Hom creu que el nom del poble deriva de la paraula en basczihaurri (dialectalment zior), que és el nom d'una planta que abundava a la zona saüc menor o yezgo (Sambucus ebulus); del sufix abundancial -di, que sol acompanyar noms de plantes i de l'article -a; per tant tindria el significat de el saüquer. Aquesta etimologia és en qualsevol cas discutible, encara que si sembla que el nom del poble prové de l'euskera.
En temps de Joan II la vila va prendre gran importància, ja que va ser creat el Senyoriu de Ziordia. Cap als anys 1575 – 1576, la vila es va veure embolicada en sonats processos de bruixeria.
Antiga fàbrica de llenceria La Burundesa, de Tomás Galbete, amb Ziordia al fons.
La indústria moderna que va començar a desenvolupar-se al llarg dels anys 60, la proximitat de nuclis industrials com Altsasu i Olazagutia, així com el pas proper de la carretera nacional a Vitòria ha afavorit el desenvolupament del municipi.