El Consell Comarcal de la Cerdanya és l'òrgan d'autogovern de la comarca de la Cerdanya. La seu del consell es troba a la capital comarcal, Puigcerdà. El consell està format per 19 consellers des de la seua fundació, els quals trien per majoria simple al president de l'ens. L'actual President des del 6 d'agost de 2021 n'és n'Isidre Chia i Trilles, de Junts per Catalunya (JxCAT).
L'origen de la institució es remunta a l'any 1983 quan s'aprovà la llei d'alta muntanya, sobre la qual pocs anys després, el 1985, s'establí el Consell de Muntanya de la Cerdanya. Amb l'aprovació el 4 d'abril de 1987 de la llei sobre l'organització comarcal de Catalunya es creà l'any 1988 l'actual Consell Comarcal de la Cerdanya. El Consel Comarcal de la Cerdanya es va fundar, com tots els de Catalunya, sota l'empar de la llei 6/1987 de creació del consells comarcals, posteriorment modificada el 2003 (decret 4/2003).[1]
L'actual seu del Consell Comarcal de la Cerdanya des de l'any 1995 és la Torre Viladomiu, també coneguda com a "Casa Fabra", la qual va ser entre els anys 2001 i 2003, sent inaugurada el mateix any pel conseller en cap de la Generalitat de Catalunya, Artur Mas i Gavarró. Anteriorment, la seu es trobava a un pis del carrer d'Espanya de Puigcerdà, que havia estat seu des de 1985 dels Consell de Muntanya i posteriorment de l'ens comarcal.[2]