, com ara nens o individus immunodeprimits.

Les variants que semblen complir un o més d'aquests criteris es poden etiquetar com a "variants d'interès" a l'espera de la verificació i validació d'aquestes propietats. Un cop validades, les "variants d'interès" es poden canviar el nom de "variants d'interès" per les organitzacions de control, com ara les CDC.[66]

Variants notables

Clúster 5

El clúster 5, també anomenat ΔFVI-spike per l'Statens Serum Institut (SSI),[67] va ser descobert al nord de Jutlàndia, Dinamarca, i es creu que es va estendre des de visons a humans a través de granges de visons. El 4 de novembre de 2020 es va anunciar que la població de visons de Dinamarca seria sacrificada per evitar la possible propagació d'aquesta mutació i reduir el risc de noves mutacions.

Llinatge B.1.1.7 / Variant of Concern-202012/0

Detectat al Regne Unit.[68] [69]

Llinatge B.1.1.207

Seqüenciada per primera vegada l'agost de 2020 a Nigèria,[70][71]

Llinatge B.1.1.317

Llinatge B.1.1.318

Llinatge B.1.351

[64] [72]

Llinatge B.1.429 / CAL.20C

[49]

Llinatge B.1.525

[45] [73]

Llinatge B.1.526

Llinatge P.1.617

[74]

Llinatge P.1.618

Llinatge P.1

[75] [23]

Llinatge P.3

Mutacions notables

  • D614G
  • E484K[76][77]
  • N501Y
  • S477G/N
  • P681H
  • E484Q
  • L452R
  • P681R
  • N440K

Origen de les variants

Els investigadors han suggerit que es poden produir múltiples mutacions en el curs de la infecció persistent d'un pacient immunodeprimit, especialment quan el virus desenvolupa mutacions d'escapament sota la pressió de selecció de l'anticòs o del tractament amb plasma convalescent,[78][79] amb les mateixes delecions en els antígens de superfície de forma repetida en diferents pacients.[80]

Referències

  1. 1,0 1,1 En una altra font, GISAID nomena un conjunt de 7 clades sense el clade O però incloent al clade GV.[51]
  1. «Coronavirus variants and mutations: The science explained» (en anglès). BBC News, 06-01-2021.
  2. «New coronavirus variants could cause more reinfections, require updated vaccines». Science. American Association for the Advancement of Science, 15-01-2021. DOI: 10.1126/science.abg6028.
  3. 3,0 3,1 Zhukova, A; Blassel, L; Lemoine, F; Morel, M; Voznica, J; Gascuel, O «Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2». Comptes Rendus Biologie, 24-11-2020, pàg. 1–20. DOI: 10.5802/crbiol.29. PMID: 33274614.
  4. «Lineage descriptions». Pango team.
  5. 5,0 5,1 5,2 5,3 5,4 5,5 5,6 5,7 5,8 «SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions». Centers for Disease Control and Prevention.
  6. 6,0 6,1 «Variants: distribution of cases data». Government Digital Service.
  7. «Global Report Investigating Novel Coronavirus Haplotypes». Pango team.
  8. 8,0 8,1 8,2 8,3 8,4 8,5 8,6 «Living Evidence - SARS-CoV-2 variants». Ministry of Health (New South Wales).
  9. 9,0 9,1 Error de citació: Etiqueta <ref> no vàlida; no s'ha proporcionat text per les refs nomenades who-update-latest
  10. «Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations». Virological, 18-12-2020. [Consulta: 14 juny 2021].
  11. Investigation of novel SARS-COV-2 variant, technical briefing 1 (PDF) (Briefing). Public Health England. 2020-12-21. Retrieved 2021-06-06.
  12. 12,0 12,1 12,2 12,3 12,4 «Emerging SARS-CoV-2 Variants». CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention, 28-01-2021. [Consulta: 4 gener 2021]. Aquest article incorpora text d'aquesta font, la qual és de domini públic.
  13. 13,0 13,1 Chand et al., 2020, p. 6, Potential impact of spike variant N501Y.
  14. Davies NG, Abbott S, Barnard RC, Jarvis CI, Kucharski AJ, Munday JD «Estimated transmissibility and impact of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in England.». Science, vol. 372, 6538, 2021, pàg. eabg3055. DOI: 10.1126/science.abg3055. PMC: 8128288. PMID: 33658326.
  15. «Risk of hospital admission for patients with SARS-CoV-2 variant B.1.1.7: cohort analysis». BMJ, vol. 373, 15-06-2021, pàg. n1412. DOI: 10.1136/bmj.n1412. ISSN: 1756-1833. PMID: 34130987.
  16. Horby, Peter; Barclay, Wendy; Huntley, Catherine (2021-01-13). NERVTAG paper: brief note on SARS-CoV-2 variants (Note). Public Health England. Retrieved 2021-06-06.
  17. «Quantifying the transmission advantage associated with N501Y substitution of SARS-CoV-2 in the UK: an early data-driven analysis». Journal of Travel Medicine, vol. 28, 2, 28-01-2021. DOI: 10.1093/jtm/taab011. ISSN: 1195-1982. PMC: 7928809. PMID: 33506254.
  18. Error de citació: Etiqueta <ref> no vàlida; no s'ha proporcionat text per les refs nomenades ECDC1
  19. 19,0 19,1 19,2 19,3 19,4 19,5 Weekly epidemiological update on COVID-19 - 8 June 2021 (Situation report). World Health Organization. 2021-06-08. Retrieved 2021-06-14.
  20. «Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK». Public Health England. GOV.UK [Friday 15 January], 15-01-2021.
  21. Horby, Peter; Barclay, Wendy; Gupta, Ravi; Huntley, Catherine (2021-01-27). NERVTAG paper: note on variant P.1 (Note). Public Health England. Retrieved 2021-06-06.
  22. Falta indicar la publicació. DOI: 10.1101/2021.03.03.21252706.
  23. 23,0 23,1 23,2 Faria, Nuno; Mellan, Thomas; Whittaker, Charles; Claro, Ingra; Candido, Darlan; Mishra, Swapnil; Crispim, Myuki; Sales, Flavia; Hawryluk, Iwona «Genomics and epidemiology of a novel SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil». Falta indicar la publicació, 03-03-2021. DOI: 10.1101/2021.02.26.21252554. PMC: 7941639. PMID: 33688664. «P.1 can be between 1.4-2.2 (50% BCI, with a 96% posterior probability of being >1) times more transmissible than local non-P1 lineages ... We estimate that infections are 1.1–1.8 (50% BCI, 81% posterior probability of being >1) times more likely to result in mortality in the period following P.1's emergence, compared to before, although posterior estimates of this relative risk are also correlated with inferred cross-immunity»
  24. Falta indicar la publicació. DOI: 10.1101/2021.04.13.21255281.
  25. Public Health England. «Variants: distribution of cases data». GOV.UK, 16-02-2021. [Consulta: 17 febrer 2021].
  26. Investigation of novel SARS-CoV-2 variant 202012/01, technical briefing 5 (PDF) (Briefing). Public Health England. 2021-02-02. GW-1905. Retrieved 2021-06-14.
  27. Investigation of SARS-CoV-2 variants of concern in England, technical briefing 6 (PDF) (Briefing). Public Health England. 2021-02-13. GW-1934. Retrieved 2021-06-06.
  28. Error de citació: Etiqueta <ref> no vàlida; no s'ha proporcionat text per les refs nomenades ecdc-variants
  29. 29,0 29,1 29,2 «Sensitivity of SARS-CoV-2 B.1.1.7 to mRNA vaccine-elicited antibodies.». Nature, vol. 593, 7857, 06-05-2021, pàg. 136–141. DOI: 10.1038/s41586-021-03412-7. PMID: 33706364. «We therefore generated pseudoviruses that carried the B.1.1.7 spike mutations with or without the additional E484K substitution and tested these against sera obtained after the first and second dose of the BNT162b2 mRNA vaccine as well as against convalescent sera. After the second vaccine dose, we observed a considerable loss of neutralizing activity for the pseudovirus with the B.1.1.7 spike mutations and E484K (Fig. 3d, e). The mean fold change for the E484K-containing B.1.1.7 spike variant was 6.7 compared with 1.9 for the B.1.1.7 variant, relative to the wild-type spike protein (Fig. 3a–c and Extended Data Fig. 5). Similarly, when we tested a panel of convalescent sera with a range of neutralization titres (Fig. 1f, g and Extended Data Fig. 5), we observed additional loss of activity against the mutant B.1.1.7 spike with E484K, with fold change of 11.4 relative to the wild-type spike protein (Fig. 3f, g and Extended Data Fig. 5).»
  30. Azad, Arman «Coronavirus strains first detected in California are officially 'variants of concern,' CDC says». CNN, 17-03-2021.
  31. «Transmission, infectivity, and antibody neutralization of an emerging SARS-CoV-2 variant in California carrying a L452R spike protein mutation». , 09-03-2021. DOI: 10.1101/2021.03.07.21252647. PMC: 7987058. PMID: 33758899.
  32. Error de citació: Etiqueta <ref> no vàlida; no s'ha proporcionat text per les refs nomenades NYTimes 17May
  33. «California coronavirus strain may be more infectious – and lethal». Science News, 23-02-2021.
  34. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England, technical briefing 10 (PDF) (Briefing). Public Health England. 2021-05-07. GOV-8226. Retrieved 2021-06-06.
  35. Error de citació: Etiqueta <ref> no vàlida; no s'ha proporcionat text per les refs nomenades 20A_617
  36. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England, technical briefing 15 (PDF) (Briefing). Public Health England. 2021-06-11. Retrieved 2021-06-15.
  37. Falta indicar la publicació. DOI: 10.1101/2021.06.12.21258835.
  38. «SARS-CoV-2 Delta VOC in Scotland: demographics, risk of hospital admission, and vaccine effectiveness». The Lancet, 14-06-2021. DOI: 10.1016/S0140-6736(21)01358-1. ISSN: 0140-6736. PMID: 34139198.
  39. 39,0 39,1 39,2 39,3 «Neutralization of variant under investigation B.1.617 with sera of BBV152 vaccinees.». Clinical Infectious Diseases. Oxford University Press, ciab411, 07-05-2021. DOI: 10.1093/cid/ciab411. PMID: 33961693.
  40. 40,0 40,1 Plantilla:Cite bioRxiv
  41. Risk assessment for SARS-CoV-2 variant Delta (PDF) (Assessment). Public Health England. 2021-06-18. GOV-8664. Retrieved 2021-06-22.
  42. ; Newey, Sarah «Arrival of India's 'double mutation' adds to variant woes, but threat posed remains unclear» (en anglès). The Telegraph, 16-04-2021.
  43. «B.1.525 international lineage report». cov-lineages.org. Pango team. [Consulta: 4 juny 2021].
  44. «Date mismatch between international report and lineage description - cov-lineages/pangolin». GitHub, 13-06-2021. [Consulta: 14 juny 2021].
  45. 45,0 45,1 «B.1.525». Rambaut Group, University of Edinburgh. PANGO Lineages, 15-02-2021.
  46. «B.1.525». cov-lineages.org. Pango team. [Consulta: 22 març 2021].
  47. 47,0 47,1 Alm, E.; Broberg, E. K.; Connor, T.; Hodcroft, E. B.; Komissarov, A. B.; Maurer-Stroh, S.; Melidou, A.; Neher, R. A.; O’Toole, Áine «Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020». Euro Surveillance: Bulletin Europeen Sur les Maladies Transmissibles = European Communicable Disease Bulletin, 25, 32, 2020. DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410. PMC: 7427299. PMID: 32794443.
  48. 48,0 48,1 48,2 ; Hodcroft, Emma B; Neher, Richard A«Updated Nextstrain SARS-CoV-2 clade naming strategy», 06-01-2021.
  49. 49,0 49,1 49,2 Emergence of a novel SARS-CoV-2 strain in Southern California, USA Wenjuan Zhang, Brian Davis, Stephanie S Chen, Jorge Sincuir Martinez, Jasmine T Plummer, Eric Vail 20 January 2021 doi.org/10.1101/2021.01.18.21249786 via www.medrxiv.org, Accessed 21 January 2021
  50. PANGO lineages-Lineage B.1.1.28 cov-lineages.org, accessed 4 February 2021
  51. «clade tree (from 'Clade and lineage nomenclature')», 04-07-2020.
  52. 52,0 52,1 WHO Headquarters. «3.6 Considerations for virus naming and nomenclature». A: SARS-CoV-2 genomic sequencing for public health goals: Interim guidance, 8 January 2021. World Health Organization, 8 gener 2021, p. 6. 
  53. «Don't call it the 'British variant.' Use the correct name: B.1.1.7» (en anglès americà), 09-02-2021.
  54. Flanagan, Ryan. «Why the WHO won't call it the 'U.K. variant', and you shouldn't either» (en anglès), 02-02-2021.
  55. For a list of sources using names referring to the country in which the variants were first identified, see, for example, Talk:South African COVID variant and Talk:U.K. Coronavirus variant.
  56. «Statement on the sixth meeting of the International Health Regulations (2005) Emergency Committee regarding the coronavirus disease (COVID-19) pandemic» (en anglès). [Consulta: 6 juny 2021].
  57. 324cat. «L'OMS simplifica els noms de les variants del coronavirus per evitar estigmes», 02-06-2021. [Consulta: 6 juny 2021].
  58. «Variant analysis of SARS-CoV-2 genomes». Bulletin of the World Health Organization, 98, 7, juny 2020, pàg. 495–504. DOI: 10.2471/BLT.20.253591. PMC: 7375210. PMID: 32742035. «We detected in total 65776 variants with 5775 distinct variants.»
  59. «Global phylogeny, updated by Nextstrain». GISAID, 18-01-2021.
  60. «Nextclade» (What are the clades?). Arxivat de l'original el 19 gener 2021.
  61. «cov-lineages/pangolin: Software package for assigning SARS-CoV-2 genome sequences to global lineages». Github.
  62. «A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology». Nature Microbiology, 5, 11, 2020, pàg. 1403–1407. DOI: 10.1038/s41564-020-0770-5. PMID: 32669681. Citat a (Alm et al.)
  63. «Lineages». cov-lineages.org.
  64. 64,0 64,1 CDC. «Emerging SARS-CoV-2 Variants» (en anglès americà). Centers for Disease Control and Prevention. Aquest article incorpora text d'aquesta font, la qual és de domini públic.
  65. Contributor, IDSA. «COVID "Mega-variant" and eight criteria for a template to assess all variants» (en anglès americà), 02-02-2021.
  66. «Variants: distribution of cases data», 28-01-2021. «SARS-CoV-2 variants, if considered to have concerning epidemiological, immunological, or pathogenic properties, are raised for formal investigation. At this point they are designated Variant Under Investigation (VUI) with a year, month, and number. Following a risk assessment with the relevant expert committee, they may be designated Variant of Concern (VOC)»
  67. Lassaunière, Ria. «SARS-CoV-2 spike mutations arising in Danish mink and their spread to humans». Statens Serum Institut, 11-11-2020. Arxivat de l'original el 10 novembre 2020.
  68. «Covid: Ireland, Italy, Belgium and Netherlands ban flights from UK». BBC News, 20-12-2020.
  69. Public Health England. «Variants: distribution of cases data» (en anglès), 18-02-2021.
  70. «Detection of SARS-CoV-2 P681H Spike Protein Variant in Nigeria» (en anglès americà), 23-12-2020.
  71. «Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)» (en anglès americà). CDC. Centers for Disease Control and Prevention, 15-01-2021.
  72. Lowe, Derek. «The New Mutations». American Association for the Advancement of Science, 22-12-2020. «I should note here that there's another strain in South Africa that is bringing on similar concerns. This one has eight mutations in the Spike protein, with three of them (K417N, E484K and N501Y) that may have some functional role.»
  73. Roberts, Michelle «Another new coronavirus variant seen in the UK». BBC NEWS, 16-02-2021.
  74. «Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK». , 15-04-2021.
  75. «Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings» (en anglès), 12-01-2021.
  76. NIID (National Institute of Infectious Diseases) (12 gener 2021). "Brief report: New Variant Strain of SARS-CoV-2 Identified in Travelers from Brazil". Nota de premsa.
  77. Kupferschmidt, Kai «New mutations raise specter of 'immune escape'». Science, 371, 6527, 22-01-2021, pàg. 329–330. DOI: 10.1126/science.371.6527.329. PMID: 33479129.
  78. Kupferschmidt, Kai «U.K. variant puts spotlight on immunocompromised patients’ role in the COVID-19 pandemic». Science, 23-12-2020.
  79. Sutherland, Stephani «COVID Variants May Arise in People with Compromised Immune Systems». Scientific American, 23-02-2021.
  80. McCarthy, Kevin R.; Rennick, Linda J.; Nambulli, Sham; Robinson-McCarthy, Lindsey R.; Bain, William G.; Haidar, Ghady; Duprex, W. Paul «Recurrent deletions in the SARS-CoV-2 spike glycoprotein drive antibody escape». Science, 03-02-2021. DOI: 10.1126/science.abf6950.

Enllaços externs