Variant Delta del SARS-CoV-2
La variant Delta, també coneguda com a llinatge B.1.617.2, és una variant del llinatge B.1.617 del SARS-CoV-2, una variant preocupant del SARS-CoV-2,[1] el virus que provoca la COVID-19. Es va detectar per primera vegada a l'Índia a finals del 2020.[2][3] L'Organització Mundial de la Salut (OMS) va anomenar-la variant Delta el 31 de maig de 2021.[4]
Té mutacions en el gen que codifica la proteïna S del SARS-CoV-2[5] causant les substitucions T478K, P681R i L452R,[6] que se sap que afecten la transmissibilitat del virus, així com si pot ser neutralitzat per anticossos per variants circulants prèviament del virus COVID-19.[7] Public Health England (PHE) al maig del 2021 va observar que les taxes d'atac secundari eren un 51-67% més altes que la variant Alfa.[8]
El 7 de maig de 2021, PHE va canviar la seva classificació del llinatge B.1.617.2 d'una variant sota investigació (VUI) a una variant preocupant (VOC) basada en una avaluació de la transmissibilitat que era almenys equivalent a B.1.1.7 (Alfa[9]de la SAGE del Regne Unit que utilitza dades de maig va estimar una possibilitat "realista" de ser un 50% més transmissible.[10] L'11 de maig de 2021, l'OMS també va classificar aquest llinatge COV i va dir que mostrava evidències d'una major transmissibilitat i una neutralització reduïda. El 15 de juny de 2021, els Centres per al Control i Prevenció de Malalties (CDC) van declarar Delta una variant preocupant.[11]
Es creu que la variant és en part responsable de la segona onada de pandèmia de l'Índia a partir del febrer de 2021.[12][13][14] Posteriorment, va contribuir a una tercera onada a Fiji, el Regne Unit[15][16][17] i Sud-àfrica,[18] i l'OMS va advertir el juliol de 2021 que podria tenir un efecte similar en altres llocs d'Europa i Àfrica.[19][18] A finals de juliol també havia impulsat un augment de les infeccions diàries a parts d'Àsia,[20] Estats Units,[21] i Austràlia.[22]
El 24 d'agost de 2021, la variant s'havia estès a 163 països,[23] i l'OMS va indicar que s'estava convertint en la soca dominant a nivell mundial.[24]
Perfil genètic
[modifica]Referències
[modifica]- ↑ «Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK». , 15-04-2021. Aquest article incorpora text publicat sota l'Open Government Licence britànica v3.0:
- ↑ «Tracking of Variants». GISAID, 26-04-2021.
- ↑ «Expert reaction to cases of variant B.1.617 (the 'Indian variant') being investigated in the UK». Science Media Centre.
- ↑ «Covid: WHO renames UK and other variants with Greek letters». BBC News, 31-05-2021.
- ↑ Shang, Jian; Yushun, Wan; Lou, Chuming; Ye, Gang; Geng, Qibin; Auerbach, Ashley; Fang, Li «Cell entry mechanisms of SARS-CoV-2». Proceedings of the National Academy of Sciences, 117, 21, 2020, pàg. 11727–11734. DOI: 10.1073/pnas.2003138117. PMC: 7260975. PMID: 32376634.
- ↑ «expert reaction to VUI-21APR-02/B.1.617.2 being classified by PHE as a variant of concern», 07-05-2021.
- ↑ Starr, Tyler N.; Greaney, Allison J.; Dingens, Adam S.; Bloom, Jesse D. «Complete map of SARS-CoV-2 RBD mutations that escape the monoclonal antibody LY-CoV555 and its cocktail with LY-CoV016». Cell Reports Medicine, 2, 4, 4-2021, pàg. 100255. DOI: 10.1016/j.xcrm.2021.100255. PMC: 8020059. PMID: 33842902.
- ↑ «SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England» (en anglès) p. 8, 19-06-2021.Aquest article incorpora text publicat sota l'Open Government Licence britànica v3.0:
- ↑ «Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK», 07-05-2021. Arxivat de l'original el 7 maig 2021. Aquest article incorpora text publicat sota l'Open Government Licence britànica v3.0:
- ↑ «Is The Variant From India The Most Contagious Coronavirus Mutant On The Planet?». NPR, 14-05-2021. cited «Eighty-ninth SAGE meeting on COVID-19, 13 May 2021 (Held via Video Teleconference)». UK Government, 13-05-2021.
- ↑ «06/15/2021: Lab Advisory: CDC Classifies SARS-CoV-2 Variant B.1.617.2 (Delta) a Variant of Concern». CDC, 15-06-2021.
- ↑ WHO labels a Covid strain in India as a 'variant of concern' — here's what we know, CNBC, 11 May 2021.
- ↑ "WHO says India Covid variant of 'global concern", BBC News, 11 May 2021.
- ↑ "India's second COVID-19 wave", The Wire Science, 22 April 2021.
- ↑ Mishra, Swapnil; Mindermann, Sören; Sharma, Mrinank; Whittaker, Charles; Mellan, Thomas A.; Wilton, Thomas; Klapsa, Dimitra; Mate, Ryan; Fritzsche, Martin «Changing composition of SARS-CoV-2 lineages and rise of Delta variant in England» (en anglès). EClinicalMedicine, 39, 01-09-2021. DOI: 10.1016/j.eclinm.2021.101064. ISSN: 2589-5370. PMID: 34401689.
- ↑ Callaway, Ewen «Delta coronavirus variant: scientists brace for impact» (en anglès). Nature, 595, 7865, 22-06-2021, pàg. 17–18. DOI: 10.1038/d41586-021-01696-3. PMID: 34158664.
- ↑ Rob Picheta. «Britain thinks it can out-vaccinate the Delta variant. The world isn't so sure», 30-06-2021.
- ↑ 18,0 18,1 «Health service buckling as third coronavirus wave fuelled by Delta variant sweeps across South Africa» (en anglès), 04-07-2021.
- ↑ Ellyatt, Holly. «New Covid wave could be imminent as delta variant sweeps Europe, WHO says» (en anglès), 01-07-2021.
- ↑ «Delta variant: Which Asian countries are seeing rising cases?» (en anglès). BBC News, 19-07-2021.
- ↑ «US in 'another pivotal moment' as Delta variant drives surge in Covid cases» (en anglès), 23-07-2021.
- ↑ «New Zealand suspends quarantine-free travel bubble with Australia» (en anglès), 23-07-2021.
- ↑ «Weekly epidemiological update on COVID-19 - 24 August 2021», 24-08-2021.
- ↑ «WHO Director-General's opening remarks at the 8th meeting of the IHR Emergency Committee on COVID-19 - 14 July 2021». WHO, 14-07-2021. Arxivat de l'original el 15 juliol 2021. «The Delta variant is now in more than 111 countries and we expect it to soon be the dominant COVID-19 strain circulating worldwide, if it isn’t already.»
- ↑ Spike Variants: Delta variant, aka B.1.617.2 24 June 2021, covdb.stanford.edu, accessed 1 July 2021