Variant Òmicron del SARS-CoV-2: diferència entre les revisions

De la Viquipèdia, l'enciclopèdia lliure
Exploració interactiva de l'historial
← Edició anteriorEdició següent →
Contingut suprimit Contingut afegit
VisualWikitext
m Tipografia
Cap resum de modificació
Línia 3: Línia 3:
[[Fitxer:Map of countries with confirmed SARS-CoV-2 Omicron variant cases.svg|miniatura|300px|Casos confirmats acumulats de la variant Òmicron per país<br>
[[Fitxer:Map of countries with confirmed SARS-CoV-2 Omicron variant cases.svg|miniatura|300px|Casos confirmats acumulats de la variant Òmicron per país<br>
'''Llegenda:'''
'''Llegenda:'''
{{legend-col|{{legend|#900000|10.000–99.999}}|{{legend|#c80200|1.000–9.999}}|{{legend|#ee7070|100–999}}|{{legend|#ffc0c0|10–99}}|{{legend|#ffdfe0|1–9}}|{{legend|#e0e0e0|0}}}}
{{legend-col|{{legend|#510000|100.000–999.999}}|{{legend|#900000|10.000–99.999}}|{{legend|#c80200|1.000–9.999}}|{{legend|#ee7070|100–999}}|{{legend|#ffc0c0|10–99}}|{{legend|#ffdfe0|1–9}}|{{legend|#e0e0e0|0}}}}
]]
]]
La '''variant Òmicron del SARS-CoV-2''', també coneguda per l'[[identificador de llinatge PANGO]] '''B.1.1.529''', l'identificador de [[clade]] [[GISAID]] '''GR/484A''' i l'identificador de clade [[Nextstrain]] '''21K''',<ref name="WHO-tracking">{{ref-web|títol=Tracking SARS-CoV-2 variants|url=https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/|access-date= 27 novembre 2021|website=www.who.int|llengua=en}}</ref> és una [[variant preocupant del SARS-CoV-2]], el virus que causa [[COVID-19]]. Es va informar per primera vegada a l'[[Organització Mundial de la Salut]] (OMS) des de [[Sud-àfrica]] el 24 de novembre de 2021,<ref name="who-statement">{{ref-web|data= 26 novembre 2021|títol=Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern|url=https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern|url-status=live|access-date= 26 novembre 2021|website=World Health Organization|arxiudata= 26 novembre 2021|arxiuurl=https://web.archive.org/web/20211126180836/https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-%28b.1.1.529%29-sars-cov-2-variant-of-concern}}</ref> i dos dies després l'OMS la va designar com una variant de preocupant i la va anomenar amb la lletra grega [[òmicron]].<ref name="who-statement"/><ref name=:0>{{ref-notícia|cognom=Parekh|nom=Marcus|cognom2=Platt|nom2=Poppie|cognom3=Team|nom3=Global Health Security|cognom4=Barnes|nom4=Joe|data= 26 novembre 2021|títol=Coronavirus latest news: EU suspends all flights to southern Africa over omicron Covid variant fears|llengua=en-GB|obra=The Telegraph|url=https://www.telegraph.co.uk/global-health/science-and-disease/covid-new-south-african-variant-strain-lockdown-restrictions/|access-date= 26 novembre 2021|issn=0307-1235}}</ref><ref name=:1>{{ref-web|cognom=Meyer|nom=David|data= 16 novembre 2021|títol=What's Omicron? Here's what we know and don't know about the new COVID variant that's roiling markets and air travel|url=https://fortune.com/2021/11/26/nu-covid-variant-who-south-africa-markets-oil-crypto-air-travel/|url-status=live|access-date= 26 novembre 2021|website=Fortune|llengua=en}}</ref>
La '''variant Òmicron del SARS-CoV-2''', també coneguda per l'[[identificador de llinatge PANGO]] '''B.1.1.529''', l'identificador de [[clade]] [[GISAID]] '''GR/484A''' i l'identificador de clade [[Nextstrain]] '''21K''',<ref name="WHO-tracking">{{ref-web|títol=Tracking SARS-CoV-2 variants|url=https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/|access-date= 27 novembre 2021|website=www.who.int|llengua=en}}</ref> és una [[variant preocupant del SARS-CoV-2]], el virus que causa [[COVID-19]]. Es va informar per primera vegada a l'[[Organització Mundial de la Salut]] (OMS) des de [[Sud-àfrica]] el 24 de novembre de 2021,<ref name="who-statement">{{ref-web|data= 26 novembre 2021|títol=Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern|url=https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern|url-status=live|access-date= 26 novembre 2021|website=World Health Organization|arxiudata= 26 novembre 2021|arxiuurl=https://web.archive.org/web/20211126180836/https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-%28b.1.1.529%29-sars-cov-2-variant-of-concern}}</ref> i dos dies després l'OMS la va designar com una variant de preocupant i la va anomenar amb la lletra grega [[òmicron]].<ref name="who-statement"/><ref name=:0>{{ref-notícia|cognom=Parekh|nom=Marcus|cognom2=Platt|nom2=Poppie|cognom3=Team|nom3=Global Health Security|cognom4=Barnes|nom4=Joe|data= 26 novembre 2021|títol=Coronavirus latest news: EU suspends all flights to southern Africa over omicron Covid variant fears|llengua=en-GB|obra=The Telegraph|url=https://www.telegraph.co.uk/global-health/science-and-disease/covid-new-south-african-variant-strain-lockdown-restrictions/|access-date= 26 novembre 2021|issn=0307-1235}}</ref><ref name=:1>{{ref-web|cognom=Meyer|nom=David|data= 16 novembre 2021|títol=What's Omicron? Here's what we know and don't know about the new COVID variant that's roiling markets and air travel|url=https://fortune.com/2021/11/26/nu-covid-variant-who-south-africa-markets-oil-crypto-air-travel/|url-status=live|access-date= 26 novembre 2021|website=Fortune|llengua=en}}</ref>
Línia 10: Línia 10:


En comparació amb les variants anteriors de preocupació, es creu que Òmicron és molt més contagiós (es propaga molt més ràpidament)<ref>[https://www.bbc.co.uk/news/health-59769967 Omicron: Good news, bad news and what it all means] ''[[BBC]]''</ref> i ho fa al voltant de 70 vegades més ràpid<ref>{{Ref-web|títol=HKUMed finds Omicron SARS-CoV-2 can infect faster and better than Delta in human bronchus but with less severe infection in lung|url=http://www.med.hku.hk/en/news/press/20211215-omicron-sars-cov-2-infection|consulta=2021-12-26|llengua=en}}</ref> que qualsevol variant anterior als [[bronquis]] (vies respiratòries pulmonars), però és menys capaç de penetrar en el teixit pulmonar profund, i potser per aquest motiu hi ha una reducció considerable del risc de malaltia greu que requereixi l'hospitalització.<ref name=cidrap>{{ref-web|url=https://www.cidrap.umn.edu/news-perspective/2021/12/lung-tissue-study-sheds-light-fast-omicron-spread|títol=Lung tissue study sheds light on fast Omicron spread|website=CIDRAP}}</ref> No obstant això, la taxa de propagació extremadament alta, combinada amb la seva capacitat per evadir tant la doble vacunació com el sistema immunitari del cos, significa que el nombre total de pacients que requereixen atenció hospitalària sigui gran.<ref name=cidrap/>
En comparació amb les variants anteriors de preocupació, es creu que Òmicron és molt més contagiós (es propaga molt més ràpidament)<ref>[https://www.bbc.co.uk/news/health-59769967 Omicron: Good news, bad news and what it all means] ''[[BBC]]''</ref> i ho fa al voltant de 70 vegades més ràpid<ref>{{Ref-web|títol=HKUMed finds Omicron SARS-CoV-2 can infect faster and better than Delta in human bronchus but with less severe infection in lung|url=http://www.med.hku.hk/en/news/press/20211215-omicron-sars-cov-2-infection|consulta=2021-12-26|llengua=en}}</ref> que qualsevol variant anterior als [[bronquis]] (vies respiratòries pulmonars), però és menys capaç de penetrar en el teixit pulmonar profund, i potser per aquest motiu hi ha una reducció considerable del risc de malaltia greu que requereixi l'hospitalització.<ref name=cidrap>{{ref-web|url=https://www.cidrap.umn.edu/news-perspective/2021/12/lung-tissue-study-sheds-light-fast-omicron-spread|títol=Lung tissue study sheds light on fast Omicron spread|website=CIDRAP}}</ref> No obstant això, la taxa de propagació extremadament alta, combinada amb la seva capacitat per evadir tant la doble vacunació com el sistema immunitari del cos, significa que el nombre total de pacients que requereixen atenció hospitalària sigui gran.<ref name=cidrap/>

Les vacunes continuen oferint protecció contra la malaltia greu i l'hospitalització, especialment després d'administrar una tercera dosi d'una [[vacuna d'ARNm]].<ref name="Ahmed2022">{{Cite journal|vauthors=Ahmed SF, Quadeer AA, McKay MR|date=January 2022|title=SARS-CoV-2 T Cell Responses Elicited by COVID-19 Vaccines or Infection Are Expected to Remain Robust against Omicron|journal=Viruses|volume=14|issue=1|pages=79|doi=10.3390/v14010079|pmid=35062283|pmc=8781795|doi-access=free}}</ref><ref name="Jurdi2022">{{Cite journal|display-authors=6|vauthors=Al Jurdi A, Gassen RB, Borges TD, Lape IT, Morena L, Efe O, Solhjou Z, El Fekih R, Deban C, Bohan B, Pattanayak V|date=2022-01-06|title=Diminished antibody response against SARS-CoV-2 Omicron variant after third dose of mRNA vaccine in kidney transplant recipients|url=https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.01.03.22268649v1|language=en|pages=2022.01.03.22268649|doi=10.1101/2022.01.03.22268649|s2cid=245739956|journal=|access-date=16 January 2022|archive-date=11 January 2022|archive-url=https://web.archive.org/web/20220111082809/https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.01.03.22268649v1|url-status=live}}</ref> Les primeres xifres suggereixen que la doble vacunació ofereix entre un 30 i un 40% de protecció contra la infecció i al voltant del 70% de protecció contra l'hospitalització. Una tercera dosi de vacuna recent augmenta l'eficàcia contra la infecció al voltant del 75 per cent i el 88 per cent per a malalties greus.<ref>{{Cite web|date=2022-01-07|title=How Effective Are COVID-19 Vaccines Against Omicron?|url=https://www.healthline.com/health-news/by-the-numbers-covid-19-vaccines-and-omicron|access-date=2022-01-17|website=Healthline|language=en|archive-date=16 January 2022|archive-url=https://web.archive.org/web/20220116092104/https://www.healthline.com/health-news/by-the-numbers-covid-19-vaccines-and-omicron|url-status=live}}</ref>


== Nomenclatura ==
== Nomenclatura ==
Línia 20: Línia 22:


=== Subllinatges i subvariant BA.2 ===
=== Subllinatges i subvariant BA.2 ===
Els investigadors han establert l'existència de tres subllinatges d'Òmicron. El subllinatge "estàndard" ara s'anomena BA.1{{wbr}}/B.1.1.529.1, i els altres dos subllinatges es coneixen com BA.2{{wbr}}/B.1.1.529.2 i BA.3{{wbr}}/B.1.1.529.3.<ref name="PANGOLIN B.1.1.529">{{ref-web|títol=Lineage B.1.1.529|url=https://cov-lineages.org/lineage.html?lineage=B.1.1.529|editor=[[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGOLIN]]|data=19 desembre 2021|access-date=19 desembre 2021|arxiudata=20 desembre 2021|arxiuurl=https://web.archive.org/web/20211220085552/https://cov-lineages.org/lineage.html?lineage=B.1.1.529|url-status=live}}</ref> Comparteixen moltes mutacions, però també difereixen significativament. BA.1 i BA.2 comparteixen 32 mutacions, però difereixen en 28.<ref name="For 21Jan2022">{{ref-notícia| vauthors=McGregor G |data= 21 gener 2022 |títol=What is ‘stealth Omicron’? The rise of the subvariant is alarming some scientists who say it needs its own Greek letter | url=https://fortune.com/2022/01/21/what-is-stealth-omicron-new-covid-variant-substrain-denmark/ |editorial=Fortune |consulta= 23 gener 2022 |arxiudata= 23 gener 2022 |arxiuurl=https://web.archive.org/web/20220123050305/https://fortune.com/2022/01/21/what-is-stealth-omicron-new-covid-variant-substrain-denmark/ | url-status=live }}</ref> Això els fa tan diferents com algunes altres variants principals,<ref name="SSI 19Jan2022"/> i s'ha suggerit que BA.2 hauria de rebre el seu propi nom basat en l'alfabet grec.<ref name="For 21Jan2022"/>
Els investigadors han establert l'existència de tres subllinatges d'Òmicron. El subllinatge "estàndard" ara s'anomena BA.1{{wbr}}/B.1.1.529.1, i els altres dos subllinatges es coneixen com BA.2{{wbr}}/B.1.1.529.2 i BA.3{{wbr}}/B.1.1.529.3.<ref name="PANGOLIN B.1.1.529">{{ref-web|títol=Lineage B.1.1.529|url=https://cov-lineages.org/lineage.html?lineage=B.1.1.529|editor=[[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGOLIN]]|data=19 desembre 2021|access-date=19 desembre 2021|arxiudata=20 desembre 2021|arxiuurl=https://web.archive.org/web/20211220085552/https://cov-lineages.org/lineage.html?lineage=B.1.1.529|url-status=live}}</ref> Comparteixen moltes mutacions, però també difereixen significativament. BA.1 i BA.2 comparteixen 32 mutacions, però difereixen en 28.<ref name="For 21Jan2022">{{ref-notícia| vauthors=McGregor G |data= 21 gener 2022 |títol=What is ‘stealth Omicron’? The rise of the subvariant is alarming some scientists who say it needs its own Greek letter | url=https://fortune.com/2022/01/21/what-is-stealth-omicron-new-covid-variant-substrain-denmark/ |editorial=Fortune |consulta= 23 gener 2022 |arxiudata= 23 gener 2022 |arxiuurl=https://web.archive.org/web/20220123050305/https://fortune.com/2022/01/21/what-is-stealth-omicron-new-covid-variant-substrain-denmark/ | url-status=live }}</ref> Això els fa tan diferents com algunes altres variants principals,<ref name="SSI 19Jan2022">{{Cite web | title = En subvariant af omikron, BA.2, udgør nu knap halvdelen af alle danske omikrontilfælde | trans-title = A subvariant of Omicron, BA.2., now comprises almost half of all Danish Omicron cases | publisher = Statens Serum Institut | date = 19 January 2022 | access-date = 20 January 2022 | url = https://www.ssi.dk/aktuelt/nyheder/2022/en-subvariant-af-omikron-ba2-udgoer-nu-knap-halvdelen-af-alle-danske-omikrontilfaelde | language = da | archive-date = 20 January 2022 | archive-url = https://web.archive.org/web/20220120125644/https://www.ssi.dk/aktuelt/nyheder/2022/en-subvariant-af-omikron-ba2-udgoer-nu-knap-halvdelen-af-alle-danske-omikrontilfaelde | url-status = live }}</ref> i s'ha suggerit que BA.2 hauria de rebre el seu propi nom basat en l'alfabet grec.<ref name="For 21Jan2022"/>


Una diferència notable entre la subvariant "estàndard" i BA.2 és que aquesta última no té la característica de supressió que causa la [[deleció]] del gen S (SGTF de l'anglès ''S Gene Target Failure'') (Δ69-70) per la qual moltes proves de [[PCR en temps real|qPCR]] són capaces de detectar ràpidament un cas com a variant Òmicron (o Alfa), de la variant Delta anteriorment dominant (que a igual que la BA.2 no tenen aquesta deleció).<ref name="guardian-sublineage-sgtf">{{ref-notícia| vauthors = Sample I, Walker P |url=https://www.theguardian.com/world/2021/dec/07/scientists-find-stealth-version-of-omicron-not-identifiable-with-pcr-test-covid-variant |títol=Scientists find 'stealth' version of Omicron that may be harder to track |data=7 desembre 2021 |editorial=www.theguardian.com |access-date=7 desembre 2021 |arxiudata=7 desembre 2021 |arxiuurl=https://web.archive.org/web/20211207163912/https://www.theguardian.com/world/2021/dec/07/scientists-find-stealth-version-of-omicron-not-identifiable-with-pcr-test-covid-variant |url-status=live }}</ref><ref>{{ref-notícia|títol=Stealth Omicron: What is The Fast Spreading Omicron BA.2 Sub-Variant That Can Escape RT-PCR Test? | url=https://www.india.com/health/health-health/stealth-omicron-what-is-the-fast-spreading-omicron-ba-2-sub-variant-that-can-escape-rt-pcr-test-all-that-we-know-so-far-5201383/ |data= 23 gener 2022 |editorial=india.com | access-date= 23 gener 2022 |arxiudata= 23 gener 2022 |arxiuurl=https://web.archive.org/web/20220123211405/https://www.india.com/health/health-health/stealth-omicron-what-is-the-fast-spreading-omicron-ba-2-sub-variant-that-can-escape-rt-pcr-test-all-that-we-know-so-far-5201383/ | url-status=live }}</ref> Així, els països que depenen principalment de l'SGTF per a la detecció poden passar per alt BA.2;<ref name="guardian-sublineage-sgtf"/> i les autoritats britàniques consideren que la detecció de només l'SGTF és insuficient per controlar la propagació d'Òmicron.<ref name="YNews 21Jan2022">{{ref-notícia| vauthors=Parker C |data= 21 gener 2022 |títol=Government scientists monitoring new BA.2 variant of Omicron | url=https://uk.news.yahoo.com/government-monitoring-new-potentially-more-transmissible-omicron-variant-165522269.html |editorial=Yahoo News |consulta= 21 gener 2022 |arxiudata= 21 gener 2022 |arxiuurl=https://web.archive.org/web/20220121225510/https://uk.news.yahoo.com/government-monitoring-new-potentially-more-transmissible-omicron-variant-165522269.html | url-status=live }}</ref> Això ha donat com a resultat que hagi estat anomenada '''Òmicron sigil·losa'''.<ref name="YNews 21Jan2022"/> Com que encara es pot detectar mitjançant una seqüenciació completa normal, o comprovacions de determinades altres mutacions, el sobrenom és, tanmateix, inexacte.<ref name="For 21Jan2022"/> Alguns països, com Dinamarca i Japó, utilitzen una variant qPCR que prova diverses mutacions, inclosa la L452R.<ref name="SSI varQPCR">{{ref-web|títol=Variant-PCR-testen (tidl. Delta-PCR-testen)|url=https://covid19.ssi.dk/diagnostik/delta-pcr-testen|editor=Statens Serum Institut|data=21 desembre 2021|access-date= 17 gener 2022|llengua=Danish|arxiudata= 7 febrer 2021|arxiuurl=https://web.archive.org/web/20210207104212/https://covid19.ssi.dk/diagnostik/delta-pcr-testen|url-status=live}}</ref><ref name="Jpn 14Jan2022">{{ref-web|títol=SARS-CoV-2の変異株B.1.1.529系統（オミクロン株）について（第６報） | url=https://www.niid.go.jp/niid/ja/2019-ncov/2551-cepr/10900-sars-cov-2-b-1-1-530.html |data= 14 gener 2022 |editor=[[National Institute of Infectious Diseases (Japan)]] |consulta= 24 gener 2022 |llengua=Japanese |arxiudata= 20 gener 2022 |arxiuurl=https://web.archive.org/web/20220120162213/https://www.niid.go.jp/niid/ja/2019-ncov/2551-cepr/10900-sars-cov-2-b-1-1-530.html | url-status=live }}</ref> També pot distingir la Delta, que té L452R,<ref>{{ref-web|títol=Delta Variant Report|url=https://outbreak.info/situation-reports/delta|editor=outbreak.info ([[Scripps Research]])|data=13 desembre 2021|access-date=13 desembre 2021|arxiudata=19 desembre 2021|arxiuurl=https://web.archive.org/web/20211219212244/https://outbreak.info/situation-reports/delta|url-status=live}}</ref> i tots els subllinatges d'Òmicron, que no tenen L452R.<ref>{{ref-web|títol=BA.1 Lineage Report|url=https://outbreak.info/situation-reports?pango=BA.1|editor=outbreak.info ([[Scripps Research]])|data=19 desembre 2021|access-date=19 desembre 2021|arxiudata=16 desembre 2021|arxiuurl=https://web.archive.org/web/20211216193850/https://outbreak.info/situation-reports?pango=BA.1|url-status=live}}</ref><ref name="OBI BA2"/> El tercer subllinatge d'Òmicron, BA.3, és molt rar i no representa el mateix problema potencial en la detecció ja que té la supressió SGTF (Δ69-70), similar a BA.1.<ref>{{ref-web|títol=Lineage BA.3|url=https://cov-lineages.org/lineage.html?lineage=BA.3|editor=[[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGOLIN]]|data= 25 gener 2022|access-date= 25 gener 2022}}</ref><ref name="OBI BA3">{{ref-web|títol=BA.3 Lineage Report|url=https://outbreak.info/situation-reports?pango=BA.3|editor=outbreak.info ([[Scripps Research]])|data=19 desembre 2021|access-date=19 desembre 2021|arxiudata=20 desembre 2021|arxiuurl=https://web.archive.org/web/20211220093918/https://outbreak.info/situation-reports?pango=BA.3|url-status=live}}</ref>
Una diferència notable entre la subvariant "estàndard" i BA.2 és que aquesta última no té la característica de supressió que causa la [[deleció]] del gen S (SGTF de l'anglès ''S Gene Target Failure'') (Δ69-70) per la qual moltes proves de [[PCR en temps real|qPCR]] són capaces de detectar ràpidament un cas com a variant Òmicron (o Alfa), de la variant Delta anteriorment dominant (que a igual que la BA.2 no tenen aquesta deleció).<ref name="guardian-sublineage-sgtf">{{ref-notícia| vauthors = Sample I, Walker P |url=https://www.theguardian.com/world/2021/dec/07/scientists-find-stealth-version-of-omicron-not-identifiable-with-pcr-test-covid-variant |títol=Scientists find 'stealth' version of Omicron that may be harder to track |data=7 desembre 2021 |editorial=www.theguardian.com |access-date=7 desembre 2021 |arxiudata=7 desembre 2021 |arxiuurl=https://web.archive.org/web/20211207163912/https://www.theguardian.com/world/2021/dec/07/scientists-find-stealth-version-of-omicron-not-identifiable-with-pcr-test-covid-variant |url-status=live }}</ref><ref>{{ref-notícia|títol=Stealth Omicron: What is The Fast Spreading Omicron BA.2 Sub-Variant That Can Escape RT-PCR Test? | url=https://www.india.com/health/health-health/stealth-omicron-what-is-the-fast-spreading-omicron-ba-2-sub-variant-that-can-escape-rt-pcr-test-all-that-we-know-so-far-5201383/ |data= 23 gener 2022 |editorial=india.com | access-date= 23 gener 2022 |arxiudata= 23 gener 2022 |arxiuurl=https://web.archive.org/web/20220123211405/https://www.india.com/health/health-health/stealth-omicron-what-is-the-fast-spreading-omicron-ba-2-sub-variant-that-can-escape-rt-pcr-test-all-that-we-know-so-far-5201383/ | url-status=live }}</ref> Així, els països que depenen principalment de l'SGTF per a la detecció poden passar per alt BA.2;<ref name="guardian-sublineage-sgtf"/> i les autoritats britàniques consideren que la detecció de només l'SGTF és insuficient per controlar la propagació d'Òmicron.<ref name="YNews 21Jan2022">{{ref-notícia| vauthors=Parker C |data= 21 gener 2022 |títol=Government scientists monitoring new BA.2 variant of Omicron | url=https://uk.news.yahoo.com/government-monitoring-new-potentially-more-transmissible-omicron-variant-165522269.html |editorial=Yahoo News |consulta= 21 gener 2022 |arxiudata= 21 gener 2022 |arxiuurl=https://web.archive.org/web/20220121225510/https://uk.news.yahoo.com/government-monitoring-new-potentially-more-transmissible-omicron-variant-165522269.html | url-status=live }}</ref> Això ha donat com a resultat que hagi estat anomenada '''Òmicron sigil·losa'''.<ref name="YNews 21Jan2022"/> Com que encara es pot detectar mitjançant una seqüenciació completa normal, o comprovacions de determinades altres mutacions, el sobrenom és, tanmateix, inexacte.<ref name="For 21Jan2022"/> Alguns països, com Dinamarca i Japó, utilitzen una variant qPCR que prova diverses mutacions, inclosa la L452R.<ref name="SSI varQPCR">{{ref-web|títol=Variant-PCR-testen (tidl. Delta-PCR-testen)|url=https://covid19.ssi.dk/diagnostik/delta-pcr-testen|editor=Statens Serum Institut|data=21 desembre 2021|access-date= 17 gener 2022|llengua=Danish|arxiudata= 7 febrer 2021|arxiuurl=https://web.archive.org/web/20210207104212/https://covid19.ssi.dk/diagnostik/delta-pcr-testen|url-status=live}}</ref><ref name="Jpn 14Jan2022">{{ref-web|títol=SARS-CoV-2の変異株B.1.1.529系統（オミクロン株）について（第６報） | url=https://www.niid.go.jp/niid/ja/2019-ncov/2551-cepr/10900-sars-cov-2-b-1-1-530.html |data= 14 gener 2022 |editor=[[National Institute of Infectious Diseases (Japan)]] |consulta= 24 gener 2022 |llengua=Japanese |arxiudata= 20 gener 2022 |arxiuurl=https://web.archive.org/web/20220120162213/https://www.niid.go.jp/niid/ja/2019-ncov/2551-cepr/10900-sars-cov-2-b-1-1-530.html | url-status=live }}</ref> També pot distingir la Delta, que té L452R,<ref>{{ref-web|títol=Delta Variant Report|url=https://outbreak.info/situation-reports/delta|editor=outbreak.info ([[Scripps Research]])|data=13 desembre 2021|access-date=13 desembre 2021|arxiudata=19 desembre 2021|arxiuurl=https://web.archive.org/web/20211219212244/https://outbreak.info/situation-reports/delta|url-status=live}}</ref> i tots els subllinatges d'Òmicron, que no tenen L452R.<ref>{{ref-web|títol=BA.1 Lineage Report|url=https://outbreak.info/situation-reports?pango=BA.1|editor=outbreak.info ([[Scripps Research]])|data=19 desembre 2021|access-date=19 desembre 2021|arxiudata=16 desembre 2021|arxiuurl=https://web.archive.org/web/20211216193850/https://outbreak.info/situation-reports?pango=BA.1|url-status=live}}</ref><ref name="OBI BA2">{{cite web|title=BA.2 Lineage Report|url=https://outbreak.info/situation-reports?pango=BA.2|publisher=outbreak.info ([[Scripps Research]])|date=21 January 2022|access-date=21 January 2022|archive-date=13 December 2021|archive-url=https://web.archive.org/web/20211213170850/https://outbreak.info/situation-reports?pango=BA.2|url-status=live}}</ref><ref name="UKHSA BA2">{{cite web | title=COVID-19 variants identified in the UK | url=https://www.gov.uk/government/news/covid-19-variants-identified-in-the-uk | date=21 January 2022 | publisher=[[UK Health Security Agency]] | access-date=21 January 2022 | archive-date=23 January 2022 | archive-url=https://web.archive.org/web/20220123210639/https://www.gov.uk/government/news/covid-19-variants-identified-in-the-uk | url-status=live }}</ref> El tercer subllinatge d'Òmicron, BA.3, és molt rar i no representa el mateix problema potencial en la detecció ja que té la supressió SGTF (Δ69-70), similar a BA.1.<ref>{{ref-web|títol=Lineage BA.3|url=https://cov-lineages.org/lineage.html?lineage=BA.3|editor=[[Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages|PANGOLIN]]|data= 25 gener 2022|access-date= 25 gener 2022}}</ref><ref name="OBI BA3">{{ref-web|títol=BA.3 Lineage Report|url=https://outbreak.info/situation-reports?pango=BA.3|editor=outbreak.info ([[Scripps Research]])|data=19 desembre 2021|access-date=19 desembre 2021|arxiudata=20 desembre 2021|arxiuurl=https://web.archive.org/web/20211220093918/https://outbreak.info/situation-reports?pango=BA.3|url-status=live}}</ref>


Al 24 de gener, les autoritats sanitàries daneses no havien detectat diferències entre BA.1 i BA.2 en hospitalitzacions o gravetat, i les primeres dades de l'Índia apunten en la mateixa direcció.<ref name="YNews 21Jan2022"/><ref name="WaPo 25Jan2022"/><ref name="TV2 2Jan2022">{{ref-notícia| vauthors=Larsen JA |data= 21 gener 2022 |títol=Ny Omikron-variant tager over i Danmark - det ved vi om den | url=https://nyheder.tv2.dk/2022-01-21-ny-omikron-variant-tager-over-i-danmark-det-ved-vi-om-den |editorial=TV2 |consulta= 21 gener 2022 |llengua=da |arxiudata= 22 gener 2022 |arxiuurl=https://web.archive.org/web/20220122142825/https://nyheder.tv2.dk/2022-01-21-ny-omikron-variant-tager-over-i-danmark-det-ved-vi-om-den | url-status=live }}</ref> Els estudis noruecs mostren que la quantitat de virus a les vies respiratòries superiors és similar en els infectats amb BA.1 i BA.<ref name="FHI wk2"/>
Al 24 de gener, les autoritats sanitàries daneses no havien detectat diferències entre BA.1 i BA.2 en hospitalitzacions o gravetat, i les primeres dades de l'Índia apunten en la mateixa direcció.<ref name="YNews 21Jan2022"/><ref name="WaPo 25Jan2022">{{cite news | vauthors=Bernstein L | date=25 January 2022 | title=There's a new version of omicron but so far it doesn't appear to be more dangerous | url=https://www.washingtonpost.com/health/2022/01/24/covid-omicron-ba2/ | newspaper=Washington Post | accessdate=25 January 2022 | archive-date=25 January 2022 | archive-url=https://web.archive.org/web/20220125052641/https://www.washingtonpost.com/health/2022/01/24/covid-omicron-ba2/ | url-status=live }}</ref><ref name="TV2 2Jan2022">{{ref-notícia| vauthors=Larsen JA |data= 21 gener 2022 |títol=Ny Omikron-variant tager over i Danmark - det ved vi om den | url=https://nyheder.tv2.dk/2022-01-21-ny-omikron-variant-tager-over-i-danmark-det-ved-vi-om-den |editorial=TV2 |consulta= 21 gener 2022 |llengua=da |arxiudata= 22 gener 2022 |arxiuurl=https://web.archive.org/web/20220122142825/https://nyheder.tv2.dk/2022-01-21-ny-omikron-variant-tager-over-i-danmark-det-ved-vi-om-den | url-status=live }}</ref> Els estudis noruecs mostren que la quantitat de virus a les vies respiratòries superiors és similar en els infectats amb BA.1 i BA.<ref name="FHI wk2">{{cite web | title=COVID-19 Ukerapport – uke 2 | url=https://www.fhi.no/contentassets/8a971e7b0a3c4a06bdbf381ab52e6157/vedlegg/2022/ukerapport-uke-2-10.01---16.01.22.pdf | date=19 January 2022 | publisher=[[Norwegian Institute of Public Health]] | accessdate=25 January 2022 | language=no | archive-date=27 January 2022 | archive-url=https://web.archive.org/web/20220127201054/https://www.fhi.no/contentassets/8a971e7b0a3c4a06bdbf381ab52e6157/vedlegg/2022/ukerapport-uke-2-10.01---16.01.22.pdf | url-status=live }}</ref>


== Epidemiologia ==
== Epidemiologia ==

Revisió del 08:56, 7 feb 2022

Variant Òmicron i altres variants preocupants principals o anteriors del SARS-CoV-2 representades en un arbre escalat radialment per distància genètica, derivat de Nextstrain l'1 de desembre de 2021
Casos confirmats acumulats de la variant Òmicron per país
Llegenda:
  •   100.000–999.999
  •   10.000–99.999
  •   1.000–9.999
  •   100–999
  •   10–99
  •   1–9
  •   0

La variant Òmicron del SARS-CoV-2, també coneguda per l'identificador de llinatge PANGO B.1.1.529, l'identificador de clade GISAID GR/484A i l'identificador de clade Nextstrain 21K,[1] és una variant preocupant del SARS-CoV-2, el virus que causa COVID-19. Es va informar per primera vegada a l'Organització Mundial de la Salut (OMS) des de Sud-àfrica el 24 de novembre de 2021,[2] i dos dies després l'OMS la va designar com una variant de preocupant i la va anomenar amb la lletra grega òmicron.[2][3][4]

La variant té un nombre inusualment gran de mutacions, algunes de les quals són noves, i diverses de les quals afecten la proteïna d'espícula utilitzada per a la majoria dels vaccins en el moment del seu descobriment. Aquest nivell de variació ha generat preocupacions pel que fa a la transmissibilitat, l'evasió del sistema immunitari i la resistència al vaccí. Com a resultat, la variant va ser designada ràpidament com a "preocupant", i diversos països van introduir restriccions a l'hora de viatjar per limitar o frenar la seva propagació internacional.[5][6][7]

En comparació amb les variants anteriors de preocupació, es creu que Òmicron és molt més contagiós (es propaga molt més ràpidament)[8] i ho fa al voltant de 70 vegades més ràpid[9] que qualsevol variant anterior als bronquis (vies respiratòries pulmonars), però és menys capaç de penetrar en el teixit pulmonar profund, i potser per aquest motiu hi ha una reducció considerable del risc de malaltia greu que requereixi l'hospitalització.[10] No obstant això, la taxa de propagació extremadament alta, combinada amb la seva capacitat per evadir tant la doble vacunació com el sistema immunitari del cos, significa que el nombre total de pacients que requereixen atenció hospitalària sigui gran.[10]

Les vacunes continuen oferint protecció contra la malaltia greu i l'hospitalització, especialment després d'administrar una tercera dosi d'una vacuna d'ARNm.[11][12] Les primeres xifres suggereixen que la doble vacunació ofereix entre un 30 i un 40% de protecció contra la infecció i al voltant del 70% de protecció contra l'hospitalització. Una tercera dosi de vacuna recent augmenta l'eficàcia contra la infecció al voltant del 75 per cent i el 88 per cent per a malalties greus.[13]

Nomenclatura

L'OMS se saltà les lletres ni (ν) i ksi (ξ), les següents lletres de l'alfabet grec, per a evitar confusions amb la paraula anglesa new ("nou") i el cognom xinès Xi, prou estès.[14][15]

Perfil genètic i mutacions

  • Seqüència genòmica
    Seqüència genòmica

Subllinatges i subvariant BA.2

Els investigadors han establert l'existència de tres subllinatges d'Òmicron. El subllinatge "estàndard" ara s'anomena BA.1​/B.1.1.529.1, i els altres dos subllinatges es coneixen com BA.2​/B.1.1.529.2 i BA.3​/B.1.1.529.3.[16] Comparteixen moltes mutacions, però també difereixen significativament. BA.1 i BA.2 comparteixen 32 mutacions, però difereixen en 28.[17] Això els fa tan diferents com algunes altres variants principals,[18] i s'ha suggerit que BA.2 hauria de rebre el seu propi nom basat en l'alfabet grec.[17]

Una diferència notable entre la subvariant "estàndard" i BA.2 és que aquesta última no té la característica de supressió que causa la deleció del gen S (SGTF de l'anglès S Gene Target Failure) (Δ69-70) per la qual moltes proves de qPCR són capaces de detectar ràpidament un cas com a variant Òmicron (o Alfa), de la variant Delta anteriorment dominant (que a igual que la BA.2 no tenen aquesta deleció).[19][20] Així, els països que depenen principalment de l'SGTF per a la detecció poden passar per alt BA.2;[19] i les autoritats britàniques consideren que la detecció de només l'SGTF és insuficient per controlar la propagació d'Òmicron.[21] Això ha donat com a resultat que hagi estat anomenada Òmicron sigil·losa.[21] Com que encara es pot detectar mitjançant una seqüenciació completa normal, o comprovacions de determinades altres mutacions, el sobrenom és, tanmateix, inexacte.[17] Alguns països, com Dinamarca i Japó, utilitzen una variant qPCR que prova diverses mutacions, inclosa la L452R.[22][23] També pot distingir la Delta, que té L452R,[24] i tots els subllinatges d'Òmicron, que no tenen L452R.[25][26][27] El tercer subllinatge d'Òmicron, BA.3, és molt rar i no representa el mateix problema potencial en la detecció ja que té la supressió SGTF (Δ69-70), similar a BA.1.[28][29]

Al 24 de gener, les autoritats sanitàries daneses no havien detectat diferències entre BA.1 i BA.2 en hospitalitzacions o gravetat, i les primeres dades de l'Índia apunten en la mateixa direcció.[21][30][31] Els estudis noruecs mostren que la quantitat de virus a les vies respiratòries superiors és similar en els infectats amb BA.1 i BA.[32]

Epidemiologia

La nova variant es va detectar per primera vegada el 22 de novembre de 2021 en laboratoris de Botswana i Sud-àfrica a partir de mostres recollides entre l'11 i el 16 de novembre.[33][34] La primera mostra coneguda es va recollir a Sud-àfrica el 8 de novembre.[35][36] En altres continents, els primers casos coneguts van ser una persona que va arribar a Hong Kong des de Sud-àfrica via Qatar l'11 de novembre, i una altra persona que va arribar a Bèlgica des d'Egipte via Turquia la mateixa data.[37][38] A partir del 16 de desembre de 2021, la variant s'ha confirmat en més de 80 països.[39] L'Organització Mundial de la Salut va estimar que a mitjans de desembre, que l'Òmicron probablement es trobava en la majoria de països, tant si ho havien detectat com si no.[40]

Conseqüències

El 15 de desembre, el Centre Europeu de Prevenció i Control de Malalties va avaluar que, encara que la variant resulti més lleu que la Delta, la seva propagació molt probablement augmentarà les hospitalitzacions i les víctimes mortals a causa del creixement exponencial dels casos causat per l'augment de la transmissibilitat.[41]

Referències

  1. ↑ «Tracking SARS-CoV-2 variants» (en anglès).
  2. ↑ 2,0 2,1 «Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern», 26-11-2021. Arxivat de l'original el 26 novembre 2021.
  3. ↑ Parekh, Marcus; Platt, Poppie; Team, Global Health Security; Barnes, Joe «Coronavirus latest news: EU suspends all flights to southern Africa over omicron Covid variant fears» (en anglès). The Telegraph, 26-11-2021.
  4. ↑ Meyer, David. «What's Omicron? Here's what we know and don't know about the new COVID variant that's roiling markets and air travel» (en anglès), 16-11-2021.
  5. ↑ https://www.ccma.cat/324/primers-casos-sospitosos-a-europa-de-la-nova-variant-mentre-el-mon-intenta-contenir-la/noticia/3132307
  6. ↑ https://www.ara.cat/internacional/alemanya-anuncia-cas-sospitos-nova-variant-covid-19_1_4195933.html
  7. ↑ https://beteve.cat/economia/espanya-suspendra-vols-sud-africa-botswana-nova-variant-covid/
  8. ↑ Omicron: Good news, bad news and what it all means BBC
  9. ↑ «HKUMed finds Omicron SARS-CoV-2 can infect faster and better than Delta in human bronchus but with less severe infection in lung» (en anglès). [Consulta: 26 desembre 2021].
  10. ↑ 10,0 10,1 «Lung tissue study sheds light on fast Omicron spread».
  11. ↑ «SARS-CoV-2 T Cell Responses Elicited by COVID-19 Vaccines or Infection Are Expected to Remain Robust against Omicron». Viruses, vol. 14, 1, January 2022, pàg. 79. DOI: 10.3390/v14010079. PMC: 8781795. PMID: 35062283.
  12. ↑ «Diminished antibody response against SARS-CoV-2 Omicron variant after third dose of mRNA vaccine in kidney transplant recipients» (en anglès). , 06-01-2022, pàg. 2022.01.03.22268649. DOI: 10.1101/2022.01.03.22268649.
  13. ↑ «How Effective Are COVID-19 Vaccines Against Omicron?» (en anglès). Healthline, 07-01-2022. Arxivat de l'original el 16 January 2022. [Consulta: 17 gener 2022].
  14. ↑ Parekh, Marcus; Platt, Poppie; Team, Global Health Security; Barnes, Joe «Coronavirus latest news: EU suspends all flights to southern Africa over omicron Covid variant fears» (en anglès). The Telegraph, 26-11-2021. ISSN: 0307-1235 [Consulta: 28 novembre 2021].
  15. ↑ Patel, Vimal «How Omicron, the New Covid-19 Variant, Got Its Name» (en anglès). The New York Times, 27-11-2021. ISSN: 0362-4331 [Consulta: 28 novembre 2021].
  16. ↑ «Lineage B.1.1.529». PANGOLIN, 19-12-2021. Arxivat de l'original el 20 desembre 2021.
  17. ↑ 17,0 17,1 17,2 «What is ‘stealth Omicron’? The rise of the subvariant is alarming some scientists who say it needs its own Greek letter». Fortune, 21-01-2022 [Consulta: 23 gener 2022].
  18. ↑ «En subvariant af omikron, BA.2, udgør nu knap halvdelen af alle danske omikrontilfælde» (en danès). Statens Serum Institut, 19-01-2022. Arxivat de l'original el 20 January 2022. [Consulta: 20 gener 2022].
  19. ↑ 19,0 19,1 «Scientists find 'stealth' version of Omicron that may be harder to track». www.theguardian.com, 07-12-2021.
  20. ↑ «Stealth Omicron: What is The Fast Spreading Omicron BA.2 Sub-Variant That Can Escape RT-PCR Test?». india.com, 23-01-2022.
  21. ↑ 21,0 21,1 21,2 «Government scientists monitoring new BA.2 variant of Omicron». Yahoo News, 21-01-2022 [Consulta: 21 gener 2022].
  22. ↑ «Variant-PCR-testen (tidl. Delta-PCR-testen)» (en danish). Statens Serum Institut, 21-12-2021. Arxivat de l'original el 7 febrer 2021.
  23. ↑ «SARS-CoV-2の変異株B.1.1.529系統（オミクロン株）について（第６報）» (en japanese). National Institute of Infectious Diseases (Japan), 14-01-2022. Arxivat de l'original el 20 gener 2022. [Consulta: 24 gener 2022].
  24. ↑ «Delta Variant Report». outbreak.info (Scripps Research), 13-12-2021. Arxivat de l'original el 19 desembre 2021.
  25. ↑ «BA.1 Lineage Report». outbreak.info (Scripps Research), 19-12-2021. Arxivat de l'original el 16 desembre 2021.
  26. ↑ «BA.2 Lineage Report». outbreak.info (Scripps Research), 21-01-2022. Arxivat de l'original el 13 December 2021. [Consulta: 21 gener 2022].
  27. ↑ «COVID-19 variants identified in the UK». UK Health Security Agency, 21-01-2022. Arxivat de l'original el 23 January 2022. [Consulta: 21 gener 2022].
  28. ↑ «Lineage BA.3». PANGOLIN, 25-01-2022.
  29. ↑ «BA.3 Lineage Report». outbreak.info (Scripps Research), 19-12-2021. Arxivat de l'original el 20 desembre 2021.
  30. ↑ «There's a new version of omicron but so far it doesn't appear to be more dangerous». , 25-01-2022 [Consulta: 25 gener 2022].
  31. ↑ «Ny Omikron-variant tager over i Danmark - det ved vi om den» (en danès). TV2, 21-01-2022 [Consulta: 21 gener 2022].
  32. ↑ «COVID-19 Ukerapport – uke 2» (en noruec). Norwegian Institute of Public Health, 19-01-2022. Arxivat de l'original el 27 January 2022. [Consulta: 25 gener 2022].
  33. ↑ Melody Schrieber «The scientist in Botswana who identified omicron was saddened by the world's reaction». Goats and Soda. NPR, 16-12-2021 [Consulta: 17 desembre 2021].
  34. ↑ «Inside the South African lab that discovered Omicron». Africanews, 09-12-2021 [Consulta: 17 desembre 2021].
  35. ↑ «Omicron becomes dominant variant in South Africa». The Guardian, 02-12-2021.
  36. ↑ «SARS-CoV-2 Sequencing Update 1 December 2021». South African National Institute for Communicable Diseases. Arxivat de l'original el 1 desembre 2021.
  37. ↑ Lambrecht, Pieter «Wat weten we al over de nieuwe coronavariant, de omikron?» (en dutch). De Tijd [Belgium], 29-11-2021.
  38. ↑ Philip Whiteside «COVID-19: how the spread of Omicron went from patient zero to all around the globe». Sky News, 30-11-2021 [Consulta: 17 desembre 2021].
  39. ↑ «Enhancing Readiness for Omicron (B.1.1.529): Technical Brief and Priority Actions for Member States». WHO, 17-12-2021. [Consulta: 19 desembre 2021].
  40. ↑ «Omicron Probably In Most Countries, Spreading At Unprecedented Rate: WHO». NDTV, 15-12-2021.
  41. ↑ Assessment of the further emergence and potential impact of the SARS-CoV-2 Omicron variant of concern in the context of ongoing transmission of the Delta variant of concern in the EU/EEA, 18th update (Technical report). Stockholm: European Centre for Disease Prevention and Control. 15 desembre 2021.

Vegeu també

Obtingut de «https://ca.wikipedia.org/w/index.php?title=Variant_Òmicron_del_SARS-CoV-2&oldid=29431753»